导读:本文包含了测序同源性分析论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:马流感病毒,基因组,同源性,分子生物学技术
测序同源性分析论文文献综述
赵钊,郭巍,关平原,王晓钧,吕洋[1]（2015）在《黑龙江省一株马流感病毒的全基因组测序及同源性分析》一文中研究指出通过采集一匹患病马的病料及后续的病毒分离、病毒核酸提取、RT-PCR、连接T载体等一系列分子生物学技术,对病毒核酸进行测序,经NCBI比对分析,获得一株H3N8亚型马流感病毒。将获得的毒株与我国分离的A/equine/Jilin/1/1989禽源性毒株、2002年美国肯塔基分离株A/equine/Kentucky/1/02(美洲谱系Florida亚型)、A/equine/Argentine/77(美洲谱系Argentine亚型)等有代表性毒株进行同源性分析,发现该毒株与Florida-2型马流感病毒基因片段的同源率最高。根据马流感病毒的命名规则,将这毒株命名为A/equine/Heilongjiang/1/2010。本次所分离到的黑龙江株马流感病毒,丰富了我国马流感病毒资源库,为我国马流感流行病学研究、诊断技术及疫苗研究提供了重要基础。(本文来源于《中国动物检疫》期刊2015年12期）
覃芳芸,白昀,冯淑萍,胡丽萍,马琳[2]（2014）在《广西猪链球菌2型毒力因子CPS基因的克隆测序与同源性分析》一文中研究指出本试验通过PCR方法对17株广西猪源猪链球菌2型(SS2)荚膜多糖(CPS)基因cps2J片段进行了扩增、克隆测序,同源性分析结果表明,17株广西SS2的cps2J基因核苷酸和氨基酸的同源性分别在91.9%~99.8%和89.1%~99.7%;菌株可以分为I群和II群,包括5株发病猪源菌株的16株菌均分在I群,II群只有GXWX193株。I群菌株的CPS基因核苷酸和氨基酸的同源性分别在96.8%~99.8%和94.6%~99.7%,与参考菌(荷兰Netherland、猪源菌株江苏ZYS8和四川SC17、人源菌株江苏98015)的核苷酸和氨基酸的同源性分别在96.4%~99.9%和94.1%~100%。II群菌株与参考菌株的核苷酸和氨基酸同源性分别在91.3%~92.4%和89.1%~91.0%。17株广西猪源SS2菌株的cps2J基因序列变异程度小。(本文来源于《现代畜牧兽医》期刊2014年06期）
郭书林,陈垚,陈信忠,龚艳清,杨俊萍[3]（2014）在《奥尔森派琴虫和北海派琴虫ITS基因测序及同源性分析》一文中研究指出通过设计能扩增奥尔森派琴虫和北海派琴虫ITS序列的特异性引物,对我国东南沿海8个地区养殖牡蛎中常见的两种派琴虫相应基因进行扩增、克隆和测序,并进行同源性分析。国内不同地区奥尔森派琴虫ITS序列的同源性超过99.3%,与国外分离株的同源性也在98.8%以上;种间同源性分析发现,奥尔森派琴虫与海水派琴虫和P.honshuensis的同源性较高,分别为94.2%和95.0%,与P.qugwadi的同源性最低,仅62.9%。深圳和叁亚分离的北海派琴虫ITS序列有18个碱基存在差异,其中ITS-1有3个碱基差异,ITS-2有15个碱基差异,而5.8S高度保守,没有碱基差异;北海派琴虫与其他种类之间的差异主要表现在ITS-1和ITS-2区域;同源性比较发现,北海派琴虫的同源性在100%-97.9%之间,其中深圳北海派琴虫的同源性较低,为97.9%。种间同源性分析表明,北海派琴虫与奥尔森派琴虫的同源性较高,为89.4%,其次为海水派琴虫和P.honshuensis,与P.qugwadi同源性最低,仅71.9%。(本文来源于《检验检疫学刊》期刊2014年01期）
