植物诱抗蛋白HarpinNCSDS001的基因克隆、表达和作用机制研究

植物诱抗蛋白HarpinNCSDS001的基因克隆、表达和作用机制研究

论文摘要

Harpin是一类由hrpN(hrpZ,hrpW)基因编码的能诱导植物产生系统抗性的重要致敏信号蛋白质,广泛存在于植物革兰氏阴性致病细菌和部分动物病原菌中,其基因不仅具有不同程度的同源性,更具有非常丰富的遗传多样性和差异性。本研究从分离携带hrpN基因的目的菌株Erwinia carotovora sp.carotovora CSDS001入手,研究了CSDS001菌株与hrpN基因表达产物相关的生物学特征,构建了CSDS001基因组文库,克隆到hrpNCSDS001基因,实现HarpinNCSDS001蛋白的高效表达,完成了对hrpNCSDS001基因及其表达产物HarpinNCSDS001蛋白的论证,采用多项控制性实验对HarpinNCSDS001蛋白及HarpinNCSDS001-Zn络合物的生物学活性和生物学效应进行了比较,通过对HarpinNCSDS001蛋白及HarpinNCSDS001-Zn络合物作用后的拟南芥全基因表达谱分析,探讨了HarpinNCSDS001蛋白及HarpinNCSDS001-Zn络合物诱导植物产生系统获得性抗性以及促进植物生长发育的可能机制。主要结果如下:1、从感染软腐病大白菜组织中分离纯化到携带hrpN基因的CSDS001菌株,CSDS001具有对大白菜和西芹具有强致病性,分泌高活性Pel、Peh、Cel、Prt等植物细胞壁降解酶类,将2×108个/mlCSDS001菌注射接种到非寄主烟草叶片上,能诱导产生过敏反应(Hypersensitive Response,HR)。2、将CSDS001基因组文库构建于质粒pLARF5,宿主菌为HB101,文库含有1000个菌落,每个菌落含20—30kb染色体DNA,从中筛选出的1.5—kb EcoRI片段含有CSDS001的hrpNCSDS001基因。3、序列测试表明hrpNCSDS001基因编码区含1071个核苷酸,注册Genebank号AY939927,编码产物HarpinNCSDS001蛋白含356个氨基酸残基,理论分子量35.55kD,理论等电点5.5。4、将hrpNCSDS001基因克隆到pET—28a(+)载体质粒T7启动子后,构建高效表达质粒pT7-hrpNCSDS001,,将pT7-hrpNCSDS001转入大肠杆菌JM109,完成了基因工程菌的构建,用IPTG能诱导hrpNCSDS001基因高效表达。5、Western杂交证明所克隆的hrpNCSDS001基因表达产物为HarpinNCSDS001蛋白;Northern杂交证明CSDS001菌株携带的hrpNCSDS001基因表达受外界环境碳源、氮源和pH值等调控。6、对HarpinNCSDS001蛋白的分离纯化表明,工程菌中高效表达的HarpinNCSDS001蛋白是以包含体形式存在于细胞质中,能诱导烟草叶片产生过敏反应,证明以包含体形式存在的HarpinNCSDS001蛋白具有生物学活性。7、一定条件下,HarpinNCSDS001蛋白与锌离子发生络合反应,形成的HarpinNCSDS001—Zn络合物与HarpinNCSDS001蛋白具有同样的生物学活性,能诱导烟草叶片产生过敏反应。8、分别将30mg/L浓度的HarpinNCSDS001—Zn络合物和HarpinNCSDS001蛋白施用到辣椒、茄子、黄瓜、马铃薯和西红柿,进行田间控制性药效试验。结果显示,施用HarpinNCSDS001-Zn络合物使几种蔬菜产量分别增加13.69%、16.52%、18.86%、11.55%、11.64%;施用HarpinNCSDS001蛋白增产分别为11.73%、13.27%、16.3%、8.26%、10.25%。经过对参试作物病虫害、株高、生育期等的调查分析,增产主要原因是HarpinNCSDS001-Zn和HarpinNCSDS001蛋白诱导作物系统抗性,减少作物因病虫害造成的损失,此外,在一定程度上还能促进作物生长发育、增加生物量、诱导提前开花结果、延长结果期,促进增加作物产量。表明HarpinNCSDS001—Zn比HarpinNCSDS001蛋白具有更强的生物学功效。9、用Cluster 3.0,TreeView 1.60软件聚类分析HarpinNCSDS001蛋白处理后的拟南芥全基因谱,显示在分别处理后第3h、12h、24h、36h和48h,有52个基因(聚为5类)的表达变化与HarpinNCSDS001蛋白作用持续相关,其中第4类和第5类基因功能与植物抗逆性和生长发育相关。