论文题目: 珙桐天然群体的遗传多样性分析及其保存样本策略研究
论文类型: 博士论文
论文专业: 植物学
作者: 宋丛文
导师: 包满珠
关键词: 珙桐,遗传多样性,遗传结构,核心种质,样本策略
文献来源: 华中农业大学
发表年度: 2005
论文摘要: 珙桐(Davidia involucrata)是我国特有的珙桐科珙桐属植物,起源古老,为第三纪古热带植物区系的孑遗种。由于其树姿优美、花序奇特好似白鸽展翅,故有“中国鸽子树”之美称。珙桐在植物系统发育和地史变迁研究上有很高的学术地位,目前仅在我国有星散状分布,现已被列为国家一级保护珍稀濒危植物。 本研究主要从三个方面开展了对珙桐遗传多样性及种质资源保存的研究: (1)利用RAPD分子标记技术对分布于我国的5个天然珙桐群体的群体内和群体间的遗传多样性进行检测,从DNA水平上阐明其遗传变异; (2)检测不同的取样方法对群体遗传学参数的影响; (3)在研究珙桐DNA水平的遗传多样性的基础上,提出珙桐种质资源保存的核心种质样本策略。 研究结果如下: (1)从40个随机引物中筛选出能产生多态性、清晰明亮的谱带,且重复性好的13个引物用于5个珙桐群体DNA样品的RAPD扩增及分析。 (2)利用筛选出的13个多态引物对全部186个样品DNA进行扩增,获得101个多态标记,平均每个引物产生7.78个多态位点。四川峨眉山、贵州梵净山、湖北神农架三群体的多态位点百分率明显高于湖北宣恩和甘肃文县群体。 (3)各群体间遗传多样性有较大差异,贵州梵净山、湖北神农架和四川峨眉山群体明显大于甘肃文县群体和湖北宣恩群体。珙桐种内平均遗传多样性为0.3345,群体内平均遗传多样性为0.2476,群体间的遗传多样性为0.0869。基因分化系数达到了0.2599,基因流为1.4239。说明虽然珙桐大部分变异存在于群体内,但是由于珙桐的星散状分布受小种群效应影响,缺乏有效的基因流,致使群体间遗传变异占到了总变异的26%,群体间遗传分化较大。 (4)珙桐五个群体的遗传相似度较高,均在0.8以上,其中遗传相似性以贵州梵净山和湖北神农架的两群体最大(0.9321),其次是湖北宣恩与湖北神农架两群体(0.8878),湖北宣恩与甘肃文县的遗传相似性最小(0.8141)。 (5)根据聚类树形图显示,可以将5个琪桐天然群体分为2大类群体,即湖北
论文目录:
摘要
Abstract
1 文献综述
1.1 遗传多样性与群体遗传结构
1.1.1 遗传多样性与遗传资源保存
1.1.2 群体遗传结构及其影响因素
1.1.3 植物群体遗传结构与保护策略的制定
1.1.4 研究植物群体遗传结构在遗传多样性保护中的意义.
1.1.5 遗传多样性的研究方法
1.2 RAPD分子标记及其在林木遗传多样性研究中的应用
1.2.1 RAPD技术原理及特点
1.2.2 RAPD技术的基本实验程序和主要影响因素
1.2.3 RAPD分子标记在植物遗传多样性研究中的应用.
1.3 珙桐的研究现状及本研究的目的与意义
1.3.1 我国特有珍稀树种珙桐的研究现状
1.3.2 研究目的与意义
2 材料与方法
2.1 试验材料
2.2 研究方法
2.2.1 材料基因组 DNA提取和浓度确定自
2.2.2 RAPD扩增方案确定
2.2.3 引物筛选
2.2.4 RAPD电泳结果的记录
2.2.5 数据统计方法
2.2.6 数据分析方法
3 结果与分析
3.1 引物筛选
3.2 扩增结果
3.3 遗传参数估计
3.3.1 多态位点百分率
3.3.2 基因频率及 Nei's基因多样性
3.3.3 群体间遗传分化分析
3.3.4 群体间遗传距离分析
3.3.5 珙桐群体 UPGMA聚类分析
3.3.6 Shannon信息指数估计遗传多样性
3.3.7 样地个体间遗传结构分析
3.3.8 群体遗传标记的捕获曲线(capturing curves)
3.3.9 取样方法对遗传学参数的影响
4 讨论
4.1 实验条件与方法
4.1.1 基因组 DNA的制备
4.1.2 实验稳定性
4.1.3 数据分析方法
4.1.4 遗传多样性和遗传结构
4.2 珍稀濒危树种遗传资源保存
4.2.1 珍稀濒危树种的概念及其保存的策略与措施
4.2.2 核心种质的概念及其保存
4.2.3 珙桐核心种质保存的样本策略
4.3 进一步工作方向
参考文献
图版及说明
附录
致谢
发布时间: 2005-12-05
参考文献
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