鸡Myostatin基因和IGF-Ⅰ基因单核苷酸多态性及其对屠体性状的相关分析

论文摘要

本研究以肌肉生长抑制素（Myostatin）基因和胰岛素样生长因子—1（IGF—Ⅰ）基因为拟影响鸡的屠体性状的候选基因，以180只3个品系（即C系、A系和B系）的温岭草鸡为材料，采用PCR—RFLP方法测定了Myostatin基因外显子1的2个酶切座位和IGF—Ⅰ基因的6个酶切座位，同时分析了它们对鸡屠体性状存在的可能影响。Myostatin基因中：Bsh1236Ⅰ识别G（2100）A突变，产生MN和NN两种基因型；MspⅠ识别G（2109）A突变，产生AA、AB和BB三种基因型；联合2个座位分析出现了5种基因型。Hardy—Weinberg平衡的x2检验显示每个家系及整个群体在Bsh1236Ⅰ和MspⅠ座位均处于极显著（P≤0.01）不平衡状态。方差分析显示不同基因型的屠宰率有显著或极显著的差异（P≤0.01或0.01＜P≤0.05）。多重比较显示：杂合型MN的腹脂重和屠宰率显著（0.01＜P≤0.05）高于突变型NN；杂合型AB的胸肌重和胸肌率显著（P≤0.01或0.01＜P≤0.05）高于基因型AA，基因型AA的腹脂重和腹脂率都极显著（P≤0.01）高于突变型BB，在腿肌重性状上，BB型却显著（0.01＜P≤0.05）低于AA型和AB型；2个位点联合分析时，NA／MA基因型的腹脂重、腹脂率均极显著（P≤0.01）高于其它联合基因型；NA／MA型在胸肌率上极显著（P≤0.01）低于其它联合基因型，在胸肌重上显著（0.01＜P≤0.05）低于NA／MB型。B等位基因具有增加胸肌重和胸肌率的效应，同时有降低脂肪含量的遗传效应。IGF-Ⅰ基因中：引物IS1IA1所扩增产物的TasⅠ、Mphl103Ⅰ酶切座位和引物IS2IA2所扩增产物的HinfⅠ酶切座位在本研究样本中没有发现多态；引物IS1IA1、IS3IA3、IS4IA4所扩增产物对应的HinfⅠ、TaqⅠ和PstⅠ内切酶分别识别C→A、C→T和T→C突变，每个SNPs座位各出现了3种基因型；联合PstⅠ和HinfⅠ座位分析出现了7种基因型。其中A系在3个座位上均处于Hardy—Weinberg平衡状态（P＞0.05），B系在PstⅠ座位、C系在TaqⅠ座位均偏离了Hardy—Weinberg平衡（P≤0.01或0.01＜P≤0.05）。方差分析显示每个座位基因型对部分屠体性状都有极显著或显著的差异（P≤0.01或0.01＜P≤0.05）。多重比较显示：在活重、屠体重、半净膛重、全净膛重、胸肌重、腿肌重上，每个座位3种基因型的最小二乘均值之间均有突变型＞杂合型＞野生型的关系。联合基因型OF／QF和QE／OF的最小二乘均值在4个屠体性状上显著高于（0.01＜P≤0.05）联合基因型PE／QE。IGF—Ⅰ基因HinfⅠ、TaqⅠ、PstⅠ座位上的突变等位基因（分别是F、T和Q）和单倍型QF具有增加屠体性状的效应，而单倍型PE具有降低屠体性状的效应。A系和B系之间的遗传距离为0.0053，聚类分析表明两系同为1枝。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 1 文献综述
• 1.1 研究背景
• 1.2 Myostatin基因研究进展
• 1.2.1 Myostatin基因的发现
• 1.2.2 Myostatin基因的结构和定位
• 1.2.3 Myostatin基因的作用机制
• 1.2.4 Myostatin基因在其它动物中的研究
• 1.3 IGF—Ⅰ基因研究进展
