稻米外观品质性状遗传及其杂种优势分析

稻米外观品质性状遗传及其杂种优势分析

论文摘要

稻米品质主要包括外观品质、加工品质、营养品质、蒸煮和食用品质等。稻米外观品质性状主要包括粒长、粒宽、粒长宽比、垩白和透明度等性状,是稻米商品品质的第一要素,直接影响稻米的商品价值。由于稻米品质一般由多基因控制,且易受环境条件的影响,因此利用传统的育种方法改良这些性状具有较大的难度。本研究利用多个群体系统地研究了稻米外观品质性状的遗传基础,定位了控制稻米外观品质性状的QTL,同时对其进行了相关遗传分析,为利用分子育种手段改良稻米外观品质建立了基础。主要结果如下:(1)利用所构建的“Lemont×特青”重组自交系(RIL)群体,采用混合线性模型和复合区间作图法,对旱、雨季条件下获得的稻米外观品质性状进行QTL定位及上位性和环境互作(Q×E)效应分析。结果表明,亲本Lemont和特青间米粒外观品质性状差异显著;外观品质性状尤其是垩白度在旱季和雨季不同条什下变化较大。共检测到20个控制粒长、粒宽、粒长宽比和垩白度的QTL,其中在第7染色体上检测到同时控制粒长、粒宽和长宽比的基因座位,位于标记区间OSR4-RM336之间。共检测到29对上位性互作位点,表明上位性效应对稻米外观品质性状具有重要的作用。共有5个主效QTL和8对上位性效应位点与环境之间互作显著,表明稻米外观品质性状的一些QTL对环境敏感。基因型与环境互作在不同性状和不同基因(QTL)间差别很大,就稻米外观品质性状而言,QTL与环境互作对垩白度及粒长宽比影响较大,分别占14.07%和17.78%的表型变异,而对粒长和粒宽的影响相对较小,分别只占2.77%和2.15%的表型变异。一些QTL(如ck4b、gl7a、gw5和lw3b)仅表现为加性效应,未检测到显著的环境互作,但另一些QTL(如ck3、gl3和lw9)与环境发生显著的互作。在实际育种上应利用在不同环境稳定检测到的QTL进行分子标记辅助选择。(2)分析了特青背景高代回交导入系(ILs)的遗传结构。在160个SSR标记位点上均不同程度地检测到供体等位基因,不同染色体及同一染色体的不同位点的供体等位基因导入频率各不相同,平均导入片段以第4染色体最多,第7染色体最少,表明染色体本身会影响等位基因导入。每个IL的供体基因平均占10.30%,变幅为0%~35%;平均导入片段数量为8.7个,单片段平均长度为17.8cM。选择56个导入系构建特青背景的全染色体组导入系群体,每个染色体由3~7个导入片段覆盖,非目标区域的导入成分有待标记辅助回交纯化。(3)利用特青背景的高代回交导入系对粒长、粒宽、粒长宽比和垩白度等性状进行了QTL分析。部分在重组自交系中定位的QTL尤其是主效QTL(qCD-7、qGL-7、qGW-7)在ILs中能够得到证实。