亚麻木质素和纤维素合成相关基因部分序列的克隆

论文摘要

亚麻是一种重要的韧皮纤维作物,分离和克隆了亚麻木质素合成关键酶基因和纤维素合成相关基因的部分序列,并对其进行生物信息学分析。以亚麻（Linum usitatissimum）茎杆表皮mRNA为模板,利用这些基因的同源基因保守序列设计简并引物,通过RT-PCR方法,得到如下结果:1.共获得亚麻木质素合成途径中关键酶基因新的片段序列8个。生物信息学分析结果表明,这些片段分别属于3个基因家族。其中,CCoAOMT基因片段2个（GenBank登录号为EF214740,EF214741）,4CL基因片段3个（GenBank登录号为EF214737,EF214738,EF214739）,F5H基因片段3个（GenBank登录号为EF214745,EF214746,EF214747）,推测亚麻中这几个木质素代谢关键调控酶基因存在多基因家族。2.获得了6个CesA基因片段和5个CSL基因片段。应用ClustalW和NCBI数据库对获得的基因片段进行序列分析,它们分别属于CesA基因家族和CSLD基因家族,6个CesA基因片段之间核酸和蛋白的相似性分别在67%～88%和71%～98%之间,5个CSLD基因片段之间核酸和蛋白的相似性分别在68%～83%和76%～94%之间。推测LusiCesA1与LusiCesA3,LusiCesA4与LusiCesA5及LusiCSLD1与LusiCSLD2的亲缘关系较近。这些基因片段序列的获得为进一步克隆全序列和调控亚麻木质素、纤维素发育奠定了基础。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 第一章 绪论
• 1 木质素合成途径关键酶基因的研究进展
• 1.1 木质素的组成及分布
• 1.2 木质素的生物合成途径
• 1.3 木质素合成的基因调控
• 1.4 展望
• 2 纤维素合成相关基因的研究进展
• 2.1 纤维素合成酶基因及其蛋白结构
• 2.2 纤维素合成酶类蛋白基因
• 2.3 纤维素合成酶超基因家族
• 2.4 纤维素生物合成的基因调控
• 3 本研究目的及意义
• 第二章 亚麻木质素合成途径中关键酶基因片段的克隆与序列分析
• 1 材料与方法
• 1.1 材料
• 1.1.1 材料
• 1.1.2 试剂
• 1.2 方法
• 1.2.1 亚麻总RNA的分离
• 1.2.2 引物设计与合成
• 1.2.3 RT-PCR反应体系及扩增条件
• 1.2.4 PCR产物的克隆筛选
• 1.2.5 序列分析
• 2 结果与分析
• 2.1 扩增结果
• 2.2 生物信息学分析
• 3 讨论
• 第三章 亚麻纤维素合成酶基因片段的克隆与序列分析
• 1 材料与方法
• 1.1 材料
• 1.2 方法
• 1.2.1 亚麻总RNA的提取
• 1.2.2 引物设计与合成
• 1.2.3 RT-PCR反应体系及扩增条件
• 1.2.4 PCR产物的克隆筛选
• 1.2.5 序列分析
• 2 结果与分析
• 2.1 基因片段的获得
• 2.2 同源性分析
• 3 讨论
• 第四章 总结
• 1 亚麻木质素合成途径中关键酶基因片段的获得
• 2 亚麻纤维素合成酶及其类蛋白基因部分序列的获得
• 3 今后的研究设想
• 参考文献
• 附录
• 缩写词
• 注册基因
• 致谢
• 作者简介