• 1.3.1 IGF—Ⅰ的发现
• 1.3.2 IGF—Ⅰ基因的结构和定位
• 1.3.3 IGF—Ⅰ受体及结合蛋白
• 1.3.4 IGF—Ⅰ对生长发育的调控
• 1.3.5 IGF—Ⅰ的作用机制
• 1.3.6 cIGF—Ⅰ的生物学功能
• 1.3.7 cIGF—Ⅰ基因的遗传多样性
• 1.4 PCR—RFLP技术
• 1.5 本试验研究的目的和意义
• 2 材料与方法
• 2.1 试验材料
• 2.1.1 供试样本
• 2.1.2 仪器设备
• 2.1.3 实验药品和生物试剂
• 2.1.4 引物信息
• 2.1.5 试剂配制
• 2.2 试验方法
• 2.2.1 血样采集
• 2.2.2 性状测定
• 2.2.3 DNA提取
• 2.2.4 DNA检测
• 2.2.5 PCR扩增
• 2.2.6 PCR产物检测
• 2.2.7 PCR—RFLP分析
• 2.3 数据处理
• 2.3.1 基因频率和基因型频率的计算
• 2.3.2 单倍型及联合基因型分析
• 2.3.3 遗传多态性分析
• 2.3.4 Hardy—Weinberg平衡状态的检验
• 2.3.5 聚类分析
• 2.3.6 序列比对
• 2.3.7 基因型与屠体性状的相关分析
• 3 结果与分析
• 3.1 DNA抽提结果
• 3.2 PCR扩增结果
• 3.2.1 引物MS2MA2的PCR扩增结果
• 3.2.2 引物IS1IA1的PCR扩增结果
• 3.2.3 引物IS2IA2的PCR扩增结果
• 3.2.4 引物IS3IA3的PCR扩增结果
• 3.2.5 引物IS4IA4的PCR扩增结果
• 3.3 PCR—RFLP结果
• 3.3.1 引物MS2MA2的PCR—Bsh1236Ⅰ结果
• 3.3.2 引物MS2MA2的PCR—MspⅠ结果
• 3.3.3 引物IS1IA1的PCR—HinfⅠ结果
• 3.3.4 引物IS1IA1的PCR—Mphl103Ⅰ结果
• 3.3.5 引物IS1IA1的PCR—TasⅠ结果
• 3.3.6 引物IS2IA2的PCR—HinfⅠ结果
• 3.3.7 引物IS3IA3的PCR—TaqⅠ结果
• 3.3.8 引物IS4IA4的PCR—PstⅠ结果
• 3.4 基因频率和基因型频率
• 3.4.1 MSTN基因的基因频率和基因型频率
• 3.4.2 IGF—Ⅰ基因的基因频率和基因型频率
• 3.5 单倍型频率和基因型频率
• 3.5.1 MSTN基因的单倍型频率和基因型频率
• 3.5.2 IGF—Ⅰ基因的单倍型频率和基因型频率
• 3.6 遗传特性分析
• 3.6.1 MSTN基因遗传特性分析
• 3.6.2 IGF—Ⅰ基因遗传特性分析
• 3.7 Hardv—Weinberg平衡检验
• 3.7.1 MSTN基因Hardy—Weinberg平衡检验
• 3.7.2 IGF—Ⅰ基因Hardy—Weinberg平衡检验
• 3.8 聚类分析
• 3.9 总体遗传效应分析
• 3.10 基因型与屠体性状的相关分析
• 3.10.1 MSTN基因与屠体性状的相关分析
• 3.10.2 IGF—Ⅰ基因与屠体性状的相关分析
• 4 讨论
• 4.1 MSTN基因座位的遗传特性分析
• 4.2 IGF—Ⅰ基因座位的遗传特性分析
• 4.3 单倍型分析
• 4.4 平衡检验分析
• 4.5 品系间亲缘关系分析
• 4.6 MSTN基因的遗传效应分析
• 4.7 IGF—Ⅰ基因的遗传效应分析
• 4.8 联合基因型的遗传效应分析
• 5 结论
• 参考文献
• 致谢
• 附录