10、对HarpinNCSDS001蛋白诱导拟南芥发生显著表达差异的基因数量分析表明,在作用后第3h、12h、24h、36h和48h时发生显著表达变化(log ratio≥1或≤-1)的基因数分别为912、1787、2393、1833和1755。表明,HarpinNCSDS001作用后的一个时期内,与若干生理过程相关的基因发生显著表达差异,且发生显著表达差异的基因数量逐步上升,在作用后第24h左右诱导发生显著表达差异的基因数量最高,同时,诱导发生显著表达差异的基因数具有时间上的持续性。11、对被诱导发生显著表达差异的转录因子家族基因分析表明,有13个转录因子家族:ZIM、BES1、TCP、C2C2、AP2/EREBP、WRKY、bHLH、bZIP、GARP、MYB、NAC、HB、C2H2与HarpinNCSDS001蛋白作用相关。这些转录因子主要参与调控植物抗性反应、光合作用、生长发育、开花等生理反应。12、利用http://www.genome.ad.jp/提供的KEGG2分析工具,对HarpinNCSDS001蛋白作用后类黄酮合成相关基因表达分析,揭示了查尔酮合成酶和黄烷酮—3—羟基化酶基因表达上调,从转录水平证明HarpinNCSDS001蛋白诱导类黄酮合成。13、HarpinNCSDS001—Zn作用于拟南芥后第24h,诱导发生显著表达变化基因数达到2741,更有35个转录因子家族基因的表达变化与HarpinNCSDS001—Zn的作用相关,且查尔酮合成酶和黄烷酮—3—羟基化酶基因表达也上调。这些结果表明,可能HarpinNCSDS001—Zn诱导的与若干生理过程相关基因的显著表达差异是更为复杂的过程,较之HarpinNCSDS001蛋白,明显具有更强生物学功效,这与田间控制性试验结果相一致。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 第一章 植物抗逆机制和Harpin蛋白(文献综述)
  • 1 植物的防御体系和防御机制
  • 1.1 植物的生长发育特征
  • 1.2 植物生长发育的环境因子
  • 1.2.1 非生物环境因子
  • 1.2.2 生物环境因子
  • 1.3 植物的逆境因子分类以及对植物的影响
  • 1.3.1 植物非生物逆境因子
  • 1.3.2 植物生物逆境因子
  • 1.3.3 逆环境对植物体的影响
  • 1.4 植物的防御体系
  • 1.4.1 物理预存型防御体系
  • 1.4.2 化学预存型防御体系
  • 1.4.3 诱导物理防御体系
  • 1.4.4 诱导化学防御体系
  • 1.5 植物对逆境因子的防御机制
  • 1.5.1 植物对逆境信号的接受
  • 1.5.2 逆境信号的传导及放大
  • 1.5.3 逆境信号诱导植物整体反应
  • 2 hrp基因及其表达产物Harpin蛋白
  • 2.1 Harpin的发现
  • 2.2 hrp基因及表达的调控
  • 2.2.1 hrp基因簇
  • 2.2.2 hrp基因的表达调控
  • 2.3 Harpin蛋白的生物学活性
  • 2.4 hrp类基因及表达产物的一致性和多样性
  • 3 植物抗逆机制和Harpin蛋白
  • 3.1 Harpin蛋白对植物作用的生物学效应
  • 3.2 Harpin蛋白诱导植物产生系统性获得抗性
  • 4 作为诱抗剂的Harpin蛋白应用前景
  • 第二章 Erwinia carotovora subsp.carotovora CSDS001菌株的分离纯化及生物学特性
  • 1 材料与方法
  • 1.1 实验材料
  • 1.2 主要试剂和培养基
  • 1.3 实验方法
  • 2 结果与分析
  • 2.1 目的菌株CSDS001的分离纯化及其形态学特征
  • 2.2 CSDS001菌株生理生化特征
  • 2.3 CSDS001菌株对寄主植物的强致病性
  • 2.4 CSDS001菌株几种胞外酶的强分泌性
  • 2.5 CSDS001菌株诱导非寄主植物烟草过敏反应
  • 3 讨论
  • 3.1 目的菌株CSDS001的筛选原则
  • 3.2 CSDS001菌株的强分泌性和强致病性
  • 3.3 目的菌株CSDS001诱发的过敏反应分析
  • CSDS001基因鉴定、克隆及高效表达'>第三章 目的菌株CSDS001hrpNCSDS001基因鉴定、克隆及高效表达
  • 1 材料与方法
  • 1.1 实验材料
  • 1.2 主要试剂和培养基
  • 1.3 实验方法
  • 2 结果与分析
