药物小分子与蛋白质相互作用的光谱及分子对接研究

论文摘要

蛋白质是与生命及各种形式的生命活动紧密联系在一起的物质。生物体中的每一个细胞和所有的生命活动,都离不开蛋白质的参与,可以说没有蛋白质就没有生命。血清白蛋白是血浆中含量最丰富的重要载体蛋白,能与许多药物分子结合,直接影响药物的吸收、分布和代谢方式,进而影响药效的发挥。因此,研究药物小分子与蛋白质的相互作用,已成为生物化学、毒理学、药理学和药代动力学研究领域的一个重要课题。荧光和紫外-可见吸收光谱法,具有方法简单、分析速度快、灵敏度高等优点而被广泛应用。计算机分子对接技术,能形象地呈现药物与蛋白质的作用结果。因此,本文综合运用光谱分析法和分子对接技术,对药物小分子与蛋白质的相互作用进行了研究。论文共分五部分:第一章:简述了药物小分子与蛋白质相互作用的研究意义、研究现状和前景展望。阐述了用荧光光谱法和分子对接法研究二者相互作用的原理。第二章:用荧光光谱法和分子对接技术研究了生理条件下一种吡喃并[4,3-b]吡喃衍生物与牛血清白蛋白的结合反应。根据荧光光谱数据,计算出了两者的结合常数、作用力类型和作用距离,并用同步和三维荧光技术讨论了该衍生物对牛血清白蛋白构象的影响。用人血清白蛋白代替牛血清白蛋白分子,与吡喃并[4,3-b]吡喃衍生物对接,预测了其与人血清白蛋白结合区域。第三章:在模拟生理条件下,研究了一种吡喃并[3,2-c]吡啶-5-酮衍生物与牛血清白蛋白的相互作用。用荧光法结合紫外-可见吸收光谱法确定了二者的猝灭机理,并确定了作用力类型、作用距离及金属离子对相互作用的影响。用同步和三维荧光法考察了这一衍生物对牛血清白蛋白构象的影响。用人血清白蛋白代替牛血清白蛋白分子做分子对接,分析了该吡喃并[3,2-c]吡啶-5-酮衍生物与人血清白蛋白作用区域。第四章:运用光谱法和分子对接技术研究了盐酸氨溴索与人血清白蛋白的相互作用。根据荧光光谱辅以紫外-可见吸收光谱判定了该药物对人血清白蛋白荧光的猝灭机理。利用分子对接技术,从分子角度对二者的相互作用进行了预测。第五章:在pH=7.4条件下,研究了非诺贝特与人血清白蛋白的相互作用。用光谱法研究了二者结合反应的特征,并用分子对接技术对它们的相互作用进行了分析。

论文目录

• 摘要
• ABSTRACT
• 第一章 药物小分子与蛋白质相互作用的光谱及分子对接研究
• 1.1 药物小分子与蛋白质相互作用研究的意义
• 1.2 荧光法研究药物小分子与蛋白质相互作用的原理
• 1.2.1 荧光猝灭机理
• 1.2.2 结合位点数和结合常数
• 1.2.3 作用力类型
• 1.2.4 相互作用位置
• 1.2.5 蛋白质分子构象的研究
• 1.3 分子对接技术的应用原理
• 1.4 研究现状及前景展望
• 第二章 吡喃并[4, 3-b]吡喃衍生物与牛血清白蛋白作用的光谱及分子对接研究
• 2.1 引言
• 2.2 实验部分
• 2.2.1 仪器和试剂
• 2.2.2 实验方法
• 2.3 结果与讨论
• 2.3.1 荧光光谱与猝灭类型的确定
• 2.3.2 结合位点数n 及结合常数K 的求算
• 2.3.3 PPD 与BSA 作用力的确定
• 2.3.4 PPD 在BSA 上结合位置的求取
• 2.3.5 共存金属离子对二者结合常数的影响
• 2.3.6 PPD 对BSA 构象的影响
• 2.3.7 PPD 与血清白蛋白分子对接分析
• 第三章 吡喃并[3,2-c]吡啶-5-酮衍生物与牛血清白蛋白作用的光谱及分子对接研究
• 3.1 引言
• 3.2 实验部分
• 3.2.1 仪器和试剂
• 3.2.2 实验方法
• 3.3 结果与讨论
• 3.3.1 荧光光谱与猝灭机理
• 3.3.2 紫外-可见吸收光谱
• 3.3.3 作用力类型的确定
• 3.3.4 作用距离的求取
• 3.3.5 金属离子对动态猝灭常数的影响
• 3.3.6 CPP 对BSA 构象的影响
• 3.3.7 CPP 与血清白蛋白分子对接分析
• 第四章 盐酸氨溴索与人血清白蛋白相互作用的光谱及分子对接研究
• 4.1 引言
• 4.2 实验部分
• 4.2.1 仪器和试剂
• 4.2.2 实验方法
• 4.3 结果与讨论
• 4.3.1 荧光光谱和作用机理
• 4.3.2 紫外-可见吸收光谱
• 4.3.3 热力学参数和作用力类型
• 4.3.4 相互作用距离
• 4.3.5 金属离子对动态猝灭常数的影响
• 4.3.6 ABX 对HSA 构象的影响
• 4.3.7 分子对接分析
• 第五章 非诺贝特与人血清白蛋白相互作用的光谱及分子对接研究
• 5.1 引言
• 5.2 实验部分
• 5.2.1 仪器和试剂
• 5.2.2 实验方法
• 5.3 结果与讨论
• 5.3.1 荧光光谱和作用机理
• 5.3.2 紫外-可见吸收光谱
• 5.3.3 结合位点数及结合常数
• 5.3.4 作用力类型
• 5.3.5 作用距离
• 5.3.6 金属离子的影响
• 5.3.7 FNBT 对 HSA 构象的影响
• 5.3.8 分子对接分析
• 结论
• 参考文献
• 致谢
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