棉花GhHB基因克隆和表达初步分析

棉花GhHB基因克隆和表达初步分析

论文摘要

同源异型域-亮氨酸拉链蛋白(homeodomain-leucine zipper protein,HD-Zip)是高等植物中特有的一类转录因子。研究表明,HD-zip对植物的早期发育起到至关重要的作用,如叶的发育、茎的延长以及在逆境条件下的生长调节等。我们从棉花cDNA文库中筛选出4个编码HD-Zip转录因子的基因,并对该基因进行了分子鉴定和表达分析,获得了如下的研究结果:1.从棉花(Gossypium hirsutum)中分离4个编码HD-Zip转录因子的基因,分别命名为GhHB(Gossypium hirsutum homeobox)1,GhHB2,GhHB3和GhHB4。蛋白质初级结构分析显示4个GhHB蛋白序列中都含有同源异型域(homeodomain,HD)和亮氨酸拉链区域(lecuine zipper region),且都含有多个蛋白激酶C磷酸化位点和酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点。2.进化树分析表明4个棉花与来自不同植物的40个HD-Zip蛋白质可分为2个进化大支,GhHB1,GhHB2,GhHB3和GhHB4分别位于这两个进化支上,且它们HD部分同源性比较分析也显示出它们在进化上的保守性。GhHB1,GhHB 2,GhHB 3和GhHB 4分别与OsHox3,HAT4,PpHB3和ANL2有最近的亲缘关系。3.提取棉花不同组织的总RNA,反转录得到cDNA。利用实时荧光定量PCR对4个基因的表达情况进行分析。结果显示,GhHB1,GhHB2,GhHB3初GhHB4都在根和下胚轴有较强的表达,其中GhHB4在叶中也有很大的表达量。这表明这些基因与棉花早期发育有关。同时,GhHB1在根中的表达受到了NaCl,ABA和GA3调控。4.利用DNA重组技术,将GhHB3基因插入到pPZP221和pBI121中,分别构建了过量表达载体(overexpression vector)和RNAi载体(supression vector)。利用农杆菌(Agrobacterium LBA4404)介导的转化方法,成功地将GhHB3转入到棉花中,现已经得到了大量的转化小苗,部分已被鉴定为阳性。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 本文缩写词
  • 一、前言
  • 1.高等植物中转录因子研究概况
  • 1.1 简介
  • 1.2 功能
  • 1.3 意义
  • 2.HD-Zip类转录因子
  • 2.1 HD-Zip简介
  • 2.2 HD-Zip结构特征
  • 2.3 HD-Zip分类
  • 2.4 HD-Zip功能
  • 2.5 展望
  • 3.研究目的和意义
  • 二、材料与方法
  • 1.实验材料
  • 1.1 植物材料
  • 1.2 菌种和质粒
  • 1.3 化学试剂
  • 1.4 工具酶
  • 1.5 常用储存液
  • 1.6 常用缓冲液
  • 1.7 培养基
  • 1.8 棉花总RNA的提取试剂
  • 1.9 PCR分析扩增试剂
  • 1.10 棉花总DNA抽提缓冲液
  • 1.11 仪器设备
  • 2.实验方法
  • 2.1 基因分离
  • 2.2 载体构建实验方法
  • 2.3 农杆菌介导的棉花转化
  • 2.4 棉花GDNA的提取
  • 2.5 核酸和蛋白质序列分析
  • 2.6 基因表达分析
  • 三、实验结果
  • 1.基因的生物信息学分析
  • 1.1 氨基酸的序列分析
  • 1.2 蛋白序列同源性分析
  • 1.3 分子进化分析
  • 2.基因的表达分析
  • 2.1 RNA提取
  • 2.2 RNA纯化及反转录
  • 2.3 Real-time PCR的引物设计
  • 2.4 Real-time PCR结果
  • 3.载体构建及棉花的转化
  • 3.1 Over expression载体构建及RNAi载体构建图
  • 3.2 棉花的转化与组培
  • 3.3 转化效率统计
  • 3.4 转化苗的鉴定
  • 四、讨论
  • 1.GhHB蛋白结构与其同源性及进化分析
  • 2.表达功能分析
  • 2.1 组织特异性表达
  • 2.2 高盐胁迫表达
  • 2.3 ABA胁迫表达
  • 2.4 GA胁迫表达
  • 3.载体构建
  • 4.棉花转化
  • 参考文献
  • 发表文章
  • 研究状况
  • 致谢
  • 相关论文文献

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