薛楠:盘基网柄菌早衰蛋白结构与功能生物信息学分析论文

薛楠:盘基网柄菌早衰蛋白结构与功能生物信息学分析论文

本文主要研究内容

作者薛楠,郭倩楠,刘坚,徐存拴,薛德明(2019)在《盘基网柄菌早衰蛋白结构与功能生物信息学分析》一文中研究指出:早衰蛋白(presenilin, PS)是γ分泌酶的组成成分,其突变可造成阿尔兹海默病(Alzheimer disease,AD)的形成。因PS所造成AD的发病机理较复杂,因而我们想探究一下模式生物盘基网柄菌(Dictyostelium discoideum)是否能够作为研究早衰蛋白的模型。从NCBI网站中得到盘基网柄菌早衰蛋白DdPsenA和DdPsenB氨基酸序列,随后利用ProtScale、ProtParam理化性分析工具、保守结构域、TMHMM2跨膜区分析网站、进化树软件MEGA6.0、二级结构PredictProtein以及三级结构SWISS-Model服务器对上述蛋白进行生物信息学分析。DdPsenA的氨基酸长度为622,是亲水性蛋白,其相对分子质量为69 502.79,等电点为4.53。DdPsenB的氨基酸长度为473,属于疏水性蛋白,其相对分子质量为52 558.74,等电点为4.49,与DdPsenA同属于Peptidase_A22B超家族。跨膜分析出DdPsenA和DdPsenB均有8个跨膜区。DdPsenA与人类presenilin-2序列相似性为67%,Dd PsenB与人类presenilin-1序列相似性分别为60%。盘基网柄菌可以作为研究早衰蛋白功能和作用机制的模型。

Abstract

zao cui dan bai (presenilin, PS)shi γfen bi mei de zu cheng cheng fen ,ji tu bian ke zao cheng a er ci hai mo bing (Alzheimer disease,AD)de xing cheng 。yin PSsuo zao cheng ADde fa bing ji li jiao fu za ,yin er wo men xiang tan jiu yi xia mo shi sheng wu pan ji wang bing jun (Dictyostelium discoideum)shi fou neng gou zuo wei yan jiu zao cui dan bai de mo xing 。cong NCBIwang zhan zhong de dao pan ji wang bing jun zao cui dan bai DdPsenAhe DdPsenBan ji suan xu lie ,sui hou li yong ProtScale、ProtParamli hua xing fen xi gong ju 、bao shou jie gou yu 、TMHMM2kua mo ou fen xi wang zhan 、jin hua shu ruan jian MEGA6.0、er ji jie gou PredictProteinyi ji san ji jie gou SWISS-Modelfu wu qi dui shang shu dan bai jin hang sheng wu xin xi xue fen xi 。DdPsenAde an ji suan chang du wei 622,shi qin shui xing dan bai ,ji xiang dui fen zi zhi liang wei 69 502.79,deng dian dian wei 4.53。DdPsenBde an ji suan chang du wei 473,shu yu shu shui xing dan bai ,ji xiang dui fen zi zhi liang wei 52 558.74,deng dian dian wei 4.49,yu DdPsenAtong shu yu Peptidase_A22Bchao jia zu 。kua mo fen xi chu DdPsenAhe DdPsenBjun you 8ge kua mo ou 。DdPsenAyu ren lei presenilin-2xu lie xiang shi xing wei 67%,Dd PsenByu ren lei presenilin-1xu lie xiang shi xing fen bie wei 60%。pan ji wang bing jun ke yi zuo wei yan jiu zao cui dan bai gong neng he zuo yong ji zhi de mo xing 。

论文参考文献

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自基因组学与应用生物学的薛楠,郭倩楠,刘坚,徐存拴,薛德明,发表于刊物基因组学与应用生物学2019年06期论文,是一篇关于早衰蛋白论文,盘基网柄菌论文,生物信息学分析论文,基因组学与应用生物学2019年06期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自基因组学与应用生物学2019年06期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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