系统性红斑狼疮的基因、环境因素以及基因—环境交互作用研究

系统性红斑狼疮的基因、环境因素以及基因—环境交互作用研究

论文摘要

系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)是一多因子遗传相关疾病,遗传因素和环境因素在SLE的发病中都起着重要作用。本次研究采用病例对照研究(case-control study)和单纯病例研究(case-only study)设计,收集来自复旦大学附属中山医院、苏州大学附属第一医院和杭州市第三人民医院的SLE病人176例、对照161例,应用DNA体外扩增—聚合酶链式反应(PolymeraseChain Reaction,PCR)、限制性片段长度多态性(Restriction Fragment LengthPolymorphism,RFLP)等分子生物学技术,在华东地区汉族人群中探讨了环境和遗传因素及基因-环境交互作用与SLE发病及其表型关系。结果如下:一、系统性红斑狼疮环境危险因素研究1.单因素Logistic回归分析表明:冻疮可能是SLE的伴随因素(OR=9.53,95%CI:5.58-16.28),居住环境潮湿(OR=7.85,95%CI:3.23-19.05)、紫外线暴露(OR=3.80,95%CI:1.96-7.36)、光敏感(OR=7.05,95%CI:3.88-12.79)、麻疹病毒(OR=11.95,95%CI:1.60-4.90)、带状疱疹病毒(OR=4.08,95%CI:1.62-10.26)、有害物接触(OR=5.72,95%CI:2.86-11.43)、多食高油脂食物(OR=1.81,95%CI:1.05-3.13)、药物过敏(OR=2.80,95%CI:1.60-4.90)和家族史(OR=76.64,95%CI:10.46-561.36)可能是SLE发病的重要危险因素。2.多因素Logistic回归亦提示,冻疮史、居住环境潮湿、光照后敏感、紫外线暴露史、麻疹史、有害物接触和家族史可能是SLE的相关危险因素,OR值及95%CI分别为7.09(3.71-13.53)、6.59(2.18-19.75)、3.81(1.81-8.02)、2.94(1.21-7.11)、11.96(2.24-63.82)、3.02(1.21-7.53)和49.23(6.28-385.68)。3.对女性研究对象进行多因素Logistic回归分析的结果显示,冻疮、居住环境潮湿、光照后敏感、紫外线暴露史、麻疹史、有害物接触和家族史也是女性发生SLE的危险因素,OR值及95%CI分别为8.00(4.04-15.84)、6.51(1.93-21.92)、3.23(1.49-6.99)、4.31(1.63-11.35)、12.70(2.37-68.22)、2.81(1.09-7.21)和51.76(6.56-408.72)。二、系统性红斑狼疮遗传易感性研究1.PD12位点在病例组和对照组中A/A、A/G和G/G基因型频率差异有统计学意义(χ2=9.049,df=2,P=0.011),以A/A基因型为参照,具有A/G基因型者,其SLE发病风险升高(OR=2.00,95%CI:1.27-3.45),A/G和G/G基因型携带者合并起来的OR为1.84(95%CI:1.19-2.85);病例组和对照组A等位基因和G等位基因频率有显著性差异(χ2=4.273,P=0.039),病例组G等位基因频率高于对照组(28.7%vs 21.7%)。2.PD16位点在病例组和对照组中A/A、A/G和G/G基因型频率差异有统计学意义(χ2=10.094,df=2,P=0.006);以A/A基因型为参照,A/G基因型携带者的SLE发病风险升高(OR=1.70,95%CI:1.08-2.70),G/G基因型携带者的SLE发病风险同样升高(OR=5.16,95%CI:1.43-18.69),A/G和G/G基因型携带者合并起来的OR为1.70(95%CI:1.10-2.62);病例组和对照组A等位基因和G等位基因频率有显著性差异(χ2=8.689,P=0.003),病例组G等位基因频率高于对照组(28.4%vs 18.0%)。