本文主要研究内容
作者丁晓,史晨辉,孟德峰,王海英,韩飞,蒲沛东,王梦雨,王维山（2019）在《骨关节炎关键基因与治疗药物的生物信息学筛选》一文中研究指出：目的:利用生物信息学方法探寻骨关节炎(OA)关键基因及潜在治疗药物。方法:利用基因表达大棚车(GEO)下载GSE55235芯片数据,R语言3.5.0筛选差异表达基因,David在线数据库对差异表达基因进行基因本体(GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析,String 10.5在线数据库构建分析蛋白质之间的相互作用,Cytoscape v3.6.1软件进行可视化编辑,MCODE插件进行子网络模块分析,筛选出OA发生过程中的核心基因。最后根据关联性图谱(CMap)分析具有潜在治疗OA的小分子药物。结果:筛选出556个差异基因,其中上调252个,下调304个,这些差异基因主要参与细胞外基质组织、炎症反应、细胞黏附、免疫应答以及胶原结合等方面;KEGG通路分析发现差异基因主要参与细胞外基质受体相互作用,磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路及破骨细胞分化;蛋白质相互作用发现白细胞介素-6(IL-6),JUN,血管内皮生长因子α(VEGFA),FOS,MYC和早期生长反应蛋白-1(EGR-1),转录激活因子-3(ATF-3)等关键基因;筛选出了一些潜在治疗OA的小分子药物,如石蒜碱和茴香霉素等。结论:所筛选的关键基因可能成为诊断OA的标志物或潜在治疗OA的靶点;筛选出来的小分子药物可作为治疗OA的关键药物进行研发。
Abstract
mu de :li yong sheng wu xin xi xue fang fa tan xun gu guan jie yan (OA)guan jian ji yin ji qian zai zhi liao yao wu 。fang fa :li yong ji yin biao da da peng che (GEO)xia zai GSE55235xin pian shu ju ,Ryu yan 3.5.0shai shua cha yi biao da ji yin ,Davidzai xian shu ju ku dui cha yi biao da ji yin jin hang ji yin ben ti (GO)fu ji fen xi ji jing dou ji yin yu ji yin zu bai ke quan shu (KEGG)xin hao tong lu fen xi ,String 10.5zai xian shu ju ku gou jian fen xi dan bai zhi zhi jian de xiang hu zuo yong ,Cytoscape v3.6.1ruan jian jin hang ke shi hua bian ji ,MCODEcha jian jin hang zi wang lao mo kuai fen xi ,shai shua chu OAfa sheng guo cheng zhong de he xin ji yin 。zui hou gen ju guan lian xing tu pu (CMap)fen xi ju you qian zai zhi liao OAde xiao fen zi yao wu 。jie guo :shai shua chu 556ge cha yi ji yin ,ji zhong shang diao 252ge ,xia diao 304ge ,zhe xie cha yi ji yin zhu yao can yu xi bao wai ji zhi zu zhi 、yan zheng fan ying 、xi bao nian fu 、mian yi ying da yi ji jiao yuan jie ge deng fang mian ;KEGGtong lu fen xi fa xian cha yi ji yin zhu yao can yu xi bao wai ji zhi shou ti xiang hu zuo yong ,lin zhi xian ji chun 3-ji mei /dan bai ji mei B(PI3K/Akt)xin hao tong lu ji po gu xi bao fen hua ;dan bai zhi xiang hu zuo yong fa xian bai xi bao jie su -6(IL-6),JUN,xie guan nei pi sheng chang yin zi α(VEGFA),FOS,MYChe zao ji sheng chang fan ying dan bai -1(EGR-1),zhuai lu ji huo yin zi -3(ATF-3)deng guan jian ji yin ;shai shua chu le yi xie qian zai zhi liao OAde xiao fen zi yao wu ,ru dan suan jian he hui xiang mei su deng 。jie lun :suo shai shua de guan jian ji yin ke neng cheng wei zhen duan OAde biao zhi wu huo qian zai zhi liao OAde ba dian ;shai shua chu lai de xiao fen zi yao wu ke zuo wei zhi liao OAde guan jian yao wu jin hang yan fa 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自中国实验方剂学杂志的丁晓,史晨辉,孟德峰,王海英,韩飞,蒲沛东,王梦雨,王维山，发表于刊物中国实验方剂学杂志2019年09期论文，是一篇关于骨关节炎论文,生物信息学论文,基因芯片论文,关联性图谱论文,石蒜碱论文,茴香霉素论文,差异表达论文,中国实验方剂学杂志2019年09期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自中国实验方剂学杂志2019年09期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
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