慢病毒载体介导的siRNA/shRNA抑制禽流感病毒转基因鸡的研究

慢病毒载体介导的siRNA/shRNA抑制禽流感病毒转基因鸡的研究

论文摘要

本实验采用RNA干涉(RNAi)的方法开展抗禽流感病毒转基因鸡的研究,首先将禽流感病毒H9N2毒株核蛋白基因(NP)插入真核表达载体pL-EGFP中EGFP的上游,获得了NP-EGFP融合基因表达载体pL-NP-EGFP作为禽流感病毒siRNA筛选质粒,继而针对AⅣ各亚型核蛋白基因(NP)的保守序列,设计合成三对shRNA,并退火接入带有PolⅢH1启动子的干涉质粒(pSUPER-basic-H1),分别命名为:pSUPER-siNP1、pSUPER-siNP2、pSUPER-siNP3。重组质粒经双酶切鉴定并测序确认。将此干涉质粒与NP基因筛选质粒pL-NP-EGFP(NP/EGFP infusion gene)共转染鸡胚成纤维细胞,较其他两个干涉质粒,pSUPER-siNP3高效抑制了NP基因的表达,为进一步确认比较此重组质粒对AⅣ的抑制,本实验进行了禽流感hemagglutination(HA)滴度和TCID50测定,重复三次均获得相似结果,pSUPER-siNP3转染组H9N2的TCID50分别降为:10-5.00/0.1 mL;10-5.16/0.1mL;10-5.28/0.1mL;HA效价降为:1:4。而未转染干涉质粒禽流感病毒对照组TCID((50)为:10-8.50/0.1 mL,HA效价为:1:256。利用该高效干涉片段本实验构建了pLenti6-siNP3-EGFP慢病毒表达载体,并进一步确认比较了慢病毒表达质粒的干涉效果:pL-NPi-EGFP转染组H9N2的TCID50降为:10-5.16/0.1 mL,HA效价降为:1:4;而未转染干涉质粒禽流感病毒对照组H9N2的TCID50为:10-8.33/0.1 mL,HA效价为:1:256。最后将慢病毒表达载体与辅助质粒共转染293 FT细胞生产病毒颗粒。将病毒浓缩后胚下腔显微注射转染鸡胚,孵化率达10%(12/120),结果在检测的12只受体鸡胚胎中,有4只发生嵌合。

