本文主要研究内容
作者王洁,张旭敏（2019）在《基于质谱的蛋白质N末端乙酰化程度定量方法的研究》一文中研究指出：随着质谱技术及各种定量方法的不断完善和发展,定量蛋白质组学的方法不断地被应用到各类生物学研究中。蛋白质组学定性定量数据的处理主要通过一些多功能的商业化或者开源软件来进行,如常用的数据分析软件Proteome Discoverer和Maxquant。但是在通过化学标记对蛋白质N末端乙酰化程度进行定量这一方面,Proteome Discoverer和Maxquant在一定程度上存在准确性不高和完整度不够的问题。于是本研究针对自己的实验特点,通过Java算法编写了相应的定量程序Acequant来完成N末端乙酰化程度的相对定量。本研究将该程序在已有相关报道的He La cell上进行了验证,Acequant共定量到1 587个蛋白质N末端,而Proteome Discoverer和Maxquant分别只定量到42个和306个N末端。同时,手动验证原始图谱也证实了Acequant定量的准确性更好。于是,本研究将此方法进一步应用到秀丽隐杆线虫N末端乙酰化的研究中,并初步发现了线虫整体的N末端乙酰化状态,为进一步的N末端研究提供了支持。
Abstract
sui zhao zhi pu ji shu ji ge chong ding liang fang fa de bu duan wan shan he fa zhan ,ding liang dan bai zhi zu xue de fang fa bu duan de bei ying yong dao ge lei sheng wu xue yan jiu zhong 。dan bai zhi zu xue ding xing ding liang shu ju de chu li zhu yao tong guo yi xie duo gong neng de shang ye hua huo zhe kai yuan ruan jian lai jin hang ,ru chang yong de shu ju fen xi ruan jian Proteome Discovererhe Maxquant。dan shi zai tong guo hua xue biao ji dui dan bai zhi Nmo duan yi xian hua cheng du jin hang ding liang zhe yi fang mian ,Proteome Discovererhe Maxquantzai yi ding cheng du shang cun zai zhun que xing bu gao he wan zheng du bu gou de wen ti 。yu shi ben yan jiu zhen dui zi ji de shi yan te dian ,tong guo Javasuan fa bian xie le xiang ying de ding liang cheng xu Acequantlai wan cheng Nmo duan yi xian hua cheng du de xiang dui ding liang 。ben yan jiu jiang gai cheng xu zai yi you xiang guan bao dao de He La cellshang jin hang le yan zheng ,Acequantgong ding liang dao 1 587ge dan bai zhi Nmo duan ,er Proteome Discovererhe Maxquantfen bie zhi ding liang dao 42ge he 306ge Nmo duan 。tong shi ,shou dong yan zheng yuan shi tu pu ye zheng shi le Acequantding liang de zhun que xing geng hao 。yu shi ,ben yan jiu jiang ci fang fa jin yi bu ying yong dao xiu li yin gan xian chong Nmo duan yi xian hua de yan jiu zhong ,bing chu bu fa xian le xian chong zheng ti de Nmo duan yi xian hua zhuang tai ,wei jin yi bu de Nmo duan yan jiu di gong le zhi chi 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自基因组学与应用生物学的王洁,张旭敏，发表于刊物基因组学与应用生物学2019年01期论文，是一篇关于定量蛋白质组学论文,质谱论文,化学标记相对定量论文,末端乙酰化论文,基因组学与应用生物学2019年01期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自基因组学与应用生物学2019年01期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
标签：定量蛋白质组学论文; 质谱论文; 化学标记相对定量论文; 末端乙酰化论文; 基因组学与应用生物学2019年01期论文;