论文摘要
目的:p53是一种抑癌基因,在调控细胞周期、维持细胞稳定等方面具有重要作用。50%左右恶性肿瘤的发生都与p53基因的突变或缺失相关。近年来,MDM2(mouse double minute 2)和53BP1(p53 binding protein 1)作为p53的相关蛋白日益受到人们的重视。它们可以直接或间接影响p53的功能。本课题研究了MDM2启动子区SNP309、Del1518以及53BP1启动子区T885G、外显子区P909L、W1488G基因多态性,与中国河北高发区人群食管鳞癌(esophageal squamous cell carcinoma, ESCC)和贲门腺癌(gastric cardiac adenocarcinoma, GCA)遗传易感性的关系。方法:采用基于人群的病例-对照研究方法,对563例肿瘤患者(351例ESCC,212例GCA)和642例健康对照个体,分别采集静脉抗凝血5ml,同时记录其病史、个人史、肿瘤家族史。以蛋白酶K消化—饱和氯化钠盐析法提取外周血白细胞DNA,分别采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析(polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism analysis,PCR-RFLP)和引物引入限制性内切酶分析-聚合酶链反应(primer-introduced restriction analysis-polymerase chain reaction, PIRA-PCR)的方法检测MDM2和53BP1相关多态性位点的基因型。数据统计分析采用SPSS11.5版软件包(SPSS Company,Chicago, Illinois, USA)进行, P<0.05认为有统计学意义。对各个基因型在健康对照组中的分布情况进行Hardy-Weinberg平衡分析(http:// www.kursus.kvl.dk/shares/vetgen/Popgen/ genetik/applets/kitest.htm)。病例组与对照组的基因型分布比较采用行×列表卡方检验。单体型频率及连锁不平衡分析采用EH软件和2LD软件(1.2 version,Rockefeller University,New York)。以非条件Logistic回归法计算经性别、年龄、吸烟状况和UGIC家族史多因素校正的相对风险度比值比(odds ratio,OR)及其95%可信区间(confidence interval,CI)。结果:1 MDM2 SNP309、Del1518与ESCC和GCA的关系1.1 ESCC和GCA患者组中上消化道肿瘤( upper gastrointestinas cancers,UGIC)家族史阳性者的比例(分别为47%和49.1%)显著高于健康对照组(34.4%)(χ2=15.13, P=0.00;χ2=14.48,P=0.00)。ESCC和GCA患者组的吸烟者比例(分别为39.9%和46.7% )与健康对照组(42.8%)相比均无显著性差异(χ2=0.81,P=0.37;χ2=0.97,P=0.33)。1.2健康对照组、ESCC组和GCA组中的MDM2、53BP1各多态位点的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。MDM2 SNP309和Del1518基因型频率在ESCC与健康对照组间无显著性差异(P >0.05)。而在GCA组中,携带MDM2 SNP309T等位基因的基因型(G/T+T/T)频率(52.8%)和携带Del1518-等位基因的基因型(+/- + -/-)频率(37.7%)明显低于健康对照组(分别为64.8%和51.7%)(χ2=9.67,P=0.00;χ2=12.47,P=0.00)。与SNP309 G/G基因型相比,携带T等位基因的基因型(G/T+T/T)可降低总体GCA的发病风险,经性别、年龄、吸烟状况和UGIC家族史多因素校正后的OR值为0.62(95%CI=0.45~0.87);与Del1518+/+基因型相比,携带Del1518-等位基因的基因型(+/- + -/-)可降低总体GCA的发病风险,经性别、年龄、吸烟状况和UGIC家族史多因素校正后的OR值为0.57(95%CI=0.41~0.78)。