本文主要研究内容
作者王娅丽,朱姗姗,杨峰山,马玉堃,付海燕,刘春光（2019）在《莠去津降解菌泛基因组测序及比较基因组分析》一文中研究指出：Arthrobacter aurescens TC1和Pseudomonas sp. ADP是目前莠去津降解菌的模式菌株,筛选出Microbacterium sp.HBT4,旨在挖掘这3株不同种属细菌基因组间生物学信息的异同,并预测重要基因。通过Illumina Hiseq 4000测序平台采用DNA小文库制备和测序技术,进行了泛基因组测序,使用相关软件进行基因组组分分析、基因功能注释、基因间变异检测和比较基因组学分析,将分离得到的微杆菌HBT4与模式菌株进行核苷酸组成、共线性及菌株间变异差异分析。得到该菌株基因组大小约为3.53Mb,预测到菌株HBT4编码基因3 397个、重复序列含量为1.33%、非编码RNA 63个,通用数据库基因功能注释共3 324个,专用数据库基因功能注释共1 149个,通过菌株间差异变异分析发现SNP、Small InDel和水平转移基因,未发现结构变异基因,获得该菌株特有基因中GO注释到的基因在细胞组分、分子功能和生物学进程中的数量和比例,从KEGG代谢通路富集图中发现特有基因编码的二氢硫基赖氨酸残基琥珀酰转移酶位于三羧酸循环中α-酮戊二酸和琥珀酰辅酶A的代谢通路之间。获得3个菌株核心基因组与非必需基因组比例分布、系统进化树和共线性关系,发现三者之间共有基因家族986个、菌株HBT4特有基因家族1 171个。得到的菌株HBT4与两株模式菌株相比,其基因家族之间既有相同之处,又有较大差异。
Abstract
Arthrobacter aurescens TC1he Pseudomonas sp. ADPshi mu qian you qu jin jiang jie jun de mo shi jun zhu ,shai shua chu Microbacterium sp.HBT4,zhi zai wa jue zhe 3zhu bu tong chong shu xi jun ji yin zu jian sheng wu xue xin xi de yi tong ,bing yu ce chong yao ji yin 。tong guo Illumina Hiseq 4000ce xu ping tai cai yong DNAxiao wen ku zhi bei he ce xu ji shu ,jin hang le fan ji yin zu ce xu ,shi yong xiang guan ruan jian jin hang ji yin zu zu fen fen xi 、ji yin gong neng zhu shi 、ji yin jian bian yi jian ce he bi jiao ji yin zu xue fen xi ,jiang fen li de dao de wei gan jun HBT4yu mo shi jun zhu jin hang he gan suan zu cheng 、gong xian xing ji jun zhu jian bian yi cha yi fen xi 。de dao gai jun zhu ji yin zu da xiao yao wei 3.53Mb,yu ce dao jun zhu HBT4bian ma ji yin 3 397ge 、chong fu xu lie han liang wei 1.33%、fei bian ma RNA 63ge ,tong yong shu ju ku ji yin gong neng zhu shi gong 3 324ge ,zhuan yong shu ju ku ji yin gong neng zhu shi gong 1 149ge ,tong guo jun zhu jian cha yi bian yi fen xi fa xian SNP、Small InDelhe shui ping zhuai yi ji yin ,wei fa xian jie gou bian yi ji yin ,huo de gai jun zhu te you ji yin zhong GOzhu shi dao de ji yin zai xi bao zu fen 、fen zi gong neng he sheng wu xue jin cheng zhong de shu liang he bi li ,cong KEGGdai xie tong lu fu ji tu zhong fa xian te you ji yin bian ma de er qing liu ji lai an suan can ji hu po xian zhuai yi mei wei yu san suo suan xun huan zhong α-tong wu er suan he hu po xian fu mei Ade dai xie tong lu zhi jian 。huo de 3ge jun zhu he xin ji yin zu yu fei bi xu ji yin zu bi li fen bu 、ji tong jin hua shu he gong xian xing guan ji ,fa xian san zhe zhi jian gong you ji yin jia zu 986ge 、jun zhu HBT4te you ji yin jia zu 1 171ge 。de dao de jun zhu HBT4yu liang zhu mo shi jun zhu xiang bi ,ji ji yin jia zu zhi jian ji you xiang tong zhi chu ,you you jiao da cha yi 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自生物技术通报的王娅丽,朱姗姗,杨峰山,马玉堃,付海燕,刘春光，发表于刊物生物技术通报2019年07期论文，是一篇关于莠去津论文,微杆菌属论文,泛基因组论文,比较基因组分析论文,生物信息学论文,生物技术通报2019年07期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自生物技术通报2019年07期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
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