导读:本文包含了微卫星标记物论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:圆口铜鱼,微卫星,亲子鉴定
微卫星标记物论文文献综述
何勇凤,朱永久,吴兴兵,龚进玲,杨德国[1]（2019）在《基于微卫星标记的圆口铜鱼亲子鉴定技术》一文中研究指出为快速有效地鉴别不同的圆口铜鱼家系及来源,研究从已发表的40个微卫星标记中筛选出20个多态性较高且稳定扩增的微卫星位点,通过对8个圆口铜鱼家系339尾个体进行微卫星基因分型检测,建立了圆口铜鱼荧光微卫星标记与多重毛细管电泳相结合的亲子鉴定技术。遗传多样性分析结果显示,圆口铜鱼8个家系群体的平均等位基因数(N_a)为9个,平均多态信息含量(PIC)为0.616,平均期望杂合度(H_e)为0.659,平均观测杂合度(H_o)为0.691,其中子一代群体的遗传多样性水平明显低于亲本群体。亲子鉴定分析结果显示,当双亲基因型未知时其单亲累积排除概率(CE-1P)为0.99954473,当单亲基因型已知时其累积排除概率(CE-2P)为0.99999825,当双亲基因型未知时其双亲累积排除概率(CE-PP)为1.00000000,当使用20个微卫星位点进行亲子鉴定时, 297尾子一代均能正确找到其父母本,亲子鉴定准确率为100%。由此可见,研究建立的圆口铜鱼亲子鉴定技术是可靠的,能为圆口铜鱼的家系管理、种群遗传管理和增殖放流效果评估提供科学依据(本文来源于《水生生物学报》期刊2019年06期）
曾可为,宋文,王青云,夏儒龙,王守荣[2]（2019）在《基于微卫星标记的鳜种质遗传多样性与群体遗传结构分析》一文中研究指出采用Illumina高通量测序技术对鳜(Siniperca chuatsi)性腺转录组进行分析,筛选获得可设计引物的微卫星序列4 986条。随机合成239对微卫星引物,其中27个微卫星标记(11.30%)在12个鳜群体中呈现多态性,等位基因数2～8(5.63±1.84),有效等位基因数1.86～6.80(3.99±1.56),观测杂合度0.21～0.78(0.49±0.16),期望杂合度0.46～0.85(0.71±0.12),平均多态信息量0.37～0.84(0.66±0.15),基因流0.11～2.14(0.67±0.45)。在12个鳜群体中,嘉鱼群体平均等位基因数和平均有效等位基因数最大;武汉群体平均观测杂合度、平均期望杂合度高;12个群体遗传距离为0.103 0～1.511 7,遗传相似系数为0.220 5～0.902 2;抚远群体和顺德群体间的遗传距离最大(1.511 7),遗传相似系数最小(0.220 5);韶关群体和顺德群体间的遗传距离最小(0.103 0),遗传相似系数最大(0.902 2);UPGMA聚类分析显示珠江水系一支与长江水系一支先聚集后再与黑龙江水体支汇聚;12个群体间的遗传分化系数F_(ST)介于0.041 8～0.611 0,群体间的遗传分化达到了显着性水平(P<0.05),梁子湖群体与武汉群体间的F_(ST)最小(0.041 8),顺德群体与抚远群体间的F_(ST)最大(0.611 0);AMOVA分析表明:群体间的遗传变异占33.14%,群体内遗传变异占66.86%;Structure分析显示12个群体可分为5个亚群。(本文来源于《华中农业大学学报》期刊2019年06期）
冯晓婷,杨习文,杨雪军,刘熠,周彦锋[3]（2019）在《基于微卫星标记对长江江苏段鳙增殖放流效果评估》一文中研究指出为评估长江江苏段鳙(Aristichthysnobilis)增殖放流效果,本研究基于微卫星标记的亲子鉴定技术,选用10对扩增效果稳定的微卫星荧光标记引物,结合毛细管电泳对江苏省内良种场563尾鳙亲鱼和长江江苏段687尾回捕鳙进行基因分型,并对位点多态性及亲子鉴定结果进行了分析。结果表明,各位点等位基因介于19～55之间,其观测杂合度为0.530～0.909(平均值为0.748),期望杂合度为0.818～0.929(平均值为0.882),多态性信息含量为0.797～0.924 (平均值为0.871); Cervus3.0模拟结果显示,当双亲未知且置信度为95%时, 10个微卫星位点的累积非亲权排除率为99.996%。亲子鉴定结果发现,所有回捕鳙中有42尾与亲本之间存在亲子关系,被确认来源于鳙增殖放流群体,并由此推算此次评估亲本的放流子代对长江江苏段野生群体的贡献率为6.11%。结果显示该研究进行的鳙亲子鉴定技术可为长江鳙增殖放流效果评估工作提供可靠的数据支撑,为长江渔业资源管理提供参考资料。(本文来源于《中国水产科学》期刊2019年06期）
