论文摘要
本研究以DGAT1基因作为猪胴体和肉质性状的候选基因,对5个地方猪种（宁乡猪、桃源黑猪、大围子猪、沙子岭猪、五指山猪）和3个外来猪种（杜洛克猪、大白猪、长白猪）的该基因A3122G、C7545T、C7604T和3’-UTR共4个位点进行了研究,并分析了A3122G、C7545T和3’-UTR位点对杜洛克猪、大白猪和长白猪部分胴体和肉质性状的影响。主要结果如下:1、运用生物信息学的方法,充分利用公共数据库资源对猪的DGAT1基因进行候选SNPs的筛选,共筛选到78个候选SNPs,证实了A3122G、C7545T、C7604T 3个SNPs位点的存在。2、利用引物上导入酶切位点的方法,采用dcaps软件设计一条引入一个错配碱基的引物,将引物C7604T中导入TagⅠ酶切位点。PCR-RFLP-TagⅠ分析表明,在该位点上,由C和T两个等位基因产生了CC、CT和TT三种基因型,其中C等位基因在所有地方猪种和外来猪种中都占绝对优势,大围子猪C基因频率最高（0.9605）,五指山猪最低（0.8462）,CC型为所有猪种的优势基因型,TT型在各猪种中分布很低,其中在宁乡猪和大围子猪中未检测到TT型。所有猪种多态信息含量较低（PIC＜0.25）,遗传变异较小。另外本试验成功的将此SNPs转化为dCAPs标记。3、A3122G位点的PCR-RFLP-AvaⅡ（Eco47Ⅰ）证实,在该位点上,由A和G两个等位基因产生了AA、AG和GG三种基因型,其中A基因在外来猪种中为优势等位基因,AA型为优势基因型,而在地方品种中G基因为优势等位基因,GG型为优势基因型。在大白猪中AA型背膘厚比GG型降低了19.18%（p＜0.05）,杜洛克猪和长白猪中AA型背膘厚低于GG型,但未达到显著水平;杜洛克猪和大白猪AA型瘦肉率均显著高于GG型,分别提高了4.66%和3.28%（p＜0.05）;在脂肪率上,杜洛克猪和长白猪AA型脂肪率显著低于GG型,分别降低了29.55%和26.77%（p＜0.05）;在大理石纹等级上,杜洛克猪AA型大理石纹等级显著低于AG和GG型（p＜0.05）;大白猪AA型贮存损失低于GG型32.55%（p＜0.05）。从总体上看,杜洛克猪、大白猪和长白猪背膘厚、脂肪率、大理石纹等级和贮存损失都表现出AA＜AG＜GG的趋势。因此,可以初步推测该位点A等位基因很可能是猪胴体和肉质性状的一个有利等位基因,增加A等位基因在群体中的频率,将有利于降低猪的背膘厚和脂肪率,提高瘦肉率。4、C7545T位点PCR-RFLP-HpaⅡ分析表明,在该位点上,由C和T两个等位基因产生了CC、CT和TT三种基因型,其中C基因在外来猪种中为优势等位基因,而T基因在地方猪种中为优势等位基因。杜洛克猪和大白猪CC型背膘厚显著低于TT型,分别降低了12.75%和10.93%（p＜0.05）,长白猪CC型背膘厚低于TT基因型,但未达显著水平;大白猪和长白猪CC型瘦肉率显著高于TT型,分别提高了4.91%和2.37%（p＜0.05）;在脂肪率上,杜洛克猪和长白猪CC基因型脂肪率显著低于TT型（p＜0.05）,分别降低了30.13%和23.88%（p＜0.05）;在大理石纹等级上,杜洛克猪、大白猪和长白猪CC型大理石纹等级都显著低于TT型（p＜0.05）。从总体上来看,杜洛克猪、大白猪和长白猪都是CC型背膘最薄、瘦肉率最高、脂肪率最低,该位点的C等位基因可能是猪胴体和肉质性状的一个有利等位基因。5、采用PCR-SSCP的方法对猪DGAT1基因3’-UTR进行分析,发现了一个位于第7744bp处由G突变为A的SNPs,该SNPs导致了ECO47Ⅲ酶切位点多态性。该位点上,所有猪种的G和A等位基因频率相差不大。在瘦肉率上,杜洛克猪AG基因型瘦肉率比AA型提高了2.76%（p＜0.05）,大白猪AG型瘦肉率比GG型提高了4.37%（p＜0.05）;在背膘厚上,杜洛克猪和长白猪AG型背膘厚显著低于AA和GG型,在杜洛克猪中AG比AA、GG型分别降低了14.39%和13.95%（p＜0.05）,而在长白猪中AG比AA、GG型分别降低了20.90%和16.47%（p＜0.05）,大白猪AG型背膘厚低于AA和GG型但未达显著水平;在脂肪率上,大白猪和长白猪AG型脂肪率显著低于GG型,分别降低了18.67%和17.55%（p＜0.05）;在大理石纹等级上,大白猪和长白猪AG型大理石纹等级显著低于AA和GG型（p＜0.05）。群体中AG型为优势基因型,由此可以预测AG型有可能是猪胴体和肉质性状的一个有利基因型。本研究结果表明,DGAT1基因有望作为猪的背膘厚、瘦肉率和脂肪率等经济性状的一个候选基因或分子标记,应用于分子标记辅助选择,为优质、高产瘦肉型猪的选育提供一种分子育种途径。6、本试验将所测序列提交GenBank,获得以下登录号:EU251427～28、EU258764～65、EU152052～55、EU151425～26、EU294420～30、EU374632～33:
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