人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)假病毒检测体系的建立与应用

人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)假病毒检测体系的建立与应用

论文摘要

HIV-1具有基因多变性以及ENV结构的复杂性,不同HIV疫苗所诱导的中和抗体的中和特性往往不同,因此,建立一个统一有效的中和抗体检测方法是非常必要的。本课题成功获得31株可以与骨架质粒pSG3△ENV共转染293T细胞形成功能性假病毒的pcDNA3.1-ENV阳性克隆。我们对这31株克隆进行基因分型,其中有19株BC亚型、8株B亚型、4株AE亚型,除了4株假病毒的ENV基因来源于已有质粒外,其他27株中ENV基因均来源于中国HIV-1感染者的阳性血清样本。分析克隆中gp160核苷酸序列可以看出克隆之间存在遗传多样性,31株假病毒的可变区V1、V2、V4和V5中氨基酸数目都有明显差异,但V3区的氨基酸数目没有差异,这可能与假病毒进入细胞的机制有关。不同克隆中N-糖基化位点(PNLG)是有差异的,PNLG的位点数较少,暴露中和位点较多从而表现出较为敏感的中和反应。假病毒可以感染TZM-bl细胞,诱导细胞内的荧光素酶的表达,根据检测发光值的变化来判定中和活性的强弱。用四种已知的具有中和活性的单克隆抗体(4E10、2F5、2G12和IgG1b12)来分析假病毒的中和活性,结果显示假病毒株中单克隆抗体识别中和表位的氨基酸变化会影响其中和活性。当缺少N-糖基化位点295或392时,假病毒株都表现为对2G12不敏感,因此认为N-糖基化位点295或392是2G12中和活性所必需的识别位点。2F5识别位点包含氨基酸序列ELDKWA,从实验结果可以看出赖氨酸(K)是2F5识别位点所必需的。4E10识别位点紧邻2F5识别位点,包含氨基酸序列NWFDIT,序列中N被S取代,D被S/N取代,T被S取代均不影响假病毒对4E10的敏感性。用假病毒检测体系检测43份血清样本,结果显示19株BC亚型的假病毒与BC亚型血清样本有明显的、广泛的中和活性,而与B、AE亚型血清样本反应时仅个别反应表现出中和活性,但抑制率都偏低。同样8株B亚型假病毒与同亚型血清样本反应表现出较高的中和活性,4株AE亚型假病毒与同亚型血清样本反应表现出相对较高的中和活性,各亚型间没有明显的交叉活性。从检测血清样本的结果可以看出,假病毒检测体系应用于血清样本的检测是可行的,而且假病毒检测体系容易标准化,其结果重复性较好。假病毒检测体系成功的应用于药物AZT、3TC、d4T和ddI检测,检测药物的实验结果与已报道的结果相一致,可以看出假病毒检测体系可应用于抗HIV药物检测。假病毒检测体系既可以定性得到半数有效浓度EC50又可以定量得到半数有效剂量ED50,并且相对于活病毒法具有重复性好、灵敏、精确、易操作的优点。因此,假病毒法在检测抗HIV-1药物的研究中具有很好的发展前景。

论文目录

  • 内容提要
  • 第一章 前言
  • 1.1 HIV 病毒简介
  • 1.1.1 HIV-1 的生活周期和致病机制
  • 1.1.2 HIV-1 感染受体及其细胞亲嗜性
  • 1.2 中和抗体的研究现状
  • 1.2.1 中和抗体的产生机制及其意义
  • 1.2.2 单克隆中和抗体
  • 1.2.3 中和抗体检测
  • 1.3 抗HIV-1 药物
  • 1.3.1 核苷类逆转录酶抑制剂
  • 1.3.2 非核苷类逆转录酶抑制剂
  • 1.3.3 蛋白酶抑制剂
  • 1.3.4 抗HIV 药物的检测方法
  • 1.4 本论文设计的构思
  • 1.4.1 实验思路
  • 1.4.2 实验程序
  • 第二章 实验材料和方法
  • 2.1 材料、仪器和试剂
  • 2.1.1 材料
  • 2.1.2 主要仪器
  • 2.1.3 常用试剂配置
  • 2.2 实验方法
  • 2.2.1 质粒的小量提取
  • 2.2.2 大肠杆菌E.coli 化学感受态的制备
  • 2.2.3 RNA 模板的制备
  • 2.2.4 cDNA 的获得
  • 2.2.5 套式PCR
  • 2.2.6 琼脂糖凝胶回收
  • TM3.1 D/V5-His-TOPO 载体'>2.2.7 将 ENV 基因克隆入 pcDNATM3.1 D/V5-His-TOPO 载体
  • 2.2.8 质粒的大量提取
  • 2.2.9 质粒的定量
  • 2.2.10 利用LIPOFECTAMINE 2000 进行转染
  • 2.2.11 聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)
  • 2.2.12 Western Blot
  • 2.2.13 功能性假病毒的获得
  • 2.2.14 功能性假病毒的滴度测定
  • 2.2.15 假病毒体系检测单克隆抗体的方法
  • 2.2.16 中和抗体检测操作流程
  • 2.2.17 抗HIV-1 药物的检测
  • 第一部分 假病毒检测体系的建立
  • 1.1 PCDNA3.1-ENV 质粒的构建及鉴定
  • 1.1.1 ENV 基因片段的获得
  • 1.1.2 pcDNA3.1-ENV 质粒的鉴定
  • 1.2 ENV 蛋白的表达鉴定
  • 1.3 功能性假病毒的获得
  • 1.4 可形成功能性假病毒的ENV 序列分析
  • 1.5 假病毒株中和特性的分析
  • 1.5.1 单克隆抗体2G12
  • 1.5.2 单克隆抗体IgG1b12
  • 1.5.3 单克隆抗体2F5
  • 1.5.4 单克隆抗体4E10
  • 1.6 小结
  • 第二部分 假病毒检测体系的应用
  • 2.1 应用假病毒检测体系检测血清样本
  • 2.1.1 血清样本检测结果
  • 2.1.2 小结
  • 2.2 假病毒检测体系检测抗HIV 药物
  • 2.2.1 应用假病毒检测体系检测抗HIV-1 药物
  • 2.2.2 假病毒检测体系与活病毒法在检测抗HIV 药物的比较
  • 2.2.3 小结
  • 参考文献
  • 博士期间论文发表情况
  • 致谢
  • 中文摘要
  • ABSTRACT
  • 导师简介
  • 作者简历
  • 相关论文文献

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