海南植物内生拟盘多毛孢的多样性及拟盘多毛孢属分子系统学研究

论文摘要

拟盘多毛孢是一类广泛存在的真菌,在已报道的200多种中,大多数都是植物病原拟盘多毛孢。自Espinosa-Garcia et al.（1990）首次报导枯斑拟盘多毛孢（Pestalotiopsis funerea）是红杉（Sequoia sempervirens （D.Don） Endl.）的重要内生真菌后,已有46种拟盘多毛孢被报道是内生真菌。 作为国家自然科学基金项目“植物内生拟盘多毛孢资源、多样性及分类学研究”和“拟盘多毛孢属及邻近属分子系统学研究”的一部分,本论文以海南棕榈科、红树科、山榄科等常见热带木本植物为对象,开展内生拟盘多毛孢资源、多样性的调查;同时选取代表菌株的rDNAITS、28S和beta-tubulin基因进行序列测定,通过分析多个基因片段形成的系统发育树并结合形态学的方法探讨拟盘多毛孢属及其与近缘属的系统学关系。 主要研究结果如下: 1 海南植物内生拟盘多毛孢的种类鉴定 2004-2005年对海南棕榈科、红树科、罗汉松科和山榄科等常见热带植物的内生拟盘多毛孢资源进行了调查,从42科95种植物分离到567个拟盘多毛孢菌株,鉴定了内生拟盘多毛孢43种,包括1个新种,6个新组合和16个内生拟盘多毛孢新记录种。 1.1 新种和新组合种 1) 海南拟盘多毛孢（新种） Pestalotiopsis hainanensis A.R.Liu, T. Xu et L. D. Guo. sp. nov. Fungal Diversity,2006.（待发表） 在PDA培养基+康乃馨叶片上,分生孢子5细胞,19～22×5～6μm;中间三色胞淡色,上2色胞红棕色,第3色胞颜色稍浅,橄榄色,或中间色胞颜色略深,长13～1 5μm;顶端无色胞圆锥形,具顶端附属丝1～3根,长3～10μm;基部无色胞圆锥形;基部附属丝多数缺乏。孢子成熟时,色胞和基部无色胞表面有颗粒状的突起。PDA培养基上,菌落白色絮状,菌落背面无色素沉积,不具轮纹。分生孢子堆黑色,颗粒较小,排列密集。用本种及其他拟盘多毛孢rDNA的ITS （ITS1,5.8S,ITS2）序列和微管蛋白基因序列（tub2 gene）分析显示,P.hainanensis在分子系统树上形成独立的分枝。 2) 二色拟盘多毛孢（新组合种） Pestalotiopsis bicolor （Ellis & Everhart） A. R. Liu, T. Xu et L. D. Guo. comb. nov.