阙延福,胥贤,徐念,黄晋,李伟涛[4]（2019）在《基于微卫星标记的唇■亲子鉴定技术研究》一文中研究指出为进一步研究基于标记的唇■Hemibarbus labeo苗种放流效果评估工作,以安谷水电站鱼类增殖放流站实际工作中的两个唇■家系为研究对象,采用6个多态性微卫星标记对两个唇■家系开展了亲子关系鉴定分析。结果显示:6个微卫星标记共检测出37个等位基因,观测杂合度和期望杂合度分别为0.361～0.952(平均值为0.776)和0.302～0.795(平均值为0.589);多态信息含量为0.262～0.767(平均值为0.526);Cervus软件分析显示,在双亲均未知的情况下,唇■6个微卫星位点的累计非亲权排除率(CEP)为99.09%;两个家系中的72个子代个体,正确分配到对应家系父母本(12个亲本)的总体比例为95.83%。研究表明,本研究中采用微卫星标记方法来开展唇■家系亲子鉴定的分析,可为唇■的增殖放流效果评估提供技术支撑。(本文来源于《大连海洋大学学报》期刊2019年05期）
丁勇,尚金男,徐怡亮,丁月云,崔文竹[5]（2019）在《利用微卫星标记分析安徽地方种猪的遗传多样性》一文中研究指出【目的】通过微卫星标记评估8个安徽地方猪品种的遗传多样性。【方法】采用PCR和聚丙烯酰胺凝胶电泳对FAO-ISAG联合推荐的15个微卫星标记进行分型,并计算有效等位基因数(Ne)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)、F统计量和遗传距离等参数,探讨品种间的遗传多样性和遗传关系。【结果】15个微卫星标记共检测到272个等位基因,平均有效等位基因数9.561 2个。8个品种的有效等位基因数在2.445 1～3.786 6之间,期望杂合度在0.532 0～0.714 8之间,多态信息含量在0.369 8～0.890 6之间。F统计量和基因流(Nm)分析表明:安徽地方猪品种间存在一定程度的近交和基因流动。基于Nei氏遗传距离(Ds)构建系统发生树显示:8个地方猪种可分为两类:一类为皖南花猪;另一类又聚为两小支,一小支为安庆六白猪、圩猪和霍寿黑猪,另一小支为皖北猪、皖南黑猪、枞阳黑猪和定远猪。【结论】8个安徽地方猪种遗传多样性丰富,群体内存在一定程度的近交和基因流动。结果为安徽地方猪种的保护和利用提供了理论依据。(本文来源于《云南农业大学学报(自然科学)》期刊2019年05期）
商鹏,郭新颖,张健,吴绿草,段梦琪[6]（2019）在《藏马微卫星标记遗传多样性研究》一文中研究指出为研究西藏藏马种群的微卫星多态性,应用生物素标记的微卫星探针与藏马基因组酶切片段杂交,通过链霉亲和素包被的磁珠捕获150～1 000 bp含有微卫星序列的DNA片段,连接到pEASY-T1载体中,构建藏马基因组微卫星富集文库。结果表明:从2 380个转化子中随机挑取112个阳性克隆进行测序后,经筛选比对发现,从62个微卫星中筛选出39个在马属基因组卫星库中未被检测到的微卫星;成功设计了10对藏马微卫星引物,经聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)方法检测到3个具有多态性的微卫星标记,其中有2个多态性信息含量(PIC)值均大于0.5。因此,这3个微卫星标记可应用于藏马遗传多态性检测、种群遗传结构等方面研究,为藏马遗传连锁图谱的构建、辅助育种、群体遗传学分析、基因组结构分析以及分子进化研究等提供依据。(本文来源于《中国农业大学学报》期刊2019年09期）
