中国对虾人工选育群体遗传结构分析及遗传连锁图谱的构建

论文摘要

1.“黄海1号”是经国家水产原良种审定委员会审定的中国对虾养殖新品种,目前已有其遗传结构变异方面的调查,但对其体型特征尚未作系统研究。本试验对中国对虾“黄海1号”人工选育群体和野生群体的样品进行了11项形态性状的测定,通过方差分析和两种多元统计分析方法,比较两个群体的外部形态特征。方差分析和t检验结果表明,两个群体在部分形态特征上表现出明显差异,主要反映在选育对虾的腹节3、5及腹节6长度增加,但头胸甲及腹节1的宽度降低。主成分分析构建了4个主成分,其累积贡献率分别为:主成分1为18.14%,主成分2为15.09%,主成分3为11.09%,主成分4为9.53%,累积贡献率为53.85%。结果表明,两个群体在横向体型因子方面差异最明显,结果与显著性检验的结论基本一致。判别分析显示,两个对虾群体的形态差异显著（P<0.000 1）。建立了两个群体的判别函数,其判别准确率P1为62%～75%,P2为55.4%～79.8%,综合判别率为70.67%,可以认为逐步判别对于中国对虾不同群体的初步鉴定是可行的。选育群体的判别准确率（75%）相对较高,从而从形态学方面体现了选择育种的效果。2.利用7对AFLP引物组合检测了中国对虾野生群体及连续四代选育群体基因组DNA的遗传结构,根据AFLP分析结果计算了选育世代群体间的遗传相似系数和遗传距离。结果表明,AFLP标记表现出较高的多态检测效率,7对引物共产生500余条带,平均每对引物组合检测到33.7个多态性标记,由shannon信息指数反映的遗传多样性为0.1366～0.1608,非常适合于遗传多样性分析。结果显示,随着选育世代的增加,选育群体的遗传多样性呈现下降趋势,但随着选育时间的延长,群体之间的分化逐渐降低,群体的遗传结构开始趋于稳定。选育群体经过了长时间针对生长速度的人工选择,等位基因频率开始发生变化,表现在稀有位点丢失,低频位点数目降低,并且部分位点的基因频率的变化方向与选育时间一

论文目录

• 中文摘要
• 英文摘要
• 第一章 文献综述
• 第一节 对虾遗传育种研究现状
• 1 对虾遗传学研究现状
• 1.1 细胞遗传学
• 1.2 群体遗传学
• 1.3 数量遗传学
• 2 对虾的主要育种技术与进展
• 2.1 选择育种
• 2.2 杂交育种
• 2.3 细胞工程育种
• 2.4 分子标记辅助育种
• 2.5 基因工程育种
• 第二节 遗传标记技术在对虾遗传学研究中的应用
• 1 遗传标记的种类
• 1.1 形态学标记
• 1.2 细胞学标记
• 1.3 生化标记
• 1.4 分子标记
• 2 AFLP 分子标记技术简介
• 2.1 AFLP 的基本原理
• 2.2 AFLP 的基本反应程序
• 3 分子标记技术在对虾中的应用
• 3.1 进行物种（品种）鉴定与系统发育研究
• 3.2 检测遗传渐渗，为种质资源保护与维持物种遗传多样性提供依据
• 3.3 数量性状定位和标记辅助育种
• 第三节 水产生物遗传连锁图谱研究进展
• 1. 遗传连锁图谱的构建
• 1.1 构建分子遗传图谱的理论基础
• 1.2 群体的选择
• 1.3 标记的选择
• 1.4 遗传作图的数据分析方法与统计学原理
• 1.5 与遗传作图有关的计算机软件
• 2 遗传连锁图谱的应用和意义
• 2.1 数量性状位点（QTL）定位研究
• 2.2 标记辅助育种（ＭＡＳ）研究
• 2.3 图位克隆
• 2.4 开展比较基因组学研究
• 3 水生生物遗传连锁图谱研究进展
• 4 分子遗传图谱的展望
• 第四节 本论文的研究目的及意义
• 第二章 中国对虾“黄海1 号”选育群体的形态特征分析
• 0 引言
• 1 材料与方法
• 1.1 材料
• 1.2 形态指标及测量
• 1.3 统计分析
• 2 结果与分析
• 2.1 t 检验
• 2.2 主成分分析
• 2.3 判别函数的建立
• 3 讨论
• 第三章 中国对虾人工选育群体不同世代间的 AFLP 分析及生长相关分子标记的筛选
• 0 引言
• 1 材料与方法
• 1.1 试验材料
• 1.2 主要溶液配制
• 1.3 实验方法
• 2 结果
• 2.1 高质量模板DNA 的提取
• 2.2 酶切及预扩增结果检测
• 2.3 引物筛选结果
• 2.4 AFLP 多态标记检测结果
• 2.5 五个群体间的遗传多样性、遗传相似性及遗传分化分析
• 2.6 群体内个体间的遗传距离及遗传分化分析
• 2.7 五个世代的基因型频率分布
• 2.8 生长相关分子标记的克隆及测序
• 3 讨论
• 第四章 中国对虾遗传连锁图谱的构建
• 0 引言
• 1. 材料和方法
• 1.1 动物材料
• 1.2 AFLP 方法
• 1.3 数据统计
• 1.4 连锁分析
• 1.5 遗传图谱预期长度和覆盖率的计算
• 2 结果
• 2.1 AFLP 标记
• 2.2 AFLP 标记的偏分离
• 2.3 雌性连锁图谱
• 2.4 雄性连锁图谱
• 2.5 基因组长度及图谱覆盖率
• 3. 讨论
• 3.1 拟测交理论
• 3.2 AFLP 标记
• 3.3 偏分离现象
• 3.4 标记聚集（Clustering）和标记空隙（Gaps）
• 3.5 图谱的评估
• 3.6 图谱的完善
• 结论
• 参考文献
• 在读期间发表的论文
• 致谢