中国华南地区芒属植物遗传多样性的SSR分析

论文摘要

芒属植物是一种多年生的高光效C4植物,分布在热带和亚热带地区,从太平洋岛屿到日本和喜马拉雅的山区都能发现它们的踪迹。在欧洲,芒属植物被视为在未来能给火电厂提供燃料的能源植物,不仅是火力发电,更重要的是它是一种最有开发潜力的能源植物之一,可作为生物乙醇生产原料和发电燃料。本文利用SSR分子标记技术,探讨华南地区芒属植物品种间的遗传多样性。通过芒属植物品种遗传多样性的分析,对于指导芒属植物种质资源的搜集、保存、遗传育种与种质创新等均有十分重要的理论意义和应用价值。研究的主要结果如下：1.建立了适合SSR标记的大批量提取实验材料的基因组DNA模板制备技术体系。本试验以芒属植物的嫩叶为材料用常规的CTAB法和改良的CTAB法均获得了基因组DNA,用改良的CTAB法可以节省大量体力,大大提高工作效率。2.利用37对玉米SSR引物对120份中国华南地区的野生芒属材料进行SSR扩增,以研究其遗传多样性。结果表明,37对引物共扩增出215条带,其中多态性条带189个,占85.21%。平均Nei’s基因多样度为0.1791,平均Shannon信息指数为0.2873。120个供试材料的平均遗传距离为0.362193。UPGMA聚类分析显示,120份材料在遗传距离系数(GD)为0.54水平上,聚成2大类。第一大类由来自广东河八王组成,第二大类由119份芒属材料组成。在GD值为0.38水平上,可将119份芒属材料分成2个亚类,第一亚类由103份芒和五节芒材料组成,第二亚类由16份南荻材料组成。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 前言
• 1 芒属植物国内外研究进展
• 1.1 芒属植物形态学分类研究
• 1.2 芒属植物细胞学研究
• 1.3 芒属植物分子标记研究
• 1.4 芒属植物生物学特性研究
• 2 遗传标记及SSR分子标记的研究进展
• 2.1 形态标记
• 2.2 细胞学标记
• 2.3 生化标记
• 2.4 DNA分子标记
• 2.5 SSR分子标记的研究进展
• 3 研究目的与意义
• 第一章 芒属植物基因组DNA的快速制备方法
• 1 材料与试剂
• 1.1 试验材料
• 1.2 主要试剂
• 2 方法
• 2.1 常规的CTAB法
• 2.2 改良后的CTAB法
• 2.3 基因组DNA的质量检测
• 3 结果与分析
• 4 讨论
• 第二章 华南地区芒属植物的SSR分析
• 1 材料
• 1.1 试验材料
• 2 方法
• 2.1 基因组DNA的提取
• 2.2 SSR-PCR反应体系的构建
• 2.3 SSR-PCR产物的检测
• 2.4 引物的筛选
• 2.5 数据统计分析
• 3 结果与分析
• 3.1 基因组DNA的提取及质量检测
• 3.2 SSR引物筛选
• 3.3 SSR标记的多态性分析
• 3.4 SSR标记的遗传距离和聚类分析
• 3.5 主成分分析
• 4 讨论
• 4.1 玉米SSR引物在芒属植物遗传分析中应用的可行性
• 4.2 华南地区芒属植物的遗传多样性
• 4.3 华南地区芒属植物的聚类分析
• 结论与展望
• 1 结论
• 1.1 芒属植物基因组DNA的提取
• 1.2 华南地区芒属植物的SSR分析
• 2 展望
• 参考文献
• 附表
• 致谢
• 作者简介