吴仁协,翟云,肖瑶,牛素芳,张浩冉[7]（2019）在《黄鳍棘鲷微卫星标记开发及其在鲷科鱼类中的跨物种扩增》一文中研究指出采用基于高通量测序平台的SLAF-seq技术,开发出47个高多态性的黄鳍棘鲷(Acanthopagrus latus)微卫星标记,其中二碱基重复位点17个,叁至六碱基重复位点30个。各位点的等位基因数为2～27(均值为10),观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)分别为0. 156～0. 938(均值为0. 682)和0. 177～0. 963(均值为0. 741),多态信息含量(PIC)为0. 166～0. 946(均值为0. 705)。经Bonferroni校正后,有43个位点符合哈迪-温伯格平衡(HWE),其余4个位点偏离HWE。这些多态性微卫星标记为黄鳍棘鲷遗传资源研究提供新的有效分子标记。跨物种扩增结果显示,共有31个黄鳍棘鲷微卫星标记可在9种鲷科鱼类中成功扩增。其中17个标记在太平洋棘鲷(Acanthopagrus pacificus)、黑棘鲷(Acanthopagrus schlegelii)和澳洲棘鲷(Acanthopagrus australis)中具有较好的通用性,这些标记可为棘鲷属(Acanthopagrus)的系统进化和种群遗传学分析提供新的标记来源;另有3个标记在二长棘梨齿鲷(Evynnis cardinalis)、真赤鲷(Pagrus major)、蓝点赤鲷(Pagrus caeruleostictus)及黄牙鲷(Dentex hypselosomus)中具有通用性。(本文来源于《应用海洋学学报》期刊2019年03期）
谢苏,沈永巧,陈焱森,黄涛[8]（2019）在《利用微卫星标记进行猪亲子鉴定》一文中研究指出以杜洛克猪、长白猪、大白猪3个品种的48头系谱清楚的猪为样本,使用PAGE法从55个微卫星位点中筛选出扩增效果好、多态性丰富且便于进行多重PCR扩增的位点,对试验样本逐一进行基因分型,并据此进行亲权确认,建立一种高效的亲子鉴定方法。结果显示,试验选取的14个微卫星位点在48个样本中进行排父率分析,在双亲未知、只知单亲和双亲已知的情况下计算的累积排父率分别为0.978 5,0.998 4,0.999 99;利用建立的亲子鉴定体系对样本中8个家系进行检测,结果累积排父率均大于99.99%。结果表明,试验构建的微卫星标记体系,为亲本信息不明的个体进行亲子关系的验证,纠正潜在的错误系谱,建立完整、准确的系谱体系,保证育种值估计的准确性,保障猪育种工作的正常开展具有非常重要的意义。(本文来源于《中国兽医学报》期刊2019年08期）
赵彦花,区又君,温久福,李加儿,周慧[9]（2019）在《基于微卫星标记的黄唇鱼遗传多样性研究》一文中研究指出文章利用微卫星标记对珠江口海域19个黄唇鱼(Bahaba flavolabiata) DNA样品进行了遗传多样性研究,以期为黄唇鱼的种质鉴定和保育等研究奠定基础。结果显示,29个微卫星位点的等位基因数(N_a)分别为2～7个,等位基因总数为121个,平均等位基因数为4.17个。有效等位基因数(N_e)介于1.060 6～6.056 1,总和为85.205 0。平均观测杂合度(H_o)和平均期望杂合度(H_e)分别为0.659 3和0.597 3。多态性信息含量(PIC)介于0.055 5～0.813 7,平均值为0.542 3,其中19个位点表现出高度多态性。5个位点显着偏离Hardy-Weinberg平衡(校正P≤0.036)。基因丰富度(R_s)介于2～6.976,总和为119.638。基因多样性(GD)介于0.059～0.856。这些数据显示黄唇鱼群体遗传多样性处于较高水平。(本文来源于《南方水产科学》期刊2019年04期）