杨霞,陈陆,许兰菊,刘红英,王川庆[4]（2006）在《鸡源志贺菌16SrRNA基因克隆、测序及同源性分析》一文中研究指出目的:建立鸡源志贺菌的16SrDNA序列分析方法从而进一步从基因水平鉴定鸡源鲍氏志贺菌。方法:用PCR扩增出鸡源鲍氏志贺菌16SrRNA的部分基因(16SrDNA)并测序,将所获得的序列与GenBank中人志贺菌序列相比较,计算种间相似性,并构建志贺菌的系统发育树,对分离株进行分类与鉴定。结果:首次研究发现鸡源志贺菌的16SrDNA序列与已知的人鲍氏志贺菌同源关系最近,同源性达99·7%,与人福氏志贺菌的同源性为96·0%。结论:16SrDNA序列分析鉴定志贺菌是一种快速、可靠的方法。(本文来源于《畜牧与兽医》期刊2006年09期）
杨瑞仪,曾庆平[5]（2005）在《马兜铃酪氨酸脱羧酶基因克隆、测序及同源性分析》一文中研究指出[目的]从中草药马兜铃中获得酪氨酸脱羧酶基因(tyrDC)互补DNA(cDNA)序列并进行同源性分析,以进一步达 到敲除tyrDC,减轻该药肾毒性的目的。[方法]参照已知的植物酪氨酸脱羧酶的保守性氨基酸序列设计简并引物,并通过 反转录聚合酶链反应(RT-PCR)从马兜铃中扩增出cDNA片段。将扩增的cDNA序列克隆并测序,用以设计特异引物,并 通过cDNA末端快速扩增(Rapid Amplification of cDNA Ends,RACE)从马兜铃中扩增出全长tyrDC cDNA。[结果]该克隆的 tyrDC cDNA的总长度为1 678 bp,包括一个编码516个氨基酸的1 551bp开读框(ORF)和一段127 bp的下游非翻译区 (3'UTR)。序列比较结果表明,由马兜铃tyrDC核苷酸序列推导的氨基酸序列分别与已发布的罂粟酪氨酸脱羧酶和唐松草酪 氨酸／多巴脱羧酶享有76％和79％的同源性。[结论]从马兜铃中扩增得到tyrDC cDNA全序列,且对酪氨酸脱羧酶的同源检 索显示,不同植物的酪氨酸脱羧酶之间都存在普遍的序列相似性。为去除马兜铃肾毒性奠定了基础。(本文来源于《广州中医药大学学报》期刊2005年02期）
王又红,余新炳,陈海峰,李学荣,罗树红[6]（2000）在《恶性疟原虫云南株PFD-3/YN pfs25基因的测序及同源性分析》一文中研究指出目的 了解恶性疟原虫云南株 PFD- 3/ YN pfs2 5基因序列变异情况。方法 PCR扩增恶性疟原虫云南株 PFD- 3/YN株 pfs2 5全基因 ,经 Sanger双脱氧链终止法测序和 Pst I酶切鉴定 ,并与国外恶性疟原虫 NF4株 pfs2 5进行比较。结果 恶性疟原虫云南株 PFD- 3/ YN株 pfs2 5基因与 NF4株的 pfs2 5基因其同源性为 99.2 %。结论 PFD- 3/ YN株与 NF4株 pfs2 5基因表现很高的同源性(本文来源于《中国人兽共患病杂志》期刊2000年06期）
沈际佳,蒋作君,余新炳,汪渊,汪学龙[7]（2000）在《日本血吸虫线粒体大亚基核糖体基因的亚克隆、测序及同源性分析》一文中研究指出目的将筛选日本血吸虫成虫cDNA文库得到基因克隆并测序。方法体外将以阳性克隆为模板的PCR产物和 pGEM T载体连接 ,转化大肠杆菌XL1 blue,经抗生素及生色底物X gal初筛 ,再用限制性内切酶酶切法进一步鉴定和用DNA自动测序仪测序。序列送blast基因服务站进行同源性分析。结果构建了3个含日本血吸虫cDNA基因片段的重组子 ,其中1个阳性克隆序列为编码日本血吸虫线粒体大亚基核糖体rRNA的基因序列 ,另2个序列与已知的日本血吸虫基因序列无同源性。结论获得了日本血吸虫线粒体大亚基核糖体rRNA基因片段 ,为进一步分析其一级结构和功能打下了基础。(本文来源于《细胞与分子免疫学杂志》期刊2000年04期）
沈际佳,蒋作君,余新炳,汪渊,汪学龙[8]（1999）在《编码日本血吸虫线粒体大亚基核糖体基因的亚克隆、测序及同源性分析》一文中研究指出目的筛选日本血吸虫成虫 cDNA 文库,得到基因克隆并测序。方法体外将以阳性克隆为模板的 PCR 产物和 pGEM-T 载体连接,转染大肠杆菌 XL1-blue,经抗生素及生色底物 X-gal 初筛,再用限制性内切酶酶切法进一步鉴定为重组质粒后,DNA 自动测序仪测序。序列送blast 基因服务站进行同源性分析。结果构建叁个含日本血吸虫 cDNA 基因片段的重组子,其中一个阳性克隆序列为编码日本血吸虫线粒体大亚基核糖体的基因序列。结论获得编码日本血吸虫线粒体大亚基核糖基因片段,为分析其作为候选重组疫苗分子的潜能打下基础。(本文来源于《热带病与寄生虫学》期刊1999年03期）
