费氏丙酸杆菌维生素B12生物合成基因的克隆和解析

费氏丙酸杆菌维生素B12生物合成基因的克隆和解析

论文摘要

维生素B12是一种哺乳动物所必需的维生素,具有广泛的生理学作用,但是哺乳动物自身却不能合成,仅有某些特定的微生物才能合成维生素B12如杆菌,沙门氏菌,丙酸菌和假单胞菌。目前,工业上主要利用脱氮假单胞菌和费氏丙酸杆菌进行维生素B12的生产。由于费氏丙酸杆菌不产生任何毒素,被美国FDA认定为GRAS(Generlly reagard as safe),其发酵过程能耗低,染菌概率小。因此,费氏丙酸杆菌在维生素B12的发酵生产上占据了越来越重要的地位。为了详尽代谢过程,阐明合成途径,迄今为止,人们已经获得了大部分费氏丙酸杆菌维生素B12生物合成相关的基因,但是,应用费氏丙酸杆菌发酵生产维生素B12的生物合成途径仍不明确。本研究以费氏丙酸杆菌为出发菌株,克隆、解析了与维生素B12生物合成相关的部分基因。首先,应用遗传互补法,将费氏丙酸杆菌IFO12424株的染色体基因文库,电击转化到Salmonella typhimurium CobⅢ领域的缺失突变株TT10858中,进行p.freudenreichi CobⅢ领域维生素B12生物合成基因的筛选,结果得到了4206bp的DNA片段,命名为P4。解析结果表明,该片段包含了一个部分的和三个完整的读写框,依次为编码L-苏氨酸-O-3-磷酸盐脱羧酶的cobD,编码腺苷钴啉酰胺(AdoCbi)激酶和AdoCbi-P鸟苷酸转移酶的cobU,负责催化AdoCbi-GDP与α-ribazole连接,完成腺苷钴胺素(AdoCbI)最终合成的cobS,及编码转录调节蛋白的cobR。然后,根据所得cobD的碱基序列,设计相应引物,应用LA PCRTM in vitro Cloning Kit,获得了cobD上游3290bp的序列信息,命名为P3。经序列分析,发现此片段包含了编码钴啉酸a,c-二酰胺合成酶的cbiA、负责传递腺苷将钴啉胺酸a,c-二酰胺转化生成腺苷钴啉胺酸a,c-二酰胺的cobA,催化腺苷钴啉胺酸a,c-二酰胺酰胺化生成腺苷钴啉胺酸的cbiP以及cobD的上游区域。最后,将两者合并后得到全长为7308bp的DNA片段,命名为P7。经ORF检索和同源性分析,发现此片段包含了一个部分ORF和5个完整的ORF,依次为cbiP,cobA,cbiA(cbiA-cobD),cobU,cobS和cobR,它们编码的蛋白负责催化费氏丙酸杆菌发酵生产维生素B12过程中,从钴啉胺酸a,c-二酰胺到最终AdoCbI的生成。因此,发现这些基因为探索费氏丙酸杆菌维生素B12的生物合成途经将具有一定的理论意义。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 目录
  • 引言
  • 1 文献综述
  • 12简介'>1.1 维生素B12简介
  • 12的分子结构'>1.1.1 维生素B12的分子结构
  • 12的生理作用'>1.1.2 维生素B12的生理作用
  • 12的吸收代谢'>1.1.3 维生素B12的吸收代谢
  • 12的应用与前景'>1.1.4 维生素B12的应用与前景
  • 12的发现过程与来源'>1.2 维生素B12的发现过程与来源
  • 12的发现过程'>1.2.1 维生素B12的发现过程
  • 12的来源'>1.2.2 维生素B12的来源
  • 12的生产菌种及发酵生产'>1.3 维生素B12的生产菌种及发酵生产
  • 12的生产菌种'>1.3.1 维生素B12的生产菌种
  • 12发酵生产'>1.3.2 维生素B12发酵生产
  • 12的生物合成途径'>1.4 维生素B12的生物合成途径
  • 12的生物合成'>1.5 费氏丙酸杆菌维生素B12的生物合成
  • 12厌氧合成过程'>1.5.1 维生素B12厌氧合成过程
  • 12生物合成相关基因'>1.5.2 维生素B12生物合成相关基因
  • 1.6 国内外的研究进展
  • 12发酵生产的发展方向'>1.7 维生素B12发酵生产的发展方向
  • 1.8 本论文的研究意义及主要工作
  • 2 遗传互补法筛选P. freudenreichii未知的CobIII领域的基因
  • 2.1 引言
  • 2.2 材料和方法
  • 2.2.1 实验材料和仪器
  • 2.2.2 S. typhimurium感受态细胞的制备和检测
  • 2.2.3 遗传互补法筛选P. freudenreichii的CobIII领域的基因
  • 2.2.4 同源性检索
  • 2.3 结果与讨论
  • 2.3.1 遗传互补法筛选P. freudenreichii CobIII领域的基因
  • 2.3.2 P4的碱基序列分析
  • 2.3.3 讨论
  • 3 P. freudenreichii cobD上游基因的克隆和解析
  • 3.1 引言
  • 3.2 材料与方法
  • 3.2.1 实验材料与仪器
  • 3.2.2 准备工作
  • 3.2.3 丙酸菌染色体DNA的提取
  • 3.2.4 使用Cassette的LA PCR扩增反应
  • 3.2.5 目的片段的回收纯化和连接
  • 3.2.6 大肠杆菌受体细胞的制备
  • 3.2.7 蓝白斑筛选
  • 3.2.8 质粒的提取和酶切检测
  • 3.3 实验结果与讨论
  • 3.3.1 使用Cassette的LA PCR技术克隆cobD的上游基因
  • 3.3.2 碱基序列分析
  • 3.3.3 讨论
  • 结论
  • 参考文献
  • 附录 A P4的碱基序列
  • 附录 B P3的碱基序列
  • 附录 C P7的碱基序列
  • 攻读硕士学位期间发表学术论文情况
  • 致谢
  • 相关论文文献

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