非键作用和库仑模型预测甘氨酸-α-多肽构象稳定性

论文摘要

本文采用密度泛函理论B3LYP/6-31G*方法,对甘氨酸?α?二肽、三肽、四肽、五肽和六肽分子进行了计算。对构象中的主要非键相互作用进行分析,确定了影响构象稳定性的主要非键作用,并估算了相关非键作用的能量。将之应用于判断二肽、三肽、四肽、五肽和六肽分子构象的相对稳定性,得到了满意的结果。进而建立甘氨酸?α?多肽的库仑模型,探讨了电荷在库仑模型中的作用,确立了各种非键作用的能量参数。用本文方法及库仑模型方法预测多肽构象的相对稳定性,得到了满意的结果。具体包括: 1) 以甘氨酸?α?二肽、三肽、四肽、五肽和六肽分子的52 个稳定构象为研究对象,对构象中的主要非键相互作用进行分析,确定了其相应参数值,使用此参数值和多肽分子构象的分子结构图,确定构象的相对能量,与密度泛函理论B3LYP 方法得到的相对能量比较,得到了满意的结果。2) 选择甘氨酸?α?多肽的库仑模型,确定相关非键作用能量的相应参数K。利用库仑模型、参数K 和密度泛函理论B3LYP/6-31G*方法优化计算的电荷,确定构象的相对能量,与密度泛函理论B3LYP 方法得到的相对能量比较,得到了满意的结

论文目录

• 中文摘要
• 前言
• 参考文献
• 第一章 甘氨酸-α-多肽体系中主要非键相互作用的确立和构象稳定性的预测
• 1.1 简介
• 1.2 甘氨酸-α-多肽中的主要非键作用
• 1.3 甘氨酸-α-多肽的结构和主要非键作用的确定
• 1.4　用本章方法确定二肽、三肽、四肽、五肽和六肽分子构象稳定性
• 1.5 结果与讨论
• 1.6 结论
• 参考文献
• 第二章 库仑模型的理论设想与计算
• 2.1 简介
• 2.2 计算方法
• 2.2.1 库仑模型的选择
• 2.2.2 七种参数 K 的确定
• 2.3 结果与讨论
• 2.3.1 使用本章 2.2 节方法确定多肽分子构象稳定性
• 2.3.2 应用第一章方法与应用本章 2.2 节方法确定多肽分子构象稳定性的比较
• 2.4 结论
• 参考文献
• 英文摘要
• 致谢