乙酰化修饰调控代谢网络和磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶的机制的研究

乙酰化修饰调控代谢网络和磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶的机制的研究

论文摘要

蛋白质的乙酰化作为一种关键的蛋白翻译后修饰越来越受到人们的广泛关注,但是此前的研究大多集中在以组蛋白和核内转录因子为底物的乙酰化研究,我们运用质谱的方法,以人肝组织的细胞质为样品,对乙酰化底物蛋白进行蛋白组学水平的扫描,发现了一系列代谢酶被乙酰化修饰,揭示乙酰化修饰与各种代谢途径关系密切。为了进一步确定乙酰化修饰对代谢途径的调控作用,我们选取了磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶(PEPCK1)为研究对象进行了深入研究。PEPCK1是调节糖异生的关键酶,PEPCK1催化的步骤是糖异生途径的第一步且这个反应不可逆。我们通过实验发现:一. PEPCK1可以被乙酰化修饰且受到细胞内能量的调控。PEPCK1乙酰化后能进一步促进其泛素化降解,导致PEPCK1蛋白量的减少。细胞通过调节糖异生关键酶PEPCK1的乙酰化从而调控细胞自身对高浓度葡萄糖的响应。相反,当细胞处于低糖浓度时,PEPCK1乙酰化降低,蛋白稳定性增加,PEPCK1执行糖异生的功能。二.我们通过串联亲和纯化的方法鉴定了一系列和PEPCK1相互结合的蛋白,其中UBR5是一个具有HECT(Homologous to the E6-AP Carboxyl Terminus)结构域的泛素化连接酶(E3 ligase),实验证明,UBR5的缺失可以导致PEPCK1蛋白量的上升,UBR5可以和PEPCK1相互结合,并且两者之间的结合受到细胞内糖浓度的调控。这些结果都证明了UBR5是导致PEPCK1泛素化降解的E3连接酶。三.我们进一步寻找PEPCK1的乙酰化酶和去乙酰化酶,实验发现,P300是PEPCK1的乙酰化酶,并能增加PEPCK1和UBR5的结合,促进其降解;而Sirt2是PEPCK1的去乙酰化酶,并减少PEPCK1和UBR5的结合,使其稳定。四.我们通过测定细胞内糖浓度和小鼠血糖的实验来阐述细胞PEPCK1的乙酰化或者泛素化水平对其糖异生功能的影响。实验证明,Sirt2的缺失能够影响细胞内葡萄糖的浓度;相应的结果也能通过敲落UBR5,P300得到;另一方面,从小鼠尾静脉注射针对Sirt2敲落的寡核苷酸,结果发现,跟对照组相比,小鼠血糖明显降低。五.我们试图探讨细胞内的营养物质是通过何种途径来影响PEPCK1的乙酰化。实验发现,在高糖浓度下,P300的mRNA水平上升,PEPCK1和P300的结合也随之增加;而在低糖浓度下,Sirt2的mRNA水平上升,PEPCK1被去乙酰化。最后我们总结得出如下的模型:在高糖浓度下,PEPCK1和P300的结合增加,PEPCK1被乙酰化,随后发生泛素化修饰并降解;而在低糖浓度下,Sirt2的mRNA含量会上升,PEPCK1去乙酰化,蛋白稳定性上升,发挥糖异生的作用。本文首次报导了代谢酶的翻译后修饰之间的交互作用,PEPCK1乙酰化促进其泛素化降解调控细胞对葡萄糖的响应。PEPCK1含量的上升是二型糖尿病的重要标志物,所以该研究为治疗糖尿病提供了潜在的药物靶点。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 第一章 引言
  • 1. 蛋白质的翻译后修饰
  • 1.1 磷酸化修饰
  • 1.2 糖基化修饰
  • 1.3 甲基化修饰
  • 1.4 泛素化修饰
  • 1.5 乙酰化修饰
  • 2. 蛋白质乙酰化修饰的研究
  • 2.1 组蛋白乙酰化
  • 2.2 乙酰基转移酶和去乙酰基转移酶
  • 2.3 非组蛋白的乙酰化
  • 2.4 蛋白质乙酰化修饰和其他翻译后修饰的交叉互作
  • 3. 本文主要的研究内容、目的、意义及创新点
  • 第二章 乙酰化蛋白组学研究
  • 1. 研究背景
  • 2. 材料与方法
  • 2.1 实验试剂与材料
  • 2.2 实验方法
  • 3. 结果
  • 3.1 质谱鉴定的乙酰化蛋白的分析
  • 3.2 乙酰化修饰蛋白质和主要代谢途径的关系
  • 3.3 乙酰化促进MDH的酶活
  • 4. 讨论
  • 5. 小结
  • 第三章 磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶(PEPCK1)的乙酰化研究
  • 1. 研究背景
  • 2. 材料与方法
  • 2.1 实验试剂与材料
  • 2.2 实验方法
  • 3. 结果
  • 3.1 PEPCK1可以被乙酰化修饰
  • 3.2 PEPCK1的乙酰化受到细胞内能量的调控
  • 3.3 PEPCK1乙酰化促进其蛋白量的下降
  • 3.4 PEPCK1乙酰化促进其泛素化降解
  • 4. 小结
  • 第四章 磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶(PEPCK1)的泛素化研究
  • 1. 研究背景
  • 2. 材料与方法
  • 2.1 实验试剂与材料
  • 2.2 实验方法
  • 3. 结果
  • 3.1 寻找催化PEPCK1泛素化修饰的E3泛素连接酶
  • 3.2 UBR5缺失影响PEPCK1的稳定性以及PEPCK1的蛋白量
  • 3.3 PEPCK1与UBR5的相互作用
  • 3.4 PEPCK1与UBR5的相互作用受到细胞内能量的调控
  • 4. 小结
  • 第五章 寻找磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶(PEPCK1)的乙酰化转移酶及去乙酰化酶
  • 1. 研究背景
  • 2. 实验试剂
  • 3. 结果
  • 3.1 P300是PEPCK1的乙酰化酶
  • 3.2 P300减少PEPCK1的蛋白水平
  • 3.3 Bat3进一步促进P300的活性
  • 3.4 Sirt2是PEPCK1的去乙酰化酶
  • 3.5 Sirt2通过减少PEPCK1泛素化影响细胞内PEPCK1的蛋白水平
  • 3.6 Sirtinol作为Sirt2的特异性抑制剂影响PEPCK1的稳定性
  • 4. 小结
  • 第六章 通过改变磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶(PEPCK1)的乙酰化或泛素化调节细胞内糖异生的途径
  • 1. 研究背景
  • 2. 材料与方法
  • 2.1 实验试剂与材料
  • 2.2 实验方法
  • 3. 结果
  • 3.1 PEPCK1的乙酰化和泛素化受到细胞内能量调控
  • 3.2 改变PEPCK1的泛素化调节细胞内糖异生途径
  • 3.3 改变PEPCK1的乙酰化调节细胞内糖异生途径
  • 3.4 小鼠在体实验证明Sirt2敲落使血糖下降
  • 4. 小结
  • 讨论
  • 1. 乙酰化修饰和糖异生调控
  • 2. 葡萄糖对乙酰化的调控机制
  • 3. 泛素化对糖异生的调控机制
  • 4. 翻译后修饰的交叉互作
  • 总结
  • 参考文献
  • 发表文章
  • 致谢
  • 相关论文文献

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