PIT-1基因对京海黄鸡生长性状的遗传效应研究

论文摘要

垂体特异转录因子PIT-1（Pituitary-specific Transcription Factor）是家禽垂体前叶特异表达的一种具有重要功能的转录因子,它与PRL基因、GH基因、TSHβ基因以及自身的启动子结合,调控这些基因的转录,通过调节这些基因的表达而对家禽的生长发育、繁殖等很多方面起着重要的作用。本研究采用PCR-SSCP和测序的方法检测了京海黄鸡PIT-1不同基因片段的多态性,对其单核苷酸多态性进行了群体遗传学分析和基因多态位点与相关性状的关联分析。结果如下:1. PIT-1基因引物P1、P6和P11在京海黄鸡中均检测到AA、AB、BB三种不同基因型,共发现4处多态位点。引物P1检测到的等位基因A和B的频率分别为0.92495和0.07505;引物P6检测出的等位基因A和B的频率都为0.5;引物P11检测到的等位基因A和B的频率分别为0.3964和0.0636。卡方检验表明在P6和P11检测到的基因位点上,基因频率和基因型频率都达到了Hardy-Weinberg平衡状态,而引物P1不符合。2.就引物P1而言,测序结果表明,在DNA的第1876bp处和1882bp处分别发生了A→G和T→C两处碱基突变,并且前一个碱基突变导致了PIT-1从丝氨酸到天冬氨酸改变;对引物P6,测序发现在DNA的第3684bp处发生了A→T的突变;引物P11测序结果显示在DNA的第4573bp处发生了T→C的突变,并导致了PIT-1从蛋氨酸到苏氨酸的改变。3.对PIT-1基因引物P1扩增片段的基因型与各群体的生长性状的统计分析显示:在京海黄鸡公鸡群体中,AA型基因型在1日龄和8周龄体重性状上与其它基因型差异显著（P<0.05）;母鸡群体中,AA型基因型在1日龄体重性状上显著高于AB型和BB型（P<0.05）;AA型在公母鸡其它各个阶段的体重性状上都是优势基因型。AA型基因型在公母鸡胸宽性状上与其它基因型差异显著（P<0.05）,且在大部分体尺和屠宰性状上都表现为优势。由此可以做出如下推测:A等位基因可能与京海黄鸡体重和体尺性状呈正相关。4.对PIT-1基因引物P6扩增片段的基因型与各群体的生长性状的统计分析显示:京海黄鸡公鸡群体中,AB型在各阶段体重性状上均优于其它基因型,但差异不显著;母鸡群体中,AB型在1、8、12和16周龄时的体重都显著高于AA型和BB型（P<0.05）。在体斜长和胫围等体尺性状上,AB型高于其它基因型,但差异不显著。母鸡群体中,AB型在半净膛重、全净膛重、腿肌重和胸肌重等屠宰性状上均高于AA型和BB型,且显著高于BB型（P<0.05）。由以上结果可以做出如下推测:该位点对京海黄鸡母鸡体重性状和屠宰性状产生的影响大于公鸡,且该位点表现出一定的杂和效应。5.对PIT-1基因引物P11扩增片段的基因型与各群体的生长性状的统计分析显示:该位点仅对京海黄鸡母鸡16周龄体重有显著影响,BB型高于AA型（P<0.05）;对公母鸡其它体重和体尺性状均无影响。屠宰性状上,公鸡AB型的腹脂重和腹脂率都显著高于BB型（P<0.05）;公母鸡中,BB型的胸肌和腿肌重显著高于AA和AB型（P<0.05）。总的说来,B等位基因可能与京海黄鸡屠宰性状呈一定正相关。本研究结果提示PIT-1基因可能是控制京海黄鸡体重性状和屠宰性状的主效基因或是与之存在紧密联系。可以尝试将PIT -1基因作为体重性状和屠宰性能的分析标记用于标记辅助选择。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 1 文献综述
• 1.1 PIT-1 基因简介
• 1.2 PIT-1 的结构及定位
• 1.2.1 PIT-1 基因的蛋白结构
• 1.2.2 PIT-1 基因的定位
• 1.2.3 PIT-1基因分子结构在各物种间的同源性比较
• 1.3 PIT-1 基因的表
• 1.3.1 PIT-1 基因在各物种间的表达
• 1.3.2 PIT-1 基因对GH、PRL 和TSH 基因表达的调控
• 1.3.3 PIT-1 基因的激活转
• 1.4 PIT-1 基因的生物学效应
• 1.4.1 PIT-1 基因的两种作用方
• 1.4.2 PIT-1 基因的多态性及其应用
• 1.5 研究目的和意义
• 2 材料与方法
• 2.1 试验动物
• 2.2 主要仪器、药品和分析软件
• 2.2.1 仪器和药品
• 2.2.2 分析工具软件
• 2.3 鸡血液基因组DNA 的提取
• 2.4 PIT-1 基因PCR-SSCP 检测
• 2.4.1 引物设计
• 2.4.2 最佳 PCR 反应条件和反应体系的建立
• 2.4.3 SSCP检测过程
• 2.5 遗传学统计分析
• 3 结果与分析
• 3.1 PIT-1 基因的 SSCP 多态检测结果
• 3.2 测序与分析
• 3.3 两种纯合子PCR 产物直接测序结果同源性比较
• 3.4 PIT-1 基因多态位点的基因频率和基因型频率及适应性检验
• 3.4.1 PIT-1 基因多态性位点（引物 P1）的基因频率和基因型频率及适应性检验
• 3.4.2 PIT-1 基因多态性位点（引物 P6）的基因频率和基因型频率及适应性检验
• 3.4.3 PIT-1 基因多态性位点（引物 P11）的基因频率和基因型频率及适应性检验
• 3.5 PIT-1 基因与京海黄鸡相关性状的关系
• 3.5.1 PIT-1 基因多态位点（引物 P1）与相关性状的关系
• 3.5.2 PIT-1 基因多态位点（引物 P6）与相关性状的关系
• 3.5.3 PIT-1 基因多态位点（引物 P11）与相关性状的关系
• 4 讨论
• 4.1 PIT-1 基因多态性与群体遗传学分析
• 4.1.1 京海黄鸡中PIT-1 基因遗传多样性
• 4.1.2 群体遗传学分析
• 4.2 PIT-1 基因多态性与生长性状的关系分析
• 4.2.1 引物 P1 与生长性状的关系
• 4.2.2 引物 P6 与生长性状的关系
• 4.2.3 引物 P11 与生长性状的关系
• 4.2.4 PIT-1 基因多态位点与生长性状关系的分析
• 4.3 PIT-1 基因产生遗传效应的机理
• 4.4 鸡PIT-1 基因的研究展望
• 5 结论
• 参考文献
• 致谢
• 攻读学位期间发表的学术论文目录