  • 2.1 CSDS001菌株基因组文库
  • CSDS001基因的克隆及亚克隆'>2.2 hrpNCSDS001基因的克隆及亚克隆
  • CSDS001基因的表达调控'>2.3 目的菌株CSDS001hrpNCSDS001基因的表达调控
  • CSDS001基因及转录产物HarpinNCSDS001蛋白序列分析'>2.4 hrpNCSDS001基因及转录产物HarpinNCSDS001蛋白序列分析
  • CSDS001蛋白的高效表达'>2.5 HarpinNCSDS001蛋白的高效表达
  • 2.6 高效表达的HarpinNcsDs001蛋白生物学活性
  • 2.7 HarpinNcsDs001蛋白的分离纯化
  • 3 讨论
  • 3.1 目的菌株CSDS001 DNA文库建立和hrpNcsDs001基因的克隆
  • 3.2 目的菌株CSDS001、目的基因及目标蛋白鉴定的一致性分析
  • 3.3 HarpinNcsDs001蛋白生物学活性及包含体结构
  • 3.4 HarpinNcsDs001蛋白的高效表达诱导和分离纯化
  • 第四章 HarpinNcSDS001蛋白及其锌络合物诱抗增产生物学功效
  • 1 材料与方法
  • 1.1 供试药剂与试验小区设计
  • 1.2 参试蔬菜及品种
  • 1.3 处理方法
  • 1.4 调查方法与内容
  • 1.5 数据处理方法
  • 2 结果与分析
  • 2.1 HarpinNcsDS001和HarpinNcsDs001—Zn对作物生长发育的影响
  • 2.2 HarpinNcsDs001和HarpinNcsDs001—Zn对作物抗病的影响
  • 2.3 HarpinNcsDs001和HarpinNcsDs001—Zn对作物产量的影响
  • 2.4 部分试验照片
  • 3 讨论
  • 3.1 诱抗剂HarpinNcsDs001蛋白和HarpinNcsDs001—Zn的生物学效应小结
  • 3.2 HarpinNcsDs001蛋白和HarpinNcsDS001—Zn的生物学效应的一致性和多样性
  • 3.3 诱抗性HarpinNcsDs001蛋白和HarpinNcsDs001—Zn的药效作用
  • 第五章 HarpinNcsDs001蛋白及其锌络合物作用机制研究
  • 1 材料与方法
  • 1.1 实验材料
  • 1.2 主要试剂
  • 1.3 实验方法
  • 2 结果与分析
  • 2.1 HarpinNcsDs001蛋白诱导的拟南芥全基因表达的聚类分析
  • 2.2 HarpinNcsDs001蛋白诱导的拟南芥基因表达时程动力学分析
  • 2.3 HarpinNcsDs001蛋白诱导的拟南芥转录因子家族表达的分析
  • 2.4 HarpinNcsDs001蛋白诱导的拟南芥类黄酮合成途径相关基因表达的分析
  • 2.5. HarpinNcsDs001—Zn络合物特征
  • 2.5.1 HarpinNcSDS001蛋白与HarpinNcsDs001—Zn红外光谱(FTIR)特征
  • 2.5.2 HarpinNcsDs001—Zn络合物中锌离子结合能质
  • 2.6 HarpinNcsDs001—Zn络合物生物学活性
  • 2.7 HarpinNcsDs001—Zn络合物和HarpinNcsDS001蛋白诱导拟南芥基因表达的比较分析
  • 2.7.1 发生显著表达变化的基因数比较分析
  • 2.7.2 相关转录因子家族比较分析
  • 2.7.3 HarpinNcsDs001—Zn络合物诱导的拟南芥类黄酮合成途径相关基因表达的分析
  • 3 讨论
  • 3.1 HarpinNcsDs001蛋白能诱导拟南芥多基因表达调控
  • 3.2 HarpinNcsDs00l蛋白诱导的拟南芥基因表达的时程动力学与药效控制性试验的关联
  • 3.3 HarpinNcsDs001蛋白诱导的拟南芥转录因子家族与HrpNcsDs001蛋白的生物学效应
  • 3.4 HarpinNcsDs001—Zn络合物和HarpinNcsDs001蛋白的一致性和差异性及其实践意义
  • 3.5 诱抗性HarpinNcsDs001蛋白及HarpinNcsDs001—Zn的作用机制和意义初探
  • 结语
  • 研究的创新性
  • 参考文献
  • 致谢
  • 附录一 聚类分析基因相关信息
  • 攻读学位期间获得的研究成果
  • 附件
  • 相关论文文献

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