论文目录

• 致谢
• 中文摘要
• Abstract
• 第一章 文献综述
• 1 植物内生真菌
• 1.1 植物内生真菌的定义
• 1.2 内生真菌的生物多样性
• 1.3 植物内生真菌的生物学和生态学作用
• 1.3.1 促进植物生长
• 1.3.2 增强宿主植物抗逆境的能力
• 1.3.3 在植物种群演替中起重要的作用
• 1.4 环境因子对植物内生真菌的影响
• 1.4.1 对其生物多样性的影响
• 1.4.2 对内生菌生长代谢的影响
• 1.5 植物内生真菌研究存在的问题与展望
• 2 热带植物内生真菌
• 2.1 概况
• 2.2 热带地区植物真菌资源及多样性
• 2.3 热带地区内生真菌的主要类群
• 2.4 红树林内生真菌
• 2.5 展望
• 3 植物内生拟盘多毛孢
• 3.1 植物内生拟盘多毛孢及其宿主
• 3.2 内生拟盘多毛孢的定殖和分布
• 3.3 内生拟盘多毛孢的宿主选择性和宿主专一性
• 4 拟盘多毛孢属的分类学及分子系统学研究
• 4.1 拟盘多毛孢属的分类
• 4.1.1 拟盘多毛孢属的历史沿革
• 4.1.2 关于拟盘多毛孢种的划分
• 4.1.3 拟盘多毛孢属真菌无性型与有性型之间的联系
• 4.1.4 我国拟盘多毛孢的研究概况
• 4.2 拟盘多毛孢属的分子系统学研究
• 4.2.1 分子系统学的定义
• 4.2.2 分子系统学的基本方法
• 4.2.3 我国真菌分子系统学的研究进展
• 4.2.4 分子系统学方法在拟盘多毛孢属上的应用
• 4.2.4.1 可溶性蛋白电泳在拟盘多毛孢鉴定上的应用
• 4.2.4.2 DNA序列在拟盘多毛孢及相关属分类上的应用
• 4.2.4.3 DNA序列在拟盘多毛孢属分类上的应用
• 4.3 存在的问题
• 5 本研究的目的
• 第二章 海南植物内生拟盘多毛孢的种类鉴定
• 1 材料与方法
• 1.1 取样
• 1.2 内生拟盘多毛孢的分离与鉴定
• 2 结果
• 2.1 海南43种内生拟盘多毛孢
• 2.2 新种和新组合种
• 3 讨论
• 3.1 样本的采集和分离
• 3.2 内生拟盘多毛孢的鉴定
• 3.3 海南内生拟盘多毛孢资源
• 第三章 植物内生拟盘多毛孢的生态分布
• 1 材料与方法
• 1.1 取样
• 1.2 分离方法
• 1.3 生态多样性分析方法
• 2 结果
• 2.1 常见棕榈科植物内生拟盘多毛孢的分布
• 2.1.1 棕榈科植物叶片内生拟盘多毛孢定殖率的比较
• 2.1.2 不同年份棕榈科植物叶片内生拟盘多毛孢定殖率的比较
• 2.1.3 不同采样地点棕榈科植物叶片内生拟盘多毛孢定殖率的比较
• 2.2 常见红树林植物内生拟盘多毛孢的分布
• 2.2.1 常见红树林植物内生拟盘多毛孢定殖率的比较
• 2.2.2 常见红树林植物不同器官内生拟盘多毛孢的定殖率比较
• 2.3 常见山榄科植物内生拟盘多毛孢的分布
• 2.4 罗汉松科植物内生拟盘多毛孢的生态分布
• 2.4.1 罗汉松科植物内生拟盘多毛孢的定殖率比较
• 2.4.2 采样时间对罗汉松科植物内生拟盘多毛孢的定殖率的影响
• 2.5 海南植物内生拟盘多毛孢物种的多样性
• 2.5.1 不同宿主植物内生拟盘多毛孢的物种组成
• 2.5.2 不同宿主植物内生拟盘多毛孢的多样性分析
• 2.5.3 不同宿主植物内生拟盘多毛孢的物种相似性分析
• 3 分析与讨论
• 3.1 内生拟盘多毛孢的定殖
• 3.2 内生拟盘多毛孢的宿主选择性
• 3.3 内生拟盘多毛孢的多样性指数
• 第四章 拟盘多毛孢属与近缘属的分子系统学关系
• 1 材料与方法
• 1.1 供试菌种
• 1.2 方法
• 1.2.1 基因组DNA提取
• 1.2.2 PCR扩增
• 1.2.3 PCR产物测序
• 1.2.4 DNA序列数据分析
• 2 结果与分析
• 2.1 分子系统树（邻位连接树和 MP树）的建立
• 2.2 Pestalotiopsis属及其近缘属分类特征的界定
• 2.3 有性型与无性型的联系
• 2.4 Pestalotiopsis属与近缘属之间的亲缘关系
• 3 讨论
• 3.1 Pestalotiopsis属及其近缘属分类特征的界定
• 3.2 Pestalotiopsis属与近缘属之间的亲缘关系
• 3.3 用分子系统学方法建立拟盘多毛孢属无性型与有性型的联系
• 3.4 根据形态学和以分子系统学的特征建立 Pestalotiopsis属及其近缘属的分类检索表及属的重新界定
• 第五章 拟盘多毛孢属的分子系统学研究
• 1 材料和方法
• 1.1 供试菌种
• 1.2 方法（与第四章同）
• 1.3 DNA序列数据分析
• 2 结果与分析
• 2.1 分子系统树（邻位连接树和 MP树）的建立
• 2.2 拟盘多毛孢属系统发育树的结构
• 2.3 拟盘多毛孢属分子系统树的分支与分生孢子形态特征的关系
• 2.4 拟盘多毛孢分生孢子形态学特征分类学意义评价
• 2.5 ITS、beta-tubulin基因和28S基因在分析拟盘多毛孢属种间关系中的作用
• 3 讨论
• 3.1 拟盘多毛孢分生孢子的形态特征在分类中的地位
• 3.2 以形态特征和分子系统学特征相结合界定拟盘多毛孢属的种
• 3.3 ITS、beta-tubulin基因和28S基因在分析拟盘多毛孢属种间关系中的作用
• 参考文献
• 附录:攻读博士学位期间发表和录用的论文