13个绵羊品种遗传多样性的研究

论文摘要

本研究以中国10个地方绵羊品种泗水裘皮羊、太行裘皮羊、豫西脂尾羊、威宁绵羊、迪庆绵羊、昭通绵羊、腾冲绵羊、汉中绵羊、策勒黑羊、巴什拜羊和3个引进品种萨福克羊、特克赛尔羊、无角道赛特羊为研究对象,采用联合国粮农组织（FAO）和国际动物遗传学会（ISAG）联合推荐的11对微卫星DNA引物,以ABI3100-Avant全自动基因序列分析仪为平台,结合荧光-多重PCR技术,检测了10个中国地方绵羊和3个引进品种,共计725个个体的基因型,并对标记后扩增产物进行序列分析。通过计算等位基因数和频率、特有等位基因数、杂合度、多态信息含量、有效等位基因数、Nei氏遗传距离（DA）和Nei氏标准遗传距离（DS）,采用邻近结合法等聚类方法,分析了中国部分地方绵羊群体内和群体间的遗传变异。结果如下:1、在11个微卫星座位上共检测到了151个等位基因,每个座位平均等位基因是13.7个,OARFCB304座位的等位基因数最多,达到23个;OARAE129和SRCRSP9座位的等位基因数最少,只有9个;其余座位的等位基因数在1020个之间。13个绵羊品种中,平均等位基因数在59个,腾冲绵羊、萨福克羊、特克赛尔羊和无角道赛特羊的平均等位基因最少,巴什拜羊的平均等位基因数最多。13个绵羊品种的遗传多样性丰富,遗传变异较大。2、在13个绵羊品种中,共发现23个特有等位基因,除豫西脂尾羊、萨福克羊和特克赛尔羊没有特有等位基因,其他绵羊品种都至少在某一微卫星座位上有一特有等位基因,其中威宁绵羊和巴什拜羊的特有等位基因数最多,达到5个。13个中外绵羊品种在11个微卫星座位中的特有等位基因频率都比较低,策勒黑羊在OARFCB304座位上的157 bp特有等位基因频率最高（0.10）。3、13个绵羊品种在11个微卫星座位上,多态信息含量、群体杂合度和有效等位基因数,分别为0.4680.668,0.4520.635和1.00011.765。本研究所选用的11个微卫星座位中,3个属于中度多态座位,8个属于高度多态座位,可以用于绵羊的遗传多样性的分析研究。4、10个地方绵羊品种与3个引进品种之间有很大差异,两者之间的遗传距离较大。地方品种彼此之间的遗传距离都相对较小（DA=0.0700.206, DS=0.0410.244）,其中昭通绵羊和威宁绵羊之间的遗传距离最小（DA=0.070, DS=0.041）,3个引进品种萨福克羊、无角道赛特羊和特克塞尔羊与中国地方品种之间的遗传距离都较大（DA=0.1830.327, DS=0.1670.567）。5、13个绵羊品种聚为四大类:威宁绵羊、昭通绵羊、汉中绵羊和迪庆绵羊为第Ⅰ类;豫西脂尾羊、太行裘皮羊、泗水裘皮羊、巴什拜羊和策勒黑羊为第Ⅱ类;腾冲绵羊为第Ⅲ类;3个引进品种无角道赛特羊、萨福克羊和特克塞尔羊为第Ⅳ类。

论文目录

• 摘要
• ABSTRACT
• 第一章 文献综述
• 1.1 中国绵羊概况
• 1.1.1 中国绵羊在动物分类学上的地位
• 1.1.2 绵羊的起源
• 1.1.3 绵羊品种的类型
• 1.2 畜禽遗传资源保护理论及保种方法
• 1.2.1 保种理论
• 1.2.2 保种方法
• 1.3 畜禽遗传资源的评估方法
• 1.3.1 形态学水平
• 1.3.2 细胞学水平
• 1.3.3 生化水平
• 1.3.4 DNA 水平
• 1.4 微卫星标记
• 1.4.1 微卫星DNA 的含义及其分布
• 1.4.2 绵羊微卫星标记国内外研究概况
• 1.4.3 序列示踪微卫星位点
• 1.4.4 微卫星座位的多态性及其遗传特点
• 1.4.5 微卫星与其他标记
• 1.4.6 微卫星标记的特性
• 1.4.7 微卫星分析的方法
• 第二章 实验材料与方法
• 2.1 实验材料
• 2.1.1 实验动物
• 2.1.2 主要实验仪器设备
• 2.1.3 主要的常用试剂
• 2.1.4 ABI3100 使用的化学试剂
• 2.1.5 常用试剂的配制
• 2.2 实验方法
• 2.2.1 血样采集
• 2.2.2 绵羊基因组DNA 的提取及浓度检测
• 2.2.3 微卫星引物
• 2.2.4 PCR 扩增反应体系和反应条件
• 2.2.5 PCR 扩增产物的检测
• 2.2.6 微卫星DNA 多态性分析
• 2.2.7 统计分析方法及软件
• 第三章 结果与分析
• 3.1 基因组DNA 提取结果
• 3.2 ABI3100 遗传分析仪检测结果
• 3.3 等位基因数目和频率
• 3.4 特有等位基因及其频率
• 3.5 优势等位基因及其频率
• 3.6 共有等位基因
• 3.7 群体内的遗传变异检测结果
• 3.7.1 群体的有效等位基因数
• 3.7.2 期望遗传杂合度和观测遗传杂合度
• 3.7.3 多态信息含量
• 3.8 品种间的遗传变异检测
• 3.8.1 总群体杂合度、亚群体内杂合度和遗传分化系数
• 3.8.2 群体遗传距离
• 3.8.3 聚类分析
• 3.9 群体遗传分化
• 3.9.1 群体结构推测
• 3.9.2 群体间遗传分化的主成分分析
• 第四章 讨论
• 4.1 实验样本的代表性
• 4.2 微卫星座位的选择及其判型的准确性
• 4.3 关于荧光标记多重PCR
• 4.3.1 多重PCR 的定义
• 4.3.2 多重PCR 的优点
• 4.3.3 多重PCR 反应组合的筛选
• 4.3.4 多重PCR 反应体系和反应条件的优化
• 4.4 关于ABI3100-Avant 全自动基因序列分析仪
• 4.5 群体内的遗传变异
• 4.6 群体间遗传变异
• 4.7 聚类分析与遗传分化
• 第五章 结论
• 参考文献
• 致谢
• 作者简介