食管鳞癌血清蛋白指纹图谱诊断模型的研究

论文摘要

目的:分析新疆食管鳞癌血清蛋白指纹的表达并建立其诊断模型,为食管癌的诊断与临床筛查提供新的途径。方法:采用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱技术（SELDI-TOF-MS）和弱阳离子交换芯片（CM10 chip）分析188例样本,其中139例新疆食管鳞癌患者（包括维吾尔族54例,哈萨克族45例,汉族40例）和49例性别、年龄相匹配的健康人（包括维吾尔族28例,哈萨克族10例,汉族11例）血清蛋白的表达图谱。随机抽取其中135例标本（食管鳞癌104例,正常人31例）作为训练组,应用支持向量机（SVM）分析表达图谱数据,并建立食管癌诊断模型,用留一法验证该模型。用53例样本（食管鳞癌35例,正常人18例）盲法测试以评价该模型。结果:在分子量0～50 000范围内,共检测到283个蛋白峰,其中140个差异有显著意义（P<0.05）。建立了由6个差异蛋白其质荷比（M/Z）分别为5667.1843、5709.597、5876.2093、5979.2029、6043.524、6102.8172所组成的食管癌诊断模型,其灵敏度为97.12%,特异度为83.87%,扩大样本盲法验证结果显示其灵敏度为91.43%,特异度为88.89%。结论:应用SELDI-TOF-MS技术和生物信息学技术筛选出的6个差异蛋白所组成的诊断模型具有较好的敏感性和特异性,为新疆食管鳞癌的诊断提供了一种无创伤性的辅助诊断方法。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 前言
• 材料与方法
• 1. 材料
• 1.1 食管鳞癌患者血清和健康人血清采集
• 1.2 质量控制血清采集
• 1.3 主要实验设备和耗材
• 1.4 主要的实验试剂
• 1.5 主要实验试剂的配制方法
• 2. 实验方法
• 2.1 仪器调校
• 2.2 实验设计
• 2.3 实验流程
• 2.4 芯片检测、数据采集和参数设置
• 2.5 数据处理及统计学分析
• 2.6 诊断模型的验证
• 结果
• 1.食管癌血清蛋白指纹图差异蛋白的筛选
• 2.食管癌诊断模型的建立
• 3.诊断模型盲法验证结果
• 讨论
• 小结
• 致谢
• 参考文献
• 综述 SELDI-TOM-FS 技术的研究及应用现况
• 攻读硕士学位期间发表的学术论文
• 导师评阅表