我国部分鹅品种（类群）Myostatin基因SNPs及遗传多样性研究

论文摘要

本研究首次获得家鹅Myostatin基因3′-调控区部分序列（GenBank登录号为DQ291134）以及内含子1全序列（GenBank登录号为DQ355160）,分析了两序列结构特点,并利用GenBank中不同物种Myostatin基因相关的序列信息,初步研明了Myostatin基因cDNA、3′-调控区以及内含子等核苷酸序列对分析物种进化的贡献;在测序的基础上,利用Oligo 6.0和Primer Premier V5.0引物设计软件设计了15对PCR-SSCP引物,首次获得了3个品种鹅Myostatin基因不同区段单核苷酸多态（SNP）特点,初步分析了不同SNPs与扬州鹅（80日龄）、皖西白鹅（110日龄）和五龙鹅（110日龄）的屠体重、胸肌重、胸肌率、腿肌重、腿肌率、全净膛重、全净膛率等屠体性状之间的关系;利用多态性丰富的6个微卫星基因座对雁鹅、皖西白鹅、五龙鹅、扬州鹅、浙东白鹅、兴国灰鹅、四季鹅以及引进品种莱茵鹅等8个家鹅品种（类群）的遗传多样性以及亲缘关系进行了探索。研究结果如下:（1）家鹅Myostatin基因不同区域序列特征为:5′-调控区核苷酸序列的碱基组成中,A+T的比例为63.32%,G+C为36.44%;转录起始点位于第1外显子上游117bp处;转录起始点上游﹣73bp处为CCAAT盒,﹣27bp处有一TATA盒;与GenBank中登录的鹅同一序列的同源性高达99%。同时比对结果发现,在﹣386bp处（T→A）、﹣371bp处（T→G）、﹣176bp处（A→T）、﹣154b处（A→T）、﹣72bp处（C→T）具有待检测的单碱基突变位点。

论文目录

• 中文摘要
• 英文摘要
• 第一章 文献综述
• 1 分子遗传标记技术
• 1.1 RFLP 技术和DNA 指纹技术
• 1.2 RAPD、AFLP 及微卫星
• 1.3 SNP
• 2 Myostatin 基因研究进展
• 2.1 Myostatin 基因的结构与同源性
• 2.2 Myostatin 基因的表达特点
• 2.3 Myostatin 的生物学功能
• 2.4 Myostatin 的应用前景
• 3 家鹅的分类学及研究进展
• 3.1 家鹅的分类学与起源
• 3.2 我国的家鹅品种资源
• 3.3 家鹅基因组特征
• 3.4 家鹅血液蛋白多态性研究进展
• 3.5 家鹅分子生物学研究进展
• 4 本研究的目的和内容
• 第二章 家鹅Myostatin 基因不同区域序列分析
• 1 前言
• 2 材料与方法
• 2.1 试验材料
• 2.2 实验方法
• 2.3 基因序列的碱基组成及聚类分析
• 3 结果
• 3.1 DNA 提取结果检测
• 3.2 PCR 扩增产物及测序结果检测
• 3.3 应用Myostatin 基因的不同区段构建物种间的分子系统进化树
• 4 讨论
• 4.1 家鹅Myostatin 基因PCR 扩增引物的设计
• 4.2 家鹅Myostatin 基因调控区序列分析
• 4.3 应用Myostatin 基因的编码区、非编码区探索物种的系统发育
• 5 结论
• 第三章 家鹅Myostatin 基因SNPs 多态性分析
• 1 前言
• 2 材料与方法
• 2.1 试验材料
• 2.2 实验方法
• 2.3 统计方法
• 3 结果与分析
• 3.1 不同PCR-SSCP 引物优化结果
• 3.2 家鹅Myostatin 基因PCR-SSCP 分析
• 3.3 3品种家鹅Myostatin 基因SNPs 等位基因的基因型频率分布
• 3.4 家鹅Myostatin 基因单核苷酸多态性与生产性能之间的关系
• 4 讨论
• 4.1 引物设计及扩增结果分析
• 4.2 家鹅Myostatin 基因单核苷酸多态性分析
• 4.3 家鹅Myostatin 基因单核苷酸多态性与生产性能之间的关系
• 5 结论
• 第四章 部分鹅品种（类群）微卫星多态性研究
• 1 前言
• 2 材料与方法
• 2.1 实验材料
• 2.2 实验方法
• 2.3 统计方法与分析软件
• 3 结果
• 3.1 DNA 模板检测
• 3.2 PCR 结果及多态性
• 3.3 8个家鹅品种（类群）等位基因及基因频率
• 3.4 基因杂合度（H）及多态信息含量（PIC）
• 3.5 不同家鹅品种（类群）间遗传关系分析
• 4 讨论
• 4.1 真核生物微卫星引物的特异性
• 4.2 不同家鹅品种（类群）等位基因频率
• 4.3 不同家鹅品种（类群）的遗传多样性
• 4.4 不同家鹅品种（类群）亲缘关系分析
• 5 结论
• 参考文献
• 致谢
• 攻读学位期间发表的学术论文及科研情况