韩浩园:德州驴与泌阳驴睾丸组织mRNA与microRNA表达鉴定与分析论文

韩浩园:德州驴与泌阳驴睾丸组织mRNA与microRNA表达鉴定与分析论文

本文主要研究内容

作者韩浩园,李婉涛,雷初朝(2019)在《德州驴与泌阳驴睾丸组织mRNA与microRNA表达鉴定与分析》一文中研究指出:试验旨在探究驴睾丸组织中mRNA和microRNA的表达模式,为中国地方驴的转录组研究提供遗传数据。利用RNA-Seq和生物信息学方法分析了中国地方驴睾丸组织表达基因和microRNA,并分析了泌阳驴和德州驴品种间差异表达基因及microRNA。结果表明,mRNA平均clean reads为57 837 506条,Small RNA平均clean reads为9 952 015条,分别占原始数据的96.34%和88.86%。在驴睾丸组织中共发现24 751个表达基因及1 074个表达microRNAs,其中,睾丸组织表达量较高的基因为LOC106836782、XLOC066401、HSP90AA1、TNP1和COF2,表达量最高的microRNAs为eca-miR-143、eca-miR-21、eca-miR-99a、eca-miR-148a和eca-miR-26a。对泌阳驴与德州驴睾丸组织进行差异表达分析共发现102个差异表达基因及2个差异表达microRNAs,但未富集到功能条目,说明泌阳驴和德州驴品种间差异不明显。本研究提供了驴睾丸组织mRNA及microRNA表达模式和转录组学数据,并鉴定了泌阳驴与德州驴睾丸组织的差异表达mRNA和microRNA,对驴的遗传资源研究具有一定的科学意义。

Abstract

shi yan zhi zai tan jiu lv gao wan zu zhi zhong mRNAhe microRNAde biao da mo shi ,wei zhong guo de fang lv de zhuai lu zu yan jiu di gong wei chuan shu ju 。li yong RNA-Seqhe sheng wu xin xi xue fang fa fen xi le zhong guo de fang lv gao wan zu zhi biao da ji yin he microRNA,bing fen xi le bi yang lv he de zhou lv pin chong jian cha yi biao da ji yin ji microRNA。jie guo biao ming ,mRNAping jun clean readswei 57 837 506tiao ,Small RNAping jun clean readswei 9 952 015tiao ,fen bie zhan yuan shi shu ju de 96.34%he 88.86%。zai lv gao wan zu zhi zhong gong fa xian 24 751ge biao da ji yin ji 1 074ge biao da microRNAs,ji zhong ,gao wan zu zhi biao da liang jiao gao de ji yin wei LOC106836782、XLOC066401、HSP90AA1、TNP1he COF2,biao da liang zui gao de microRNAswei eca-miR-143、eca-miR-21、eca-miR-99a、eca-miR-148ahe eca-miR-26a。dui bi yang lv yu de zhou lv gao wan zu zhi jin hang cha yi biao da fen xi gong fa xian 102ge cha yi biao da ji yin ji 2ge cha yi biao da microRNAs,dan wei fu ji dao gong neng tiao mu ,shui ming bi yang lv he de zhou lv pin chong jian cha yi bu ming xian 。ben yan jiu di gong le lv gao wan zu zhi mRNAji microRNAbiao da mo shi he zhuai lu zu xue shu ju ,bing jian ding le bi yang lv yu de zhou lv gao wan zu zhi de cha yi biao da mRNAhe microRNA,dui lv de wei chuan zi yuan yan jiu ju you yi ding de ke xue yi yi 。

论文参考文献

  • [1].藏鸡不同发育阶段腿部肌肉组织转录组及microRNA联合分析[J]. 袁茂,江明锋,徐亚欧,林亚秋,蒋小松,杨朝武,余春林,李志雄.  畜牧兽医学报.2019(12)
  • [2].标记探针法用于microRNA的多重可视化检测[J]. 孙秀伟,英娜,曲桂娟,万家余.  黑龙江畜牧兽医.2018(05)
  • [3].猪microRNA-17-92基因簇分析[J]. 柳樱子,荆晓燕,张彩霞,宋艳芳,刘娣,杨秀芹.  黑龙江畜牧兽医.2018(07)
  • [4].传染性法氏囊病病毒与microRNA(miRNA)[J]. 赵冬雪,穆卫涛,王立砺,满朝来.  中国兽医学报.2017(04)
  • [5].山羊皮肤新microRNA的挖掘[J]. 刘志红,赵蒙,于梦然,奈日乐,王志新,肖红梅,赵艳红,李金泉.  中国畜牧兽医.2015(04)
  • [6].MicroRNA与朊病毒疾病[J]. 刘志培,李忠义,孟轲音,杜鹏,徐静,万家余,韩烨.  生命科学.2013(03)
  • [7].猪背最长肌与腰大肌microRNA表达谱分析[J]. 张小丽,刘瀛锴,李明洲,蒋岸岸,帅素容.  四川农业大学学报.2013(01)
  • [8].鸡基因组pre-microRNA SNP多态性[J]. 耿立英,张传生,杜立新.  生物多样性.2009(03)
  • [9].禽流感病毒与microRNA[J]. 赵冬雪,穆卫涛,王立砺,满朝来.  中国兽医学报.2017(08)
  • [10].羊生产性状相关microRNA的研究进展[J]. 杨灵芝,巩佳昕,刘念,祁琪,王健,沈露露,房兴堂,李勇,李忠昌.  黑龙江畜牧兽医.2017(21)
  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自中国畜牧兽医的韩浩园,李婉涛,雷初朝,发表于刊物中国畜牧兽医2019年08期论文,是一篇关于睾丸论文,转录组论文,差异表达基因论文,中国畜牧兽医2019年08期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自中国畜牧兽医2019年08期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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