王敏,张新浩,崔冉,刘宇,杨莉[10]（2019）在《利用微卫星标记鉴定德州驴亲子关系》一文中研究指出试验旨在建立一套适用于德州驴亲子关系的鉴定体系。选取13个微卫星基因座作为标记,采集了53头德州驴血液样本,其中子代驴驹16头,候选父本13头,候选母本24头,用酚-仿法抽提血液基因组进行PCR扩增和基因扫描,并利用Peak Scanner Software v1.0软件读取基因型分型结果。对微卫星基因座的遗传多样性进行分析,利用似然法(Cervus 3.0软件)和排除法对个体间的亲子关系进行了鉴定。结果显示,13个微卫星基因座的平均等位基因数、平均观测杂合度(Ho)、平均期望杂合度(He)和平均多态信息含量(PIC)分别为6.846、0.689、0.671和0.625。期望杂合度与观测杂合度之差在0.002～0.088之间,差值较小。13个微卫星基因座的累计排除概率(EP)达到0.990以上。微卫星基因座具有高度多态性和较高的排除概率,适用于遗传分析和个体鉴定。利用Cervus 3.0软件基于似然法分析得到了16头子代驴驹的最似亲本,结合排除法对这16头驴驹及其最似亲本进行基因型比对,最终在53头德州驴中确定了11个亲子对。本试验建立了以13个微卫星位点作为核心标记,将似然法和排除法相结合作为主要分析方法的德州驴亲子关系鉴定体系,为育种工作提供参考资料。(本文来源于《中国畜牧兽医》期刊2019年07期）
微卫星标记物论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
采用Illumina高通量测序技术对鳜(Siniperca chuatsi)性腺转录组进行分析,筛选获得可设计引物的微卫星序列4 986条。随机合成239对微卫星引物,其中27个微卫星标记(11.30%)在12个鳜群体中呈现多态性,等位基因数2～8(5.63±1.84),有效等位基因数1.86～6.80(3.99±1.56),观测杂合度0.21～0.78(0.49±0.16),期望杂合度0.46～0.85(0.71±0.12),平均多态信息量0.37～0.84(0.66±0.15),基因流0.11～2.14(0.67±0.45)。在12个鳜群体中,嘉鱼群体平均等位基因数和平均有效等位基因数最大;武汉群体平均观测杂合度、平均期望杂合度高;12个群体遗传距离为0.103 0～1.511 7,遗传相似系数为0.220 5～0.902 2;抚远群体和顺德群体间的遗传距离最大(1.511 7),遗传相似系数最小(0.220 5);韶关群体和顺德群体间的遗传距离最小(0.103 0),遗传相似系数最大(0.902 2);UPGMA聚类分析显示珠江水系一支与长江水系一支先聚集后再与黑龙江水体支汇聚;12个群体间的遗传分化系数F_(ST)介于0.041 8～0.611 0,群体间的遗传分化达到了显着性水平(P<0.05),梁子湖群体与武汉群体间的F_(ST)最小(0.041 8),顺德群体与抚远群体间的F_(ST)最大(0.611 0);AMOVA分析表明:群体间的遗传变异占33.14%,群体内遗传变异占66.86%;Structure分析显示12个群体可分为5个亚群。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
微卫星标记物论文参考文献
[1].何勇凤,朱永久,吴兴兵,龚进玲,杨德国.基于微卫星标记的圆口铜鱼亲子鉴定技术[J].水生生物学报.2019
[2].曾可为,宋文,王青云,夏儒龙,王守荣.基于微卫星标记的鳜种质遗传多样性与群体遗传结构分析[J].华中农业大学学报.2019
[3].冯晓婷,杨习文,杨雪军,刘熠,周彦锋.基于微卫星标记对长江江苏段鳙增殖放流效果评估[J].中国水产科学.2019
[4].阙延福,胥贤,徐念,黄晋,李伟涛.基于微卫星标记的唇■亲子鉴定技术研究[J].大连海洋大学学报.2019
[5].丁勇,尚金男,徐怡亮,丁月云,崔文竹.利用微卫星标记分析安徽地方种猪的遗传多样性[J].云南农业大学学报(自然科学).2019
[6].商鹏,郭新颖,张健,吴绿草,段梦琪.藏马微卫星标记遗传多样性研究[J].中国农业大学学报.2019
[7].吴仁协,翟云,肖瑶,牛素芳,张浩冉.黄鳍棘鲷微卫星标记开发及其在鲷科鱼类中的跨物种扩增[J].应用海洋学学报.2019
[8].谢苏,沈永巧,陈焱森,黄涛.利用微卫星标记进行猪亲子鉴定[J].中国兽医学报.2019
[9].赵彦花,区又君,温久福,李加儿,周慧.基于微卫星标记的黄唇鱼遗传多样性研究[J].南方水产科学.2019
[10].王敏,张新浩,崔冉,刘宇,杨莉.利用微卫星标记鉴定德州驴亲子关系[J].中国畜牧兽医.2019