但也有一部分QTL在两个群体的定位结果中有差异,尤其是利用ILs检测到控制粒宽的qGW-2,可解释表型变异的28.05%,但这个QTL在RIL群体里没有检测到,这可能是因为遗传背景的差异造成的。与RILs群体定位的结果一样,我们发现第7号染色体的OSR4-RM505区间是垩白度、粒长和粒宽的共同基因座位;另外还发现第6号染色体的RM439-RM340区间同时控制垩白度、粒宽和粒长宽比等性状。结果表明,利用ILs和RILs的定位QTL结果存在一定的差异,影响稻米外观品质相关性状的一些QTL位于同一染色体的相同或者相邻区域上。(4)选用IR75589-31S、IR60、IR70和重组自交系或高代回交导入系中选取的90个株系进行不完全双列杂交,以获得的270个杂交组合为材料,对杂交稻米外观品质性状表现及其与亲本的关系进行了研究。就杂交组合外观品质性状相对优势而言,除粒长宽比以外,其它外观品质性状的中亲优势都表现为正向组合个数大于负向。杂种稻米外观品质性状表现的差异因性状而异,以垩白度的变异系数最大,杂种米粒垩白度、粒长、粒宽和粒长宽比普遍介于双亲之间。稻米外观品质性状间的相关、回归和通径分析表明,垩白度、粒长、粒宽及粒长宽比间的相关系数均达极显著水平,粒长、粒长宽比与垩白度呈显著负相关,粒宽与垩白度显著正相关;粒长、粒宽和粒长宽比对垩白度的直接通径系数分别为-1.9409、2.1738和2.7805。直线回归分析显示外观品质性状间回归方程为y=-39.892x1+141.389x2+77.341x3-269.906,从方程可以看出,当x1、x2、x3变化量相同时,粒宽(x2)对垩白度(y)的影响最大,其次为粒长宽比(x3)。SSR分子标记遗传距离与杂种稻米外观品质相关性状杂种优势关系分析表明,亲本间的遗传距离在0.2914到0.4205之间,平均遗传距离为0.3520;杂交亲本遗传距离与外观品质性状间的相关系数偏小(-0.0307,0.1358,-0.1408),均未达到显著水平,外观品质性状杂种优势与亲本间的遗传差异大小无关。(5)采用禾谷类作物种子品质性状的遗传模型及其统计分析方法,对杂交稻米外观品质性状进行了遗传研究,结果表明,杂交稻外观品质性状主要受遗传控制且遗传效应以加性效应为主。粒长、粒宽和粒长宽比以种子直接加性效应为主,母体效应也起到一定的作用,垩白度主要受到种子直接效应和母体效应控制,同时还受到细胞质的影响。粒长、粒宽和粒长宽比三性状的狭义遗传率均较高,都在80%以上,其中以粒宽为最高,达89.90%,垩白度的遗传率相对来说低一点,为72.94%。稻米外观品质各性状的均以种子直接遗传率最高,其次为母体遗传率,细胞质遗传率最低。

