鳋科和锚头鳋科寄生桡足类的系统发育

论文摘要

鳋科与锚头鳋科是危害我国淡水养殖鱼类的两大主要寄生桡足类,本论文利用分子生物学的方法对鳋科和锚头鳋科的寄生鳋类进行了系统发育分析,并通过分析鳋科中华鳋属三种中华鳋与其宿主的协同进化关系,探讨中华鳋物种的形成机制。以18S、28S和18S-28S rDNA的联合片段为遗传标记研究鳋科4属共14种和锚头鳋科2属3种鳋之间的系统发育关系,支持鳋科和锚头鳋科为单系。在鳋科内部,中华鳋属与三指鳋属为单系,鳋属为复系,除了掘凿鳋和雅鲁藏布鳋的进化位置不十分明确外,所有的结果都支持将整个鳋科分为三个大类群,中华鳋属-鳋属类群为中华鳋属和鳋属的固着鳋,假鳋属-鳋属类群为假鳋属和部分鳋属的种类,三指鳋属-鳋属类群为三指鳋属和鳋属的奇异鳋。不同的是以18S rDNA为标记用最大似然法、邻接法和贝叶斯法建树的结果都支持中华鳋属-鳋属类群与假鳋属-鳋属类群的亲缘关系更近些,以28S rDNA为遗传标记支持假鳋属-鳋属类群与三指鳋属-鳋属类群的亲缘关系更近些,根据寄生桡足类的演化规律从半寄生到完全寄生状态,18S rDNA的建树结果更支持这一结论。Kishino-Hasegawa检验的结果支持将掘凿鳋和奇异鳋归为假鳋属-鳋属类群的假设,不支持将固着鳋归为假鳋属-鳋属类群的假设。在锚头鳋科内部,以28S rDNA为标记用最大似然法、邻接法和贝叶斯法建树的结果都支持狭腹鳋属为单系。以部分18S rDNA序列为遗传标记进行寄生桡足类和自由生活桡足类的系统发育研究,支持杯口水蚤目、剑水蚤目、管口水虱目、猛水蚤目和哲水蚤目为单系。经典支序分类支持管口水虱目与怪水蚤亚目先形成姊妹群,然后与杯口水蚤目聚在一起,而剑水蚤目与上述三目的亲缘关系较远些,本实验用三种建树方法所建成的树都支持杯口水蚤目和剑水蚤目的亲缘关系更近,然后与管口水虱目的种类聚在一起,说明管口水虱目、杯口水蚤目和剑水蚤目有共同的祖先。另外,分子进化分析的结果也支持锚头鳋科应归为剑水蚤目,鱼虱科应归为管口水虱目。为了探讨中华鳋的分子系统进化关系和物种形成机制,将采自鲢、鳙上的鲢

论文目录

• 中文摘要
• 英文摘要
• 缩略语表
• 第一章 寄生桡足类与系统发育
• 1. 分类地位
• 1.1 鳋科的形态特征及分类地位
• 1.2 锚头鳋科的形态特征及分类地位
• 2. 影响寄生桡足类感染和物种形成的主要因素
• 2.1 环境因素
• 2.2 宿主因素
• 3. 寄生桡足类对宿主的影响
• 4. 寄生桡足类在宿主种群的分布
• 5. 寄生虫与宿主的协同进化
• 5.1 协同进化的几种主要事件
• 5.2 研究协同进化的方法
• 5.3 寄生虫物种形成的理论与假说
• 6. 系统发育
• 6.1 基本概念
• 6.2 系统发育与分子系统学
• 6.3. DNA 标记在分子系统学中的应用
• 6.4 系统发育推断方法
• 7. 本研究的目的
• 第二章 马口鱼和宽鳍鱲鳃上发现的寄生桡足类鳋属一新种，丹江鳋（杯口水蚤目：鳋科）
• 1. 前言
• 2. 材料与方法
• 2.1 样品的收集与形态观察
• 2.2 基因组DNA 的提取
• 2.3. PCR 产物扩增与纯化
• 2.4. PCR 产物连接、转化和测序
• 2.5 序列分析
• 3. 结果
• 3.1 形态学观察及种的鉴定
• 3.2 序列特征分析
• 3.3 系统发育分析
• 4. 讨论
• 第三章 以ITS序列探讨中华鳋属种类的系统进化及物种形成机制
• 1. 前言
• 2. 材料和方法
• 2.1 样品的收集和基因组DNA 的提取
• 2.2. PCR 产物扩增与纯化
• 2.3. PCR 产物的连接、转化和测序
• 2.4 序列分析和系统发育树的构建
• 3. 结果
• 3.1 来自9种不同宿主的中华鳋ITS 序列分析
• 3.2 同一湖泊中3种中华鳋种群的ITS序列分析
• 3.3 系统发育分析
• 3.3.1 来自9种不同宿主的中华鳋系统发育分析
• 3.3.2 同一湖泊中3 种中华鳋的系统发育
• 3.3.3 中华鳋与宿主的协同进化
• 4. 讨论
• 4.1 中华鳋属的系统进化
• 4.2 中华鳋的物种形成及与其宿主的协同进化
• 第四章 鳋科（桡足亚纲：杯口水蚤目）和锚头鳋科（桡足亚纲：剑水蚤目）的系统发育及与自由生活桡足类之间的系统发育
• 1. 前言
• 2. 材料和方法
• 2.1 样品的采集与基因组DNA 的提取
• 2.2. PCR 产物的扩增、纯化及测序
• 3. 系统发育分析
• 4. 结果
• 4.1 序列变异分析
• 4.2 数据中包含的系统发育信息分析
• 4.3 以部分185rDNA序列为标记对鳋科和锚头鳋科的分析
• 4.4 以部分285rDNA序列为标记对鳋科和锚头鳋科的分析
• 4.5 以185-285rDNA 为标记对鳋科和锚头鳋科的分析
• 4.6. Kishino-Hasegawa 检验鳋属的单系性
• 4.7 以部分185 rDNA 序列为标记建立寄生桡足类和自由生活桡足类之间的系统发育关系
• 5. 讨论
• 5.1 鳋科的单系性
• 5.2 锚头鳋科的单系性
• 5.3 寄生桡足类和自由生活桡足类的系统发育关系
• 参考文献
• 攻读博士学位期间论文情况
• 致谢