本文主要研究内容
作者李文静,赵新颖,纪萌琦,郭鑫,郭红,邓志英,田纪春（2019）在《小麦近等基因系幼穗二棱期转录组分析》一文中研究指出：抽穗期是与小麦适应性直接相关的一个很重要的性状,直接或间接影响小麦的产量和抗性。为明确控制抽穗期的关键表达基因,以抽穗期分别为196d和184d的小麦近等基因系Y57和96-2为材料,对其二棱期幼穗分别构建转录组测序文库,利用Illumina HiSeq 2500平台进行RNA-seq测序;将获得的clean read与中国春参考序列比对,得到unique read,采用FPKM法计算基因表达量,对差异表达基因进行功能注释、GO和COG功能分类以及KEGG通路分析。结果表明,供试材料经过测序获得质量不低于30的碱基比例(Q30)均高于85.5%;Y57和96-2分别有60 246 194和60 963 580条clean read,其中63.11%和69.51%能与参考基因组序列匹配。共筛选到395个差异表达基因,有382个基因得到功能注释;有298个基因获得GO功能注释,主要涉及细胞组分、结合、细胞反应和代谢过程;COG注释的基因主要涉及一般功能、信号转导机制和转录;KEGG功能注释分析发现,显著富集在光合作用-天线蛋白通路上的基因均上调表达。编码丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶2A的基因在Y57中几乎不表达,而在96-2中表达量较高。进一步分析发现,多个与生长发育、抽穗开花相关的转录因子在两个材料中的表达差异显著。此结果可为深入研究抽穗期相关基因和穗发育调控机制奠定基础。
Abstract
chou sui ji shi yu xiao mai kuo ying xing zhi jie xiang guan de yi ge hen chong yao de xing zhuang ,zhi jie huo jian jie ying xiang xiao mai de chan liang he kang xing 。wei ming que kong zhi chou sui ji de guan jian biao da ji yin ,yi chou sui ji fen bie wei 196dhe 184dde xiao mai jin deng ji yin ji Y57he 96-2wei cai liao ,dui ji er leng ji you sui fen bie gou jian zhuai lu zu ce xu wen ku ,li yong Illumina HiSeq 2500ping tai jin hang RNA-seqce xu ;jiang huo de de clean readyu zhong guo chun can kao xu lie bi dui ,de dao unique read,cai yong FPKMfa ji suan ji yin biao da liang ,dui cha yi biao da ji yin jin hang gong neng zhu shi 、GOhe COGgong neng fen lei yi ji KEGGtong lu fen xi 。jie guo biao ming ,gong shi cai liao jing guo ce xu huo de zhi liang bu di yu 30de jian ji bi li (Q30)jun gao yu 85.5%;Y57he 96-2fen bie you 60 246 194he 60 963 580tiao clean read,ji zhong 63.11%he 69.51%neng yu can kao ji yin zu xu lie pi pei 。gong shai shua dao 395ge cha yi biao da ji yin ,you 382ge ji yin de dao gong neng zhu shi ;you 298ge ji yin huo de GOgong neng zhu shi ,zhu yao she ji xi bao zu fen 、jie ge 、xi bao fan ying he dai xie guo cheng ;COGzhu shi de ji yin zhu yao she ji yi ban gong neng 、xin hao zhuai dao ji zhi he zhuai lu ;KEGGgong neng zhu shi fen xi fa xian ,xian zhe fu ji zai guang ge zuo yong -tian xian dan bai tong lu shang de ji yin jun shang diao biao da 。bian ma si an suan /su an suan dan bai lin suan mei 2Ade ji yin zai Y57zhong ji hu bu biao da ,er zai 96-2zhong biao da liang jiao gao 。jin yi bu fen xi fa xian ,duo ge yu sheng chang fa yo 、chou sui kai hua xiang guan de zhuai lu yin zi zai liang ge cai liao zhong de biao da cha yi xian zhe 。ci jie guo ke wei shen ru yan jiu chou sui ji xiang guan ji yin he sui fa yo diao kong ji zhi dian ding ji chu 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自麦类作物学报的李文静,赵新颖,纪萌琦,郭鑫,郭红,邓志英,田纪春，发表于刊物麦类作物学报2019年01期论文，是一篇关于小麦论文,幼穗论文,近等基因系论文,二棱期论文,麦类作物学报2019年01期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自麦类作物学报2019年01期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
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