白桦ISSR和AFLP遗传图谱构建

论文摘要

白桦(Betula platyphylla)为我国东北与内蒙古地区的先锋树种,是非常优良的短周期阔叶纸浆用材树种。纤维长度是影响纸张品质的主要因素之一,为了加速长纤维白桦纸浆材新品种选育进程,本文进行了以下研究。以150个来自长纤维白桦×短纤维白桦的F1个体为作图群体。利用ISSR、AFLP标记,按照拟测交的作图策略,分别构建了长纤维白桦和短纤维白桦的分子标记连锁图谱。对2个亲本和150个F1代作图群体进行随机扩增,共获得了210个多态性位点。X~2检验结果表明有186个位点符合1:1分离的拟测交分离,10个位点符合3:1分离,14个位点属偏分离位点。拟测交位点中有89个位点来自长纤维白桦,有92个位点来自短纤维白桦。长纤维中的89个连锁标记构成了12个不同的连锁群(4个以上标记),5个三联体和6个连锁对,13个为非连锁位点,连锁标记覆盖的总图距为901.3cM(centimorgan),平均图距19.4cM。而来自短纤维白桦的92个标记构成了11个连锁群(4个以上标记),4个三连体和10个连锁对,16个为非连锁位点,连锁标记覆盖的总图距为1195.2cM(centimorgan),平均图距18.1cM。该图谱的建立为进一步将两个图谱整合为一个高密度图谱及重要基因的定位奠定了基础。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 1 绪论
• 1.1 研究背景
• 1.1.1 白桦是优良的纸浆用材树种
• 1.2 白桦研究现状
• 1.2.1 白桦简介
• 1.2.2 白桦的经济价值
• 1.2.3 白桦遗传改良现状
• 1.2.4 传统的育种方法无法适应市场对优良纸浆白桦新品种的需求
• 1.2.5 白桦分子标记研究
• 1.3 分子标记的发展现状
• 1.3.1 广义遗传标记
• 1.3.2 DNA分子标记
• 1.4 林木遗传连锁图谱构建
• 1.4.1 林木遗传连锁图谱构建研究现状
• 1.4.2 林木遗传连锁图谱的应用
• 1.4.3 林木作为遗传图谱构建材料的特点
• 1.4.4 林木遗传图谱构建中存在的问题
• 1.4.5 林木遗传图谱构建发展的方向—比较基因组作图
• 1.5 本研究的目的意义及技术路线
• 1.5.1 目的意义
• 1.5.2 技术路线
• 2 实验材料与方法
• 2.1 实验材料及仪器、试剂
• 2.1.1 实验材料来源
• 2.1.2 主要仪器
• 2.1.3 主要试剂及配制
• 2.2 实验方法
• 2.2.1 白桦纤维长度的测量和研究群体的确定
• 2.2.2 白桦DNA的提取与检测
• 2.2.3 ISSR实验体系优化及引物筛选
• 2.2.4 AFLP实验体系优化及引物筛选
• 3 结果与分析
• 3.1 白桦ISSR引物的筛选及相关片段的筛选
• 3.1.1 ISSR引物的筛选
• 3.1.2 相关ISSR标记片段的筛选
• 3.2 白桦AFLP体系的建议
• 3.2.1 白桦基因组DNA的酶切体系建立
• 3.2.2 白桦AFLP连接体系建立
• 3.2.3 AFLP预扩增体系建立
• 3.2.4 白桦AFLP选择性扩增体系建立
• 3.2.5 白桦AFLP反应选择性引物的筛选
• 3.2.6 选择性扩增产物在聚丙烯酰胺凝胶上电泳后银染结果
• 3.2.7 AFLP标记片段的筛选
• 3.3 连锁图谱构建
• 3.3.1 分子标记的赋值
• 3.3.2 连锁图谱的的参数计算
• 3.3.3 连锁图谱的构建
• 3.3.4 基因组基因组长度和连锁图谱覆盖率的估算
• 4 讨论
• 4.1 影响白桦AFLP体系稳定的因素
• 4.1.1 高质量DNA获得是建立AFLP体系的前提
• 4.1.2 限制性核酸内切酶及连接酶的影响
• 4.1.3 预扩增与选择性扩增的影响因素
• 4.1.4 银染检测的影响
• 4.1.5 遗传连锁图谱的构建
• 结论
• 参考文献
• 攻读学位期间发表的学术论文