辽宁新品系绒山羊微卫星标记与经济性状相关关系的研究

论文摘要

利用微卫星标记技术对我国特有遗传资源120头辽宁新品系绒山羊的13个微卫星位点进行了研究,对其进行群体遗传学特性分析,并利用SAS程序下的GLM分析了体重、绒产量和绒细度3个经济性状与标记基因型的关系。(1)利用POPGENE软件对新品系绒山羊第3号、第4号和第5号染色体上13个微卫星位点的多态性进行了检测,结果表明:McM058有5个等位基因,9种基因型;BMS1788有6个等位基因,12种基因型;LSCV15有6个等位基因,9种基因型;OarHH35有7个等位基因,15种基因型;CSSM54有6个等位基因,11种基因型;MAF070有6个等位基因,9种基因型;MAF050有5个等位基因,10种基因型;McM218有6个等位基因,11种基因型;BMS1248有7个等位基因,8种基因型;BM2830有6个等位基因,9种基因型; ILSTS034有6个等位基因,10种基因型; LSCV25有5个等位基因,7种基因型;INRA003在所有被测个体中呈单态。本实验的13个位点中,除INRA003为单态外,其余12个都是高度多态(PIC>0.5)。(2)利用SAS程序下的GLM,对12个微卫星位点进行经济性状相关关系的最小二乘方差分析,各位点间差异不显著,但是在一些位点上找到与经济性状相关的有利基因型,结果表明:在体重性状上,BMS1788引物的AD和BE型,OarHH35引物的BE和CF型,MAF070引物的BE和CE型,MAF050引物的BD型,BMS1248的CD型,皆为体重性状标记的优势条带。在绒产量性状上,McM058引物的BE型,BMS1788引物的AB型,LSCV15引物的AE型,OarHH35引物的BD和BF型,CSSM54引物的AB型,MAF050引物的AD和BC型,BM2830引物的BB和CD型,ILSTS034引物的BC和CD型,皆为绒产量性状标记的优势条带。在绒细度性状上,BMS1788引物的BC型,OarHH35引物的AB型,CSSM54引物的EF型,MAF050引物的CE型, BMS1248的BC型, LSCV25引物的BB和BC型,皆为绒细度性状标记的优势条带。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 第一章 文献综述
• 1.1 遗传标记
• 1.1.1 遗传标记概述
• 1.2 微卫星 DNA 标记
• 1.2.1 微卫星标记的发现
• 1.2.2 微卫星 DNA 的结构
• 1.2.3 微卫星的遗传特点
• 1.2.4 微卫星的多态性机理
• 1.2.5 微卫星 DNA 功能
• 1.2.6 微卫星位点的获得
• 1.2.7 微卫星标记与生产性状的结合
• 1.2.8 微卫星 DNA 在羊遗传育种中的应用
• 1.3 数量性状位点
• 1.4 标记辅助选择（MAS）
• 1.5 本研究的目的意义
• 第二章 新品系绒山羊微卫星位点多态性及其与经济性状的相关分析
• 2.1 实验材料
• 2.1.1 样本的采集
• 2.1.2 微卫星引物
• 2.1.3 试剂及仪器
• 2.2 实验方法
• 2.2.1 基因组 DNA 的提取
• 2.2.2 DNA 浓度和纯度的检测
• 2.2.3 设计引物
• 2.2.4 PCR 扩增
• 2.2.5 PCR 扩增产物的凝胶电泳
• 2.2.6 聚丙烯酰胺凝胶的银染（以下操作均在摇床上进行）
• 2.2.7 微卫星基因型的判定
• 2.3 统计分析
• 2.3.1 等位基因频率（ALLELE FREQUENCE）
• 2.3.2 多态信息含量（POLYMORPHISM INFORMATION CONTENT， PIC）
• 2.3.3 群体杂合度（HETEROZYGOSITY， H）
• 2.3.4 有效等位基因数（EFFECTIVE NUMBERS OF ALLELES，NE）
• 2.3.5 与经济性状结合进行统计分析
• 2.4 结果与分析
• 2.4.1 基因组 DNA 的检测
• 2.4.2 微卫星位点的检测
• 2.4.3 13 个微卫星位点的研究结果
• 2.5 讨论
• 2.5.1 微卫星的选择
• 2.5.2 标记密度与样本容量
• 2.5.3 实验过程中影响微卫星多态性分析的因素
• 2.6 结论
• 参考文献
• 附录
• 致谢