SLC22A3-LPAL2-LPA基因单核苷酸多态性与冠心病相关性研究

论文摘要

目的:研究跨越SLC22A3-LPAL2-LPA基因的4个SNP位点在我国西南地区汉族人群中的基因型频率、等位基因频率及其组成的单倍型的分布特征,以求明确这些SNP位点及其组成的单倍型与CAD发生发展的关系。方法:（1）利用美国国家生物信息中心（NCBI）的SNP数据库获得各基因相应SNP位点的基本序列信息,利用Primer Premier5.0软件设计引物序列,而后利用NCBI在线软件Blast检验所设计引物的扩增特异性。（2）利用PCR-SSCP及核苷酸测序技术检测CAD组和对照组4个SNP位点的基因型构成。（3）利用SPSS17.0统计软件分析CAD组及对照组各个位点的基因型和等位基因构成及其与CAD发生发展的关系;利用在线分析软件SHEsis分析其组成的单倍型频率及其与CAD发生发展的关系。结果:（1）SLC22A3基因SNP rs2048327（A/G）位点检测到两种基因型,AA型和AG型,GG型未检出;两种检出基因型在CAD组中的频率分别为60.6%、39.4%,在对照组中的频率分别为77.7%、22.3%,组间存在统计学差异（p=0.001）,CAD组和对照组中少见等位基因G的频率分别为19.7%、11.1%,组间亦有统计学差异（p=0.002）,经Logistic回归分析去除混杂因素的影响后组间差异依然有统计学意义（p=0.029）。（2）LPAL2基因SNP rs3127599（A/G）位点检测到两种基因型,GG型和AG型,两种基因型在CAD组中的频率分别为84.9%、15.1%,在对照组中的频率分别为73.5%、26.5%,组间存在统计学差异（p=0.011）,AA基因型未检出;CAD组和对照组中少见等位基因A的频率分别为7.6%、13.2%,组间亦有统计学差异（p=0.017）,经Logistic回归分析去除混杂因素的影响后等位基因频率组间差异依然有统计学意义（p=0.016）。（3）LPA基因SNP rs7767084（C/T）位点检测到CC、CT、TT 3种基因型,这3种基因型在CAD组中的频率分别为4.2%、24.3%、71.5%,在对照组中的频率分别为12.7%、36.1%、51.2%,组间存在统计学差异（p=0.000）;CAD组和对照组中少见等位基因C的频率分别为16.4%、30.7%,组间亦有统计学差异（p=0.000）,经Logistic回归分析去除混杂因素的影响后等位基因频率组间差异依然有统计学意义（p=0.000）。（4）LPA基因SNP rs10755578（C/G）位点检测到GG和CG两种基因型,CAD组中的频率分别为63.0%、37.0%,对照组中的频率分别为74.7%、25.3%,组间存在统计学差异（p=0.022）,CC型未检出;CAD组和对照组中少见等位基因C的频率分别为18.5%、12.7%,组间亦有统计学差异（p=0.038）,但经Logistic回归分析去除混杂因素的影响后该位点组间差异消失（p=0.077）。（5）SLC22A3基因SNP rs2048327（A/G）、LPAL2基因SNP rs3127599（A/G）、LPA基因SNP rs7767084（C/T）位点各基因型间的TC、TG、HDL、LDL均无统计学差异（P>0.05）。（6）rs2048327、rs3127599、rs7767084,3个位点构成的单倍型（AGC、GGC、AGT、GGT）组间差异有统计学意义（P<0.05）。结论:SLC22A3基因SNP rs2048327（A/G）、LPAL2基因SNP rs3127599（A/G）和LPA基因SNP rs7767084（C/T）位点可能与中国西南地区汉族人群的CAD发生相关,其中携带GGC、AGT、GGT单倍型的人群罹患CAD的风险可能较正常人高。

论文目录

• 符号说明
• 摘要
• ABSTRACT
• 前言
• 1 材料与方法
• 1.1 材料
• 1.2 方法
• 1.3 统计分析
• 2 结果
• 2.1 研究对象的基本临床特征
• 2.2 SLC22A3-LPAL2-LPA 基因4 个SNP 位点检测结果
• 2.3 多态性分析
• 2.4 Logistic 分析
• 2.5 单倍型分析
• 2.6 基因多态性与血脂水平
• 3 讨论
• 3.1 SLC22A3 基因与CAD 易患性的关系
• 3.2 LPAL2 基因与CAD 易患性的关系
• 3.3 LPA 基因与CAD 易患性的关系.
• 3.4 单倍型分析
• 结论
• 参考文献
• 附插图
• 文献综述
• 参考文献
• 致谢
• 攻读学位期间发表论文