西北肉用绵羊新品群陶滩寒组合的微卫星标记研究

西北肉用绵羊新品群陶滩寒组合的微卫星标记研究

论文摘要

本研究采用7个微卫星标记位点对西北肉用绵羊新品群中陶滩寒杂组合的父母本及杂交后代进行遗传结构、遗传变异及生长发育性状分析。同时,选择绵羊18号染色体上的4个微卫星位点MCM38、BMS1561、ILSTS0054、OY5,用单标记法研究微卫星位点与杂交后代滩寒F1羊和陶滩寒F1羊初生重、断奶重、成年重、体高、体长的遗传连锁关系。研究结果显示:(1)7个微卫星位点在5个群体中均得到了特异性扩增产物,共检测到116个等位基因,Hardy-weinberg平衡检验5个群体,除陶赛特羊在多数位点处于Hardy-weinberg平衡外,其他群体的位点都处于Hardy-weinberg不平衡,表明本试验选用的位点可以有效分析各群体的遗传变异。5个绵羊群体的平均多态信息含量(PIC)为0.7077~0.8396;平均位点杂合度为0.7454~0.8665;有效等位基因数为6.8949~7.9321,表明5个群体具有较高的遗传多样性,遗传变异大,选择潜力也大。(2)通过比较陶赛特羊与其他绵羊之间的遗传距离,并预测杂种优势。陶赛特羊与其他绵羊的遗传距离大小顺序为:Ds遗传距离滩寒F1(0.5756)、小尾寒羊(0.5536)、滩羊(0.5021);Da遗传距离滩寒F1(0.6285)、滩羊(0.5466)、小尾寒羊(0.5355)。表明陶赛特羊与滩寒F1羊的遗传距离最大,他们杂交,后代的杂种优势最大,从而在理论上验证了选择无角陶赛特为父本、滩羊和小尾寒羊的杂交后代滩寒F1为母本杂交的可行性和组合的理想性。(3)微卫星位点BMS1561、MCM38分别对滩寒F1和陶滩寒F1初生重、断奶重、成年重、体高、体长影响不显著(p>0.05)。(4)在连锁分析中,位点ILSTS0054不同基因型对滩寒F1羊初生重和成年重影响极显著(P<0.01),位点OY5不同基因型对滩寒F1羊体长影响极显著(P<0.01),位点OY5不同基因型对陶滩寒F1羊成年重和体长影响显著(P<0.05)。(5)位点ILSTS0054对应的基因型3(151135)成年重显著高于基因型2(151131)、基因型5(155137)及基因型6(157137);位点OY5对应的基因型8(145137)体长显著大于基因型9(147137)。据此推测在18号染色体上微卫星位点ILSTS0054和OY5附近分别可能存在影响绵羊新品群体重和体长的QTL,由于选取的微卫星位点和样本数量都比较少,ILSTS0054和OY5能否作为新品群的遗传连锁标记进行辅助选择育种,有待于进一步研究。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 第一章 文献综述
  • 1 国内外肉羊产业发展概况
  • 1.1 国外肉羊产业发展概况
  • 1.2 国内肉羊产业发展概况
  • 2 肉用绵羊分子育种研究方法
  • 2.1 转基因育种
  • 2.2 动物基因组育种
  • 3 微卫星标记在动物遗传育种中的应用
  • 3.1 微卫星标记的结构及类型
  • 3.2 微卫星作为分子遗传标记的优点
  • 3.3 微卫星在绵羊群体遗传学中的应用
  • 4 数量性状基因座(QTL)
  • 4.1 数量性状基因座(QTL)的含义
  • 4.2 QTL的研究进展
  • 4.3 QTL定位的方法
  • 5 本研究的目的和意义
  • 第二章 遗传变异微卫星标记研究
  • 1 材料与方法
  • 1.1 材料
  • 1.2 方法
  • 2 统计与分析
  • 2.1 等位基因频率、基因型频率
  • 2.2 Hardy-weinberg平衡状态检验
  • 2.3 遗传杂合度和平均遗传杂合度
  • 2.4 多态信息含量(PIC)
  • 2.5 有效等位基因数(Ne)
  • 2.6 Nei氏标准遗传距离(D)
  • 2.7 聚类分析
  • 3 结果与分析
  • 3.1 DNA的提取
  • 3.2 微卫星位点PCR扩增产物聚丙烯酰胺凝胶电泳图
  • 3.3 微卫星多态位点的等位基因及其频率
  • 3.4 哈代温博平衡检验
  • 3.5 多态信息含量(PIC)、杂合度(He)及有效等位基因数(Ne)
  • 3.6 各群体间的遗传距离
  • 3.7 聚类分析及系统进化树的构建
  • 第三章 生长发育性状的微卫星标记研究
  • 1 材料和方法
  • 1.1 材料
  • 1.2 PCR扩增、聚丙烯酰氨凝胶电泳及分析
  • 1.3 统计分析
  • 2 结果与分析
  • 2.1 PCR扩增结果
  • 2.2 基因型分析结果
  • 2.3 体重体尺的测量结果
  • 2.4 生长发育性状与微卫星连锁分析
  • 第四章 讨论与结论
  • 1 讨论
  • 1.1 样本的数量
  • 1.2 微卫星位点数目的选择
  • 1.3 实验中的关键
  • 1.4 品种的遗传多态性和选育背景的关系
  • 1.5 系统进化树构建
  • 1.6 杂种优势预测
  • 1.7 影响体重体尺的QTL的特点
  • 1.8 微卫星的选择
  • 1.9 单个遗传标记的QTL连锁分析
  • 2 结论
  • 参考文献
  • 致谢
  • 作者简历
  • 相关论文文献

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