3.PD15位点在病例组和对照组中C/C、C/T和T/T基因型频率差异有统计学意义(χ2=16.031,df=2,P=0.000);以C/C基因型为参照,具有C/T基因型者,其SLE发病风险升高(OR=2.48,95%CI:1.59-3.89),C/T和T/T基因型携带者合并起来的OR为2.49(95%CI:1.59-3.89);病例组和对照组C等位基因和T等位基因频率有显著性差异(χ2=12.084,P=0.001),病例组T等位基因频率高于对照组(27.0%vs 15.8%)。4.CD22-BSP位点在病例组和对照组中T/T、A/T和A/A基因型频率差异有统计学意义(χ2=8.085,df=2,P=0.018);以T/T基因型为参照,A/T基因型携带者的SLE发病风险升高(OR=1.98,95%CI:1.20-3.27),A/T和A/A基因型携带者合并起来的OR为1.99(95%CI:1.24-3.20);病例组和对照组T等位基因和A等位基因频率有显著性差异(χ2=4.273,P=0.024),病例组A等位基因频率高于对照组(19.9%vs 13.4%)。5.CD22-Cail位点在病例组和对照组中C/C、C/G和G/G基因型频率差异有统计学意义(χ2=14.137,df=2,P=0.001,):以C/C基因型为参照,C/G基因型携带者的SLE发病风险升高(OR=1.97,95%CI:1.22-3.18),G/G基因型携带者的SLE发病风险同样升高(OR=5.23,95%CI:1.70-16.08),C/G和G/G基因型携带者合并起来的OR为2.27(95%CI:1.44-3.58):病例组和对照组C等位基因和G等位基因频率有显著性差异(χ2=16.140,P=0.000),病例组G等位基因频率高于对照组(27.8%vs 14.9%)。三、基因单倍型分析1.连锁不平衡(linkage disequilibrium)检验应用Haploview4.0软件分别计算PDCD1基因PD12A>G、PD15C>T、PD16G>A位点两两配对连锁不平衡参数和CD22基因CD22-BSP C>G和CD22-Cail T>A位点间的连锁不平衡参数,并进行假设检验,结果发现PDCD1基因各位点间存在微弱LD,CD22两位点间同样存在微弱LD。2.单倍型与SLE的关联分析应用PHASE2.1软件估计了多态位点组成的单倍型并应用SPSS13.0进行关联性检验,结果显示:DCD1基因PD12A>G、PD15C>T、PD16G>A组成的ACA和GTA单倍型频率在病例组与对照组间有显著性差异(P=0.000,P=0.001),GTA单倍型者SLE发病危险增高,ACA和GCA单倍型可能为SLE的保护性单倍型。CD22基因CD22-BSP T>A和CD22-Cail C>G多态位点组成的TC和AG单倍型的频率在病例组与对照组的差异有显著性(P=0.006,P=0.001),TC单倍型对SLE具有保护效应,AG单倍型可能为SLE的危险单倍型,且TC单倍型符合隐性效应模型,AG单倍型符合显性效应模型。四、基因与环境因素在SLE发生中的交互作用1.基因环境因素多因素Logistic回归分析结果显示:遗传因素中,PD12位点、PD15位点和CD22-Cail位点与SLE的关联有统计学意义:环境因素中冻疮史、居住潮湿、光敏感史、紫外线暴露、麻疹史、有害物接触和家族史等7个因素有意义。2.Logistic回归模型中,环境-环境交互作用分析未能发现仟何环境因素间的交互作用;基因-基因交互作用分析未能发现任何基因位点间的交互作用;基因-环境交互作用分析同样未能发现有意义的结果。3.在单纯病例研究中,我们引入对数线性模型,在PDCD1和CD22基因多态位点交互作用的分析中,发现PD12和CD22-Cail位点交互作用有统计学意义(P=0.029),且交互作用系数为正:CD22-BSP和CD22-Cail位点交互作用有统计学意义(P=0.000),交互作用系数为正。4.在分别分析PDCD1基因和CD22基因多态位点和环境危险因素交互作用时,未能发现有意义的结果。5.