鸡产蛋相关基因多态性检测及其与蛋用性状的关联分析

论文摘要

品种是制约我国蛋鸡业发展的重要因素之一。产蛋性能和蛋品质性状是蛋鸡的重要经济性状,是影响蛋鸡业经济效益最重要的因素。但是,由于产蛋性能和蛋品质性状遗传力低,通过常规育种方法很难改进。分子标记辅助选择（MAS）的快速发展与应用,为低遗传力性状的改良提供了新的方法。本研究以湖北省欣华生态畜禽有限公司的欣华鸡E系为试验材料,鸡催乳素基因（prolactin, PRL）、血管活性肠肽基因（vasoactine intrestinal peptide, VIP）和促卵泡激素β亚基基因（follicle-stimulating hormoneβ, FSHβ）为鸡产蛋性能及蛋品质性状相关的侯选基因,采用PCR-SSCP、测序及PCR-RFLP等方法进行基因的多态性检测、SNP位点筛选和基因分型,并与鸡蛋用性状进行关联分析。本研究主要研究结果如下：1.VIP基因和FSHβ基因中分别发现了5个和4个SNP位点,且对PRL基因5’调控区的24bp插入/缺失突变、VIP基因5’调控区的A-3458G位点、FSHβ基因5’调控区的C-358T位点及其内含子2的T+259G位点进行了验证；2.对VIP基因5’调控区A-3458G位点、PRL基因24bp插入/缺失位点、FSHβ基因5’调控区的C-358T位点及其内含子2的T+259G位点等进行遗传平衡分析表明：VIP基因5’调控区A-3458G位点处于Hardy-Weinberg平衡状态,而其余三个位点偏离Hardy-Weinberg平衡状态；3.VIP基因5’调控区A-3458G位点,鸡的不同基因型与蛋形指数显著相关（P<0.05）,且AA基因型个体优于GG基因型个体,建议在育种过程中选择携带A等位基因的个体；4. FSHβ基因内含子2的T+259G位点,鸡的不同基因型与开产日龄、蛋白重、蛋白比例和哈氏单位均显著相关（p<0.05）,且TT基因型个体均优于GG基因型个体。FSHβ可以作为候选基因进行MAS育种,建议在育种过程中选择TT等位基因的个体以改良产蛋性状和蛋白品质性状。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 缩略语表
• 1. 前言
• 1.1 研究课题的由来
• 1.2 分子标记辅助选择（MAS）研究进展
• 1.2.1 分子标记研究进展
• 1.2.2 家禽分子标记辅助选择育种
• 1.3 本研究涉及的候选基因研究现状
• 1.3.1 催乳素基因
• 1.3.2 血管活性肠肽基因
• 1.3.3 促卵泡激素亚基基因
• 1.4 研究的目的与意义
• 2. 材料与方法
• 2.1 试验鸡群及数据采集
• 2.1.1 试验鸡群
• 2.1.2 数据采集
• 2.2 主要仪器设备
• 2.3 主要试剂及试剂的配制
• 2.3.1 主要试剂
• 2.3.2 主要试剂的配制
• 2.4 主要实验方法与步骤
• 2.4.1 鸡基因组DNA的提取与检测
• 2.4.2 PCR扩增条件及产物检测
• 2.4.3 PCR产物酶切体系及检测
• 2.4.4 聚丙烯酰胺凝胶电泳与银染检测
• 2.4.5 PCR产物的克隆回收测序
• 2.4.6 候选基因的多态性检测
• 2.5 主要分子生物学软件和数据统计分析软件
• 2.6 统计分析
• 2.6.1 基因型频率和等位基因频率的统计
• 2.6.2 Hardy-Weinberg群体遗传平衡检验及卡方适合性检验
• 2.6.3 基因型和产蛋性状及蛋品质性状的关联分析
• 3. 结果与分析
• 3.1 基因组DNA提取
• 3.2 PRL基因24bp插入/缺失及其与蛋用性状的关联分析
• 3.2.1 PRL基因PCR扩增及基因分型
• 3.2.2 PRL基因型频率和基因频率
• 3.2.3 PRL基因5'调控区基因型与蛋用性状的关联分析
• 3.3 VIP基因5'SNP及其与蛋用性状的关联分析
• 3.3.1 VIP3a引物的多态性检测及与蛋用性状的关联分析
• 3.3.2 VIP6引物的多态性检测及与蛋用性状的关联分析
• 3.3.3 VIP9引物的多态性检测及与蛋用性状的关联分析
• 3.4 FSHβ基因SNP检测及其与蛋用性状的关联分析
• 3.4.1 FSHβ1引物的多态性检测及与蛋用性状的关联分析
• 3.4.2 FSHβ2引物的多态性检测及与蛋用性状的关联分析
• 3.4.3 FSHβ3引物的多态性检测及与蛋用性状的关联分析
• 4. 讨论
• 4.1 PRL基因遗传效应分析
• 4.2 VIP基因遗传效应分析
• 4.3 FSHp基因遗传效应分析
• 5. 小结
• 5.1 主要研究结果
• 5.2 本研究特色
• 5.3 本研究不足之处及下一步设想
• 参考文献
• 致谢