微卫星标记预测湘西黄牛杂种优势及遗传多样性研究

论文摘要

为了改良湘西黄牛,利用8个与日增重QTL紧密连锁的微卫星标记对安格斯、夏洛来、利木赞和西门塔尔牛与湘西黄牛的杂交F1代进行了杂种优势及遗传多样性分析。1.各杂交F1代牛的体重、体尺较湘西黄牛均显著提高(P＜0.05),其中以西门塔尔杂交改良效果最好,杂种优势率大小依次为西本杂＞利本杂＞夏本杂＞安本杂。2.8对微卫星分别在西本杂、利本杂、安本杂和夏本杂四个杂交F1代黄牛中共检测到等位基因个数为69个、72个、67个和57个,等位基因在湘西黄牛各杂交群体中分布均匀。3.8个微卫星座位在四个杂交F1代黄牛中检测到等位基因数的范围在5～11个之间,有效等位基因数的范围在6.2952～7.3802之间。可见湘西黄牛杂交群体遗传多样性丰富,等位基因在群体中分布均匀。4.各杂交F1代平均杂合度在0.8867～0.9248之间,平均观测杂合度在0.8796～0.9125之间,说明它们的遗传变异度高,遗传多样性丰富;8个微卫星标记平均多态信息含量在0.8547～0.9024之间,均高于0.5,呈高度多态性,适合遗传多样性分析。5.聚类分析结果表明:南阳牛和郏县红牛、秦川牛和延边牛聚、西门塔尔跟夏洛来牛以及利木赞牛各聚为一类,而湘西黄牛和安格斯牛与其他品种的遗传距离都比较大,单独聚为一类。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 综述
• 1 中国黄牛的起源与分类
• 2 湘西黄牛
• 3 国外主要优良肉牛品种及改良效果
• 4 杂种优势及其预测
• 5 群体遗传多样性
• 6 分子标记技术
• 6.1 SSR-PCR标记技术
• 6.2 RAPD标记技术
• 6.3 SCAR标记技术
• 7 研究目的和意义
• 第一章 湘西黄牛杂交牛的杂种优势分析与杂交组合的筛选
• 1 前言
• 2 材料和方法
• 3 结果与分析
• 4 讨论
• 5 展望
• 6 小结
• 第二章 微卫星标记预测湘西黄牛杂交牛的杂种优势及遗传多样性
• 1 材料
• 1.1 实验材料
• 1.2 主要仪器设备
• 1.3 微卫星座位选择
• 2 方法
• 2.1 样品处理
• 2.2 模板DNA的制备
• 2.3 DNA含量及浓度的测定
• 2.4 PCR反应体系和条件
• 2.5 非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,银染
• 2.6 计算方法
• 3 结果与分析
• 3.1 DNA提取结果
• 3.2 聚丙烯酰胺凝胶电泳、银染结果
• 3.3 湘西黄牛各杂交牛的遗传多样性分析
• 3.3.1 湘西黄牛各杂交牛的等位基因及等位基因频率分析
• 3.3.2 湘西黄牛各杂交牛的特有等位基因和缺失等位基因
• 3.3.3 等位基因数和有效等位基因数
• 3.3.4 杂合度、期望杂合度、观测杂合度和多态信息含量
• 3.3.5 遗传距离分析
• 4 讨论
• 4.1 动物基因组DNA的提取
• 4.2 PCR反应条件的优化
• 4.3 非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳
• 4.4 关于群体等位基因数、有效等位基因数和遗传杂合度
• 4.5 多态信息含量（PIC）
• 4.6 群体系统发生关系分析
• 结论
• 1 主要结论
• 2 本研究的创新点
• 3 本研究不足之处
• 参考文献
• 致谢
• 作者简历
• 读研期间发表论文