论文目录

  • 中文摘要
  • Abstract
  • 第一章 绪论
  • 1 稻米外观品质研究进展
  • 1.1 稻米外观品质的评价
  • 1.2 稻米外观品质的遗传研究
  • 1.2.1 稻米外观品质的经典遗传学研究
  • 1.2.1.1 稻米粒形
  • 1.2.1.2 稻米垩白
  • 1.2.2 外观品质的分子遗传学研究
  • 2 分子标记及其在水稻遗传育种中的应用
  • 2.1 DNA标记类型及特点
  • 2.2 分子标记在遗传育种中的应用
  • 2.2.1 遗传图谱的构建
  • 2.2.2 种质鉴定
  • 2.2.3 遗传多样性分析
  • 2.2.4 重要农艺性状基因定位
  • 2.2.5 分子标记辅助选择育种
  • 2.2.5.1 抗性育种
  • 2.2.5.2 品质育种
  • 3 数量性状位点(QTL)定位研究
  • 3.1 数量性状的特点
  • 3.2 QTL作图群体
  • 3.3 QTL定位方法
  • 3.3.1 单一标记分析法(analysis of variance,ANOVA)
  • 3.3.2 区间作图法(interval mapping,IM)
  • 3.3.3 复合区间作图法(composite interval mapping,CIM)
  • 3.3.4 混合线性模型方法(Mixed model approaches)
  • 3.4 QTL定位条件
  • 3.5 数量性状位点与环境互作(Q×E interaction)及上位性效应
  • 3.6 QTL的精细定位与克隆
  • 3.6.1 QTL的精细定位
  • 3.6.2 QTL的克隆
  • 3.7 水稻QTL定位研究进展
  • 4 杂种优势及其遗传机理研究
  • 4.1 杂种优势的分子机理
  • 4.2 杂种优势预测
  • 参考文献
  • 前言
  • 第二章 稻米外观品质QTL定位及基因型与环境互作分析
  • 1 引言
  • 2 材料与方法
  • 2.1 试验材料与性状考查
  • 2.2 基因型分析
  • 2.3 QTL定位和效应分析
  • 3 结果与分析
  • 3.1 群体基因型组成
  • 3.2 稻米外观品质表型值分析
  • 3.3 稻米外观品质性状的相关分析
  • 3.4 稻米外观品质性状的QTL、上位性效应及环境互作分析
  • 3.4.1 垩白度
  • 3.4.2 粒长
  • 3.4.3 粒宽
  • 3.4.4 粒长宽比
  • 4 小结与讨论
  • 4.1 外观品质性状的主效QTL定位
  • 4.2 一因多效或紧密连锁QTL
  • 4.3 上位性效应是稻米外观品质的重要遗传基础
  • 4.4 QTL的环境互作效应
  • 参考文献
  • 第三章 特青背景高代回交导入系的遗传分析
  • 1 引言
  • 2 材料与方法
  • 2.1 供试材料
  • 2.2 遗传连锁图谱构建
  • 2.3 统计分析
  • 2.4 导入片段的划分及其分析
  • 2.5 全染色体组导入系筛选
  • 3 结果与分析
  • 3.1 导入供体等位基因的比例
  • 3.2 供体等位基因在染色体上的频率分布
  • 3.3 导入片段数量和长度
  • 3.4 全染色体组导入系群体
  • 4 讨论
  • 4.1 构建回交导入系的方法比较
  • 4.2 高代回交导入系(ILs)的利用
  • 参考文献
  • 第四章 利用高代回交导入系分析稻米外观品质性状QTL
  • 1 引言
  • 2 材料与方法
  • 2.1 供试材料
  • 2.2 田间试验与性状考察
  • 2.3 QTL定位分析
  • 3 结果与分析
  • 3.1 双亲和ILs的外观品质表现
  • 3.2 稻米外观品质QTL的检测
  • 4 小结与讨论
  • 参考文献
  • 1表现及其与亲本的关系'>第五章 稻米外观品质性状杂种F1表现及其与亲本的关系
  • 1 引言
  • 2 材料与方法
  • 2.1 试验材料
  • 2.2 试验方法
  • 2.2.1 田间试验与表型鉴定
  • 2.2.2 DNA提取及标记基因型分析
  • 2.2.3 遗传距离分析
  • 3 结果与分析
  • 3.1 供试亲本外观品质表现
  • 1外观品质性状表现及其与亲本的关系'>3.2 杂种F1外观品质性状表现及其与亲本的关系
  • 3.3 外观品质性状间的相关性分析
  • 3.3.1 外观品质性状间的关系
  • 3.3.2 粒形与垩白度的关系
  • 3.4 外观品质性状杂种优势表现及其与亲本分子遗传距离关系
  • 1杂种优势表现'>3.4.1 F1杂种优势表现
  • 3.4.2 亲本遗传距离分析
  • 3.4.3 SSR遗传距离与稻米外观品质杂种优势相关性分析
  • 4 讨论
  • 4.1 杂交稻米外观品质性状表现特点
  • 4.2 分子遗传距离与杂种优势
  • 4.3 杂交稻优质育种中对外观品质性状的亲本选择原则
  • 参考文献
  • 第六章 稻米外观品质性状遗传效应分析
  • 1 引言
  • 2 材料与方法
  • 2.1 试验材料
  • 2.2 统计分析
  • 3 结果与分析
  • 3.1 稻米外观品质性状的遗传率分析
  • 3.2 稻米外观品质性状的遗传方差和协方差分析
  • 3.3 亲本遗传效应分析
  • 4 讨论
  • 参考文献
  • 第七章 总结
  • 1 本研究主要结论
  • 2 本研究特色与创新之处
  • 缩写词表
  • 致谢
  • 作者简介
  • 相关论文文献

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