在基因与SLE表型的关系研究中,发现PD12位点与皮肤表现具有相关性(χ2=5.878,P=0.015),SLE病人中PD12位点A/G+G/G基因型携带者出现皮肤表现的频率更低(OR=0.19,95%CI:0.05-0.73);PD12位点与神经系统异常表现具有相关性(χ2=6.757,P=0.009),SLE病人中PD12位点A/G+G/G基因型携带者出现皮肤表现的频率更低(OR=0.33,95%CI:0.14-0.76):CD22-Cail位点与皮肤表现具有相关性(χ2=5.427,P=0.020),SLE病人中CD22-Cail位点C/G+G/G基因型携带者出现皮肤表现的频率更高(OR=4.86,95%CI:1.29-18.38)。6.在环境与SLE表型的关系研究中,光敏感史与皮肤表现具有相关性(χ2=5.825,P=0.016),光敏感史可导致SLE病人中出现皮肤表现的频率升高(OR=12.52,95%CI:1.61-97.45);冻疮史与关节异常表现具有相关性(χ2=4.195,P=0.041),冻疮史可导致SLE病人中出现关节异常表现的频率升高(OR=1.94,95%CI:1.03-3.67);麻疹史与关节异常表现具有相关性(χ2=6.279,P=0.012),麻疹史可导致SLE病人中出现关节异常表现的频率升高(OR=5.03,95%CI:1.42-17.78);带状疱疹史与浆膜炎表现具有相关性(χ2=4.185,P=0.041),带状疱疹史可导致SLE病人中出现浆膜炎表现的频率升高(OR:3.04,95%CI:1.05-8.85);紫外线暴露史与肾脏损害表现具有相关性(χ2=8.528,P=0.003),紫外线暴露史可导致SLE病人中出现肾脏损害表现的频率升高(OR=2.99,95%CI:1.43-6.22);家族史与肾脏损害表现具有相关性(χ2=9.111,P=0.003),有家族史的SLE病人中出现肾脏损害表现的频率升高(OR=2.81,95%CI:1.44-5.49);紫外线暴露史与神经系统表现具有相关性(χ2=3.969,P=0.046),紫外线暴露史可导致SLE病人中出现神经系统表现的频率升高(OR=2.46,95%CI:1.02-5.95);有害物接触史与神经系统表现具有相关性(χ2=8.156,P=0.004),有害物接触史可导致SLE病人中出现神经系统表现的频率升高(OR=3.40,95%CI:1.47-7.86);油脂多食物与sm抗体和RNP抗体表现具有相关性(χ2=4.997,P=0.025:χ2=9.448,P=0.002),油脂多食物可导致SLE病人中出现sm抗体和RNP抗体的频率降低(OR=0.44,95%CI:0.22-0.91;OR=0.14,95%CI:0.04-0.49);光敏感史与RNP抗体表现具有相关性(χ2=5.780,P=0.016),光敏感史可导致SLE病人中出现RNP抗体的频率升高(OR=2.41,1.18-4.93):有害物接触史与补体(C3、C4)表现具有相关性(χ2=3.815,P=0.051),有害物接触史可导致SLE病人中出现补体(C3、C4)降低的比例升高(OR=2.00,95%CI:1.00-4.12)。7.在基因-环境因素交互作用与SLE表型关系研究中,结果显示与相关表型有关的基因、环境间的交互作用均无统计学意义。综上所述,环境、遗传因素均与SLE及其表型存在关联性,提示环境、遗传因素均可能对SLE的发生以及SLE相关表型的出现起作用,基因-基因间的交互作用可能与SLE相关表型存在相关性,但环境-环境以及基因-环境交互作用对于SLE及其表型的作用尚需做进一步的研究探讨。

论文目录

  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 前言
  • 第一部分 系统性红斑狼疮环境危险因素研究
  • 对象与方法
  • 结果
  • 讨论
  • 小结
  • 图表
  • 第二部分 系统性红斑狼疮遗传易感性研究
  • 材料与方法
  • 结果
  • 讨论
  • 小结
  • 图表
  • 第三部分 基因单倍型分析
  • 材料与方法
  • 结果
  • 讨论
  • 小结
  • 图表
  • 第四部分 基因与环境因素在系统性红斑狼疮
  • 材料与方法
  • 结果
  • 讨论
  • 小结
  • 图表
  • 总结
  • 参考文献
  • 致谢
  • 附录一 电泳图
  • 附录二 综述
  • 附录三 硕士期间发表的论文
  • 相关论文文献

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