孙文宇,刘述先[9]（1998）在《编码肝片吸虫GST和猪蛔虫GST基因的测序及同源性分析》一文中研究指出目的：比较肝片吸虫ＧＳＴ（ＦｈＧＳＴ）、猪蛔虫ＧＳＴ（ＡｓＧＳＴ）基因与日本血吸虫２６ＧＳＴ（Ｓｊ２６ＧＳＴ）间的同源性。方法：以盐酸胍／氯化铯梯度超速离心法提取肝片吸虫和猪蛔虫的总ＲＮＡ，合成两对特异性引物，通过反转录－ＰＣＲ将所需的编码ＧＳＴ的ｃＤＮＡ扩增出来，并将ＰＣＲ产物直接测序。应用ＤＮＡＳＩＳ软件比较ＦｈＧＳＴ、ＡｓＧＳＴ基因与Ｓｊ２６ＧＳＴ间的同源性。结果：测序得到ＦｈＧＳＴ４０３ｂｐ片段和ＡｓＧＳＴ４１１ｂｐ片段。结论：ＦｈＧＳＴ和ＡｓＧＳＴ片段与Ｓｊ２６ＧＳＴ的ｃＤ－ＮＡ在核苷酸水平上的同源性分别为５９％和５４％，两片段间的同源性为５２％。(本文来源于《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》期刊1998年04期）
测序同源性分析论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
本试验通过PCR方法对17株广西猪源猪链球菌2型(SS2)荚膜多糖(CPS)基因cps2J片段进行了扩增、克隆测序,同源性分析结果表明,17株广西SS2的cps2J基因核苷酸和氨基酸的同源性分别在91.9%~99.8%和89.1%~99.7%;菌株可以分为I群和II群,包括5株发病猪源菌株的16株菌均分在I群,II群只有GXWX193株。I群菌株的CPS基因核苷酸和氨基酸的同源性分别在96.8%~99.8%和94.6%~99.7%,与参考菌(荷兰Netherland、猪源菌株江苏ZYS8和四川SC17、人源菌株江苏98015)的核苷酸和氨基酸的同源性分别在96.4%~99.9%和94.1%~100%。II群菌株与参考菌株的核苷酸和氨基酸同源性分别在91.3%~92.4%和89.1%~91.0%。17株广西猪源SS2菌株的cps2J基因序列变异程度小。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
测序同源性分析论文参考文献
[1].赵钊,郭巍,关平原,王晓钧,吕洋.黑龙江省一株马流感病毒的全基因组测序及同源性分析[J].中国动物检疫.2015
[2].覃芳芸,白昀,冯淑萍,胡丽萍,马琳.广西猪链球菌2型毒力因子CPS基因的克隆测序与同源性分析[J].现代畜牧兽医.2014
[3].郭书林,陈垚,陈信忠,龚艳清,杨俊萍.奥尔森派琴虫和北海派琴虫ITS基因测序及同源性分析[J].检验检疫学刊.2014
[4].杨霞,陈陆,许兰菊,刘红英,王川庆.鸡源志贺菌16SrRNA基因克隆、测序及同源性分析[J].畜牧与兽医.2006
[5].杨瑞仪,曾庆平.马兜铃酪氨酸脱羧酶基因克隆、测序及同源性分析[J].广州中医药大学学报.2005
[6].王又红,余新炳,陈海峰,李学荣,罗树红.恶性疟原虫云南株PFD-3/YNpfs25基因的测序及同源性分析[J].中国人兽共患病杂志.2000
[7].沈际佳,蒋作君,余新炳,汪渊,汪学龙.日本血吸虫线粒体大亚基核糖体基因的亚克隆、测序及同源性分析[J].细胞与分子免疫学杂志.2000
[8].沈际佳,蒋作君,余新炳,汪渊,汪学龙.编码日本血吸虫线粒体大亚基核糖体基因的亚克隆、测序及同源性分析[J].热带病与寄生虫学.1999
[9].孙文宇,刘述先.编码肝片吸虫GST和猪蛔虫GST基因的测序及同源性分析[J].中国寄生虫学与寄生虫病杂志.1998