核酸识体荧光光谱法研究及其关联数据库的构建

论文摘要

核酸识体（aptamer）是近年来发展起来的一类经体外人工进化程序筛选出的寡聚核苷酸。它能高效、特异地结合各种配体,具有易合成、易储存、易修饰等优点。核酸识体的出现突破了传统意义上关于核酸的功能只是遗传信息存储和转运载体的认识,以及与蛋白质特异识别的配体通常只能由抗体来完成的现状。核酸识体藉自身折叠成特有的空间结构与蛋白质、药物分子等特异高效地结合,其解离常数很小,可达nM或pM级。因此,越来越多的人关注核酸识体在分子检测、药物分子设计以及医疗诊断等方面的应用。目前,发展无须分离洗脱样品、在均相溶液中快速实时检测混合组分中靶分子的信号核酸识体是较为活跃的研究方向之一。荧光方法因其简单易行、灵敏度高、选择性好等优点逐渐成为最常用的分子检测方法。目前常用的是通过单标记及双标记荧光基团两种方法。例如通过检测靶分子诱导的荧光各向异性或荧光能量共振转移（FRET）变化来检测生理条件下癌蛋白PDGF-BB（platelet-derived growth factor BB）。但是标记荧光基团有可能会削弱核酸识体对配体的识别能力,而且实验的成本也会较高,尤其对于RNA核酸识体,标记荧光基团是较困难的。但是目前筛选出的核酸识体,大部分都是RNA核酸识体,使核酸识体在蛋白质的检测及生物传感器的应用方面受到限制。这样就非常需要发展各种非标记的分析方法。目前这方面的报道很少,而且方法也不具有普遍性。随着化学信息、生物信息如蛋白质序列等的持续增长,如何更好地表示、存贮、检索、传递、挖掘和利用这些信息资源已成为我们不可回避的问题。目

论文目录

• 摘要
• ABSTRACT
• 第一章 引言
• 1.1 核酸识体的研究及应用
• 1.1.1 核酸识体的筛选
• 1.1.2 核酸识体与配体的相互作用
• 1.1.3 核酸识体的应用
• 1.2 荧光光谱法在核酸研究中的应用
• 1.2.1 荧光发射的一般原理
• 1.2.2 溶液中荧光光谱特征
• 1.2.3 影响荧光强度的外界因素
• 1.2.4 核酸分子荧光探针
• 1.3 数据库在化学生物学科中的应用
• 1.4 本论文的选题意义
• 参考文献
• 第二章 利用荧光信号复合物aptamer/TOTO 检测癌蛋白PDGF
• 2.1 引言
• 2.2 实验部分
• 2.3 结果与讨论
• 2.4 小结
• 参考文献
• 第三章 RNA 信号核酸识体用于药物托普霉素的高灵敏度检测
• 3.1 引言
• 3.2 实验部分
• 3.3 结果与讨论
• 3.4 小结
• 参考文献
• 第四章 药物小分子托普霉素与RNA 核酸识体作用方式研究
• 4.1 引言
• 4.2 实验部分
• 4.3 结果与讨论
• 4.4 小结
• 参考文献
• 第五章 化学网络数据库在WEB 中的实现
• 5.1 引言
• 5.2 化学网络数据库的构建
• 5.3 小结
• 参考文献
• 第六章 傅立叶变换和支持向量机用于PDGF 家族分类与预测
• 6.1 引言
• 6.2 材料与方法
• 6.2.1 数据集
• 6.2.2 蛋白质频谱的建立
• 6.2.3 FFT（快速傅立叶变化）原理
• 6.2.4 支持向量机的基本原理
• 6.2.5 模型评估
• 6.3 结果与讨论
• 6.4 结论
• 参考文献
• 结论
• 在读期间已发表论文目录
• 致谢