论文目录

  • 符号及缩略语等的说明
  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 第一部分 文献综述
  • 第一章 禽流感及对禽流感病毒的防治
  • 1 定义
  • 2 禽流感的历史及流行新特点
  • 2.1 禽流感的历史
  • 2.2 禽流感的流行新特点
  • 3 病原
  • 3.1 病原的分类和命名
  • 3.1.1 流感病毒的分类
  • 3.1.2 流感病毒的命名法则
  • 3.2 流感病毒的形态和结构
  • 3.3 流感病毒的化学组成
  • 4 禽流感病毒的分子生物学特征
  • 4.1 禽流感病毒的基因组成
  • 4.2 禽流感病毒基因编码蛋白功能
  • 4.2.1 聚合酶蛋白
  • 4.2.2 血凝素
  • 4.2.3 核蛋白
  • 4.2.4 神经氨酸酶
  • 4.2.5 基质蛋白
  • 4.2.6 非结构蛋白
  • 5 禽流感病毒的复制
  • 5.1 吸附、穿膜和蜕壳
  • 5.2 基因组的转录与复制
  • 5.3 病毒蛋白的合成
  • 5.4 病毒粒子的装配
  • 5.5 病毒的出芽和释放
  • 6 禽流感病毒的遗传变异
  • 7 禽流感病毒对理化因素的抵抗力
  • 8 禽流感的致病机理
  • 9 H9N2亚型禽流感
  • 9.1 H9N2 AIV的分子演化
  • 9.2 H9N2 AIV的受体特异性
  • 10 禽流感的流行病学
  • 10.1 发病季节
  • 10.2 传染源
  • 10.3 传播方式
  • 10.4 宿主范围
  • 10.5 易感日龄
  • 10.6 易感季节
  • 10.7 传播媒介
  • 10.8 潜伏期
  • 10.9 发病率和死亡率
  • 10.10 临床症状
  • 11 疫苗和药物预防禽流感
  • 第二章 LV-RNAi法预防禽流感
  • 1 LV载体的应用
  • 2 LV-siRNA技术
  • 第三章 转基因鸡的研究进展
  • 1 转基因鸡的制备方法
  • 1.1 慢病毒载体法
  • 1.2 原始生殖细胞介导法
  • 1.3 精子载体法
  • 1.4 显微注射法
  • 2 转基因鸡研究存在的问题
  • 3 本实验的目的和意义
  • 第二部分 试验研究
  • 第四章 禽流感病毒核蛋白基因(NP)siRNA筛选体系的建立
  • 1 材料与方法
  • 1.1 NP-eGFP融合基因表达载体的构建
  • 1.1.1 实验材料
  • 1.1.2 禽流感病毒的繁殖
  • 1.1.3 病毒RNA的提取
  • 1.1.4 RT-PCR反应
  • 1.1.5 PCR产物的回收与纯化
  • 1.1.6 pL-EGFP双酶切及载体片段的回收
  • 1.1.7 目的基因DNA产物的连接与转化
  • 1.2 CEF细胞的转染和表达产物的荧光检测
  • 1.3 NP基因表达的RT-PCR检测
  • 2 结果与分析
  • 2.1 融合基因表达载体pL-NP-EGFP的构建
  • 2.2 pL-NP-EGFP融合基因在CEF中的表达
  • 2.3 CEF细胞中pL-NP-EGFP基因表达的RT-PCR检测
  • 3 讨论
  • 第五章 质粒介导的siRNA/shRNA高效抑制A型禽流感复制靶位点的筛选
  • 1 材料与方法
  • 1.1 实验材料
  • 1.2 实验方法
  • 1.2.1 siRNA片段的设计
  • 1.2.2 单链寡核苷酸的退火
  • 1.2.3 干涉重组质粒的构建与鉴定
  • 1.2.4 重组质粒转化CEF
  • 1.2.5 禽流感病毒感染与病毒滴度测定
  • 2 结果与分析
  • 2.1 重组质粒的双酶切鉴定
  • 2.2 CEF中EGFP表达的荧光检测
  • 50及HA效价的测定'>2.3 pSUPER-siNP3转染CEF后AIV病毒TCID50及HA效价的测定
  • 3 讨论
  • 第六章 胚下腔显微注射具有高效抑制性的shRNA慢病毒干涉载体转染鸡胚生产转基因鸡
  • 1 材料与方法
  • 1.1 试验材料
  • 1.1.1 种蛋来源
  • 1.1.2 主要试剂
  • 1.1.3 主要仪器设备
  • 1.2 实验方法
  • 1.2.1 慢病毒转运载体质粒的构建
  • 1.2.2 慢病毒干涉载体质粒的构建
  • 1.2.3 慢病毒转运载体质粒的鉴定
  • 1.2.4 慢病毒干涉载体的鉴定
  • 1.2.5 进一步检测慢病毒干涉载体对禽流感NP基因的抑制作用
  • 1.2.6 病毒辅助质粒的扩增鉴定
  • 1.2.7 293FT细胞的培养
  • 1.2.8 病毒的生产
  • 1.2.9 病毒滴度分析
  • 1.2.10 病毒鸡胚注射
  • 1.2.11 转基因个体PCR分析
  • 2 结果
  • 2.1 病毒转运载体鉴定
  • 2.2 病毒干涉载体的扩增鉴定
  • 2.3 慢病毒干涉载体对AIV病毒的抑制
  • 2.4 病毒包装质粒的扩增鉴定
  • 2.5 病毒滴度分析
  • 2.6 病毒转染后细胞表型的变化
  • 2.7 病毒在不同细胞中的表达特征
  • 2.8 转基因个体PCR分析
  • 3 讨论
  • 参考文献
  • 附录
  • 1 主要试剂的配置
  • 1.1 PBS溶液
  • 1.2 0.25%胰蛋白酶
  • 1.3 抗生素的配置
  • 1.4 293FT细胞培养液的配置
  • 1.5 LB培养基配置
  • 1.6 质粒快速提取法所需试剂
  • 1.7 DNA提取所所需试剂
  • 2 主要附图
  • 2.1 三对RNA干涉片段的测序图
  • 2.2 主要质粒构建图
  • 2.2.1 干涉基本质粒的构建
  • 2.2.2 慢病毒转运载体的构建
  • 致谢
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