中华卵索线虫vasa、p68基因的克隆及其表达模式分析

中华卵索线虫vasa、p68基因的克隆及其表达模式分析

论文摘要

中华卵索线虫(Ovomermis sinensis)作为一种珍贵的昆虫天敌资源,在农林和蔬菜等害虫生物防治方面具有很好的应用前景。该类索科线虫的性别分化较为特殊,其寄生期的营养竞争压力决定线虫雌性性别的分化,即当寄生期幼线虫在昆虫体内的感染强度越低、每条线虫在血淋巴中获得的营养越多,越有可能发育成雌虫,反之则为雄虫。近年来,由于环境的破坏以及农药和化肥的滥用,外加索科线虫资源有限,这类生防资源正面临濒临消失的危险。国内外有关学者试图利用体外培养等方法解决现存问题,但未获成功,究其原因主要在于体外培养的线虫性别未能分化成熟,因而探讨索科线虫性别分化的机理成为本研究领域的重点。该领域研究的突破不仅具有非常重要的理论意义,而且具有潜在的应用价值,将为中华卵索线虫大量体外培养获得成功提供科学依据,并促使其尽快用于生产实际。DEAD-box家族作为一个ATP依赖RNA解旋酶家族,包含有四个亚家族成员,对生物体的生殖发育、器官分化以及细胞增殖等多个方面都具有重要作用。本实验室的前期工作已成功获得了这一家族的laf-1基因,并对其mRNA在中华卵索线虫不同发育时期的表达进行了检测,发现其在中华卵索线虫性腺发育的重要时期高水平表达,而其他时期的表达量都相对较低,由此推测这一基因在线虫的生殖腺发育中发挥作用。此外,利用荧光定量PCR的实验方法检测中华卵索线虫不同组织部位laf-1的表达,发现这一基因的转录本在多处组织部位都有表达,其功能可能较为广泛。同时获得的Tra-1基因,研究发现这一基因转录本在雌性成虫中表达量明显高于其他时期,推测其在雌虫生殖腺发育中具有重要作用。中华卵索线虫存在复杂的性别分化机理,对分子机理的深入探讨需要更多相关基因的研究支持。DEAD-box家族中的其他基因,如vasa、p68基因在从酵母到人类很多物种中都得到了相关研究。其中vasa基因常作为生殖细胞的分子标记用于原始生殖细胞的发生、迁移及发展等与生殖相关的研究;p68基因的转录本在很多物种的不同组织中都广泛检测到表达信号,这一基因的表达对生物体的生长发育同样起着非常重要的作用。而DEAD-box家族中的vasa、p68等基因在中华卵索线虫体内是否存在,这些基因在索科线虫中是否也像其他物种一样与生殖腺的发育相关联,这些基因在中华卵索线虫的哪些组织部位表达,表达是否具有特异性。为回答以上这些问题,本文在已有工作基础上进行了以下研究。一、采用RACE以及RT-PCR,获得了中华卵索线虫vasa基因,长度为3053bp,其中开放阅读框(ORF)2439bp,编码813个氨基酸。RT-PCR结果显示,vasa mRNA在中华卵索线虫的精巢、卵巢中特异性表达,而在其他部位,如头、尾、体壁均未检测到vasa的表达信号。vasa基因的转录本只在线虫的雌雄生殖腺中表达这一结果表明该基因与其生殖腺的功能相关,在线虫的精巢、卵巢发育过程中起发挥作用。二、运用实时荧光定量PCR,检测vasa mRNA在线虫发育不同期的表达。结果表明,vasa mRNA在胚胎时期表达量较高,在精巢和卵巢增殖的初期表达量逐渐增高,且在线虫从宿主体内脱离第5天达最高值(P<0.05)。随着性腺发育的逐渐成熟,其表达量减少。vasa mRNA早期胚胎发育过程中的表达显示,在中华卵索线虫胚胎发育早期都可以检测到vasa的转录信号,且相对表达量整体呈现先上升后下降的趋势。推测其为母源性基因,母源因子在个体胚胎发育中起了至关重要的作用。在线虫性腺发生的过程中,这一基因的转录信号最为强烈,在从宿主体内脱出之后,转录本显示出先上升之后下降的表达趋势,推测vasa与性腺的发生和分化相关联。三、利用RACE技术获得的中华卵索线虫p68(Ddx5)基因全长为2123bp,推测的氨基酸序列具有典型的DEXDc和HELICc结构域。四、运用RT-PCR方法,检测p68在中华卵索线虫不同组织部位,结果显示p68在线虫的不同部位都有表达,并且精巢、卵巢中的表达量较其他部位更为强烈。据报道,在鼠的雄性生殖细胞中P68表达水平很高,金鱼的p68基因在卵子及精子发生过程中发挥重要作用。因此推测该基因与生殖腺功能相关,同时还参与其他多种生理功能。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 1 前言
  • 1.1 DEAD-box家族基因研究进展
  • 1.1.1 秀丽线虫DEAD-box家族基因
  • 1.1.2 果蝇DEAD-box家族基因
  • 1.1.3 其他昆虫DEAD-box家族基因
  • 1.1.4 扁形动物DEAD-box家族基因
  • 1.1.5 鱼类DEAD-box家族基因
  • 1.2 中华卵索线虫性别分化研究进展
  • 1.2.1 中华卵索线虫生殖系形态发育研究
  • 1.2.2 中华卵索线虫各发育时期化学物质含量变化研究
  • 1.2.3 中华卵索线虫性别分化分子机理研究
  • 1.3 本研究的立题必要性
  • 2 材料与方法
  • 2.1 实验材料
  • 2.1.1 实验动物的获得
  • 2.1.2 棉铃虫饲料配制
  • 2.1.3 实验材料的收集
  • 2.2 菌株与载体
  • 2.3 主要试剂与工具酶
  • 2.4 引物序列
  • 2.5 主要仪器设备
  • 2.6 实验方法
  • 2.6.1 总RNA的提取
  • 2.6.2 RNA质量的检测
  • 2.6.3 中华卵索线虫不同部位总RNA的提取
  • 2.6.4 DNase Ⅰ消化线虫各发育期总RNA
  • 2.6.5 cDNA第一链的合成
  • 2.6.6 RT-PCR扩增基因片段
  • 2.6.7 PCR产物的纯化
  • 2.6.8 载体连接
  • 2.6.9 DH5α菌株感受态细胞制备
  • 2.6.10 转化与筛选
  • 2.6.11 Real Time PCR检测相对表达量
  • 2.6.12 中华卵索线虫不同部位基因表达的检测
  • 2.6.13 RACE技术扩增基因全长
  • 2.6.14 序列分析
  • 3 结果与分析
  • 3.1 中华卵索线虫总RNA的提取
  • 3.2 中华卵索线虫vasa基因cDNA克隆及其序列分析
  • 3.2.1 中华卵索线虫vasa基因保守片段的获得
  • 3.2.2 中华卵索线虫vasa基因保守片段结果
  • 3.2.3 中华卵索线虫vasa基因cDNA全长的获得
  • 3.2.4 中华卵索线虫vasa基因cDNA全长序列
  • 3.2.5 中华卵索线虫vasa基因氨基酸序列比对
  • 3.2.6 中华卵索线虫vasa基因系统进化树构建
  • 3.2.7 中华卵索线虫vasa基因mRNA在不同部位的表达
  • 3.2.8 Os-vasa