河南省啮齿类动物流行性出血热病毒的分子流行病学研究

论文摘要

目的:采用分子流行病学的方法,通过汉坦病毒核酸RT-PCR分型及部分扩增片段的序列分析,研究河南省不同地区啮齿类动物携带肾综合征出血热病毒状况和病毒型别,了解其基因型的分布、变异、新型别存在与否,并对其系统发生及进化关系加以分系,为肾综合征出血热防治研究提供科学依据。 方法:笼捕法捕鼠,计算鼠密度,确定鼠种构成。用直接免疫荧光法检测动物肺组织切片,应用汉坦病毒型特异性引物以RT-PCR方法对抗原检测阳性的鼠肺标本扩增M和S基因片段上的特异核苷酸序列并测序,将扩增片段的核苷酸序列与已知病毒序列进行比较,用PHYLIP软件对得到的序列绘制系统发生树,了解其进化关系,以明确基因亚型及其地理分布情况。 结果:在河南省不同生境的7个县市区中共布鼠笼4720个,捕获啮齿类动物695只,褐家鼠为优势鼠种,占33.53%。其次为黄胸鼠,占18.41%。应用直接免疫荧光法检测全部鼠肺,其中阳性肺组织切片95份,阳性率为13.67%。阳性切片中,褐家鼠和仓鼠分别占47.0%和26.32%。阳性标本并用RT—PCR反应扩增并电泳检测。对3份M片段、S片段均扩增阳性标本进行序列测定,并对其核苷酸序列进行分析显示,均为汉城型（SEO）汉坦病毒,与汉坦病毒R22株、L99株、HB55株、Hb86株、SR11株分别属相同亚型。同一地区的汉坦病毒其核苷酸序列同源性较为接近,表明不同亚型间有着明显的地理聚集现象。在研究中无新的型别出现。 结论:河南省不同地区出血热病毒的主要宿主动物是褐家鼠,不同宿主动物携带的汉坦病毒之间的核昔酸序列同源性较高,但也存在一定的差异。这种差异形成的原因有待进一步研究。

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