1.3根据个体吸烟状况分层分析发现,与MDM2 SNP309 G/G基因型相比,携带T等位基因的基因型(G/T+T/T)可降低非吸烟组GCA的发病风险,经性别、年龄和UGIC家族史校正后的OR值为0.50(95%CI=0.32~0.77);与+/+基因型相比,携带Del1518-等位基因的基因型(+/- + -/-)可降低非吸烟组GCA的发病风险,经性别、年龄和UGIC家族史校正后的OR值为0.52(95%CI=0.330.80)。该分层分析未发现MDM2 SNP309和Del1518对ESCC发病风险的影响。1.4根据有无UGIC家族史分层分析发现,与MDM2 SNP309 G/G基因型相比,携带T等位基因的基因型(G/T与T/T)可降低UGIC家族史阳性个体GCA的发病风险,经性别、年龄和吸烟状况校正后的OR值为0.53 (95%CI=0.33~0.86),而不影响UGIC家族史阴性个体GCA的发病风险;与+/+基因型相比,携带Del1518-等位基因的基因型(+/- + -/-)可分别降低UGIC家族史阳性和阴性组GCA的发病风险,经性别、年龄和吸烟状况校正后的OR值分别为0.59(95%CI=0.37~0.96)和0.56(95%CI=0.36~0.86)。但该分层分析未发现MDM2 SNP309和Del1518对ESCC发病风险的影响。1.5应用EH和2LD软件对MDM2 SNP309和Del1518位点进行联合分析显示,两个多态性位点间存在连锁不平衡现象(D’=0.76,χ2=440.41, P=0.00)。SNP309G等位基因型易与Del1518+等位基因型连锁。MDM2单体型在GCA和健康对照组间存在显著性差异(χ2=20.44, P=0.00),而在ESCC组和健康对照组间分布相似(P>0.05)。与SNP309G/Del1518+单体型相比,携带SNP309T/Del1518-单体型可显著降低GCA的发病风险,OR值为0.51(95% CI=0.38~0.70)。2 53BP1 P909L、W1488G、T885G与ESCC和GCA关系2.1 ESCC、GCA患者组中上消化道肿瘤( upper gastrointestinas cancers,UGIC)家族史阳性者的比例(分别为47.3%和46.2%)显著高于健康对照组(34.6%)(χ2=15.09, P=0.00;χ2=10.83,和P=0.00)。ESCC和GCA患者组的吸烟者比例(分别为40.1%和48.0% )与健康对照组(43.0%)相比均无显著性差异(χ2=0.77,P=0.38;χ2=1.95,P=0.16)。2.2 53BP1外显子区P909L和W1488G在健康对照组、ESCC和GCA患者组中均只存在单一的等位基因,不适于疾病的筛查工作。53BP1启动子区T885G基因型总体分布在ESCC、GCA患者组及健康对照组均无显著性差异(P >0.05)。2.3根据个体吸烟状况和有无UGIC家族史分层分析均未发现53BP1 T885G对ESCC和GCA发病风险的影响(P>0.05)。2.4将53BP1 T885G与P53 Arg72Pro联合分析显示,在携带Pro等位基因(Arg/Pro+Pro/Pro)组中,53BP1 T885G的G/G基因型可降低GCA的发病风险(OR值经多因素校正后为0.74,95%CI=0.570.95),而不影响ESCC的发病风险。结论:1上消化道肿瘤家族史明显增加ESCC、GCA的发病风险。2与MDM2 SNP309 G/G基因型相比,携带T等位基因的基因型(G/T与T/T)可降低总体GCA的发病风险。3与MDM2 Del1518+/+基因型相比携带Del1518-等位基因的基因型(+/-与-/-)可降低总体GCA的发病风险。4 MDM2 SNP309和Del1518位点间存在连锁不平衡,SNP309G等位基因型易与Del1518+等位基因型连锁。与SNP309G/Del1518+单体型相比,携带SNP309T/Del1518-单体型可显著降低GCA的发病风险。5 53BP1外显子区P909L和W1488G只存在单一等位基因,不适合疾病的筛查;53BP1启动子区T885G不单独影响高发区ESCC、GCA的发病风险。6同时携带P53 Pro等位基因和53BP1 T885G G/G基因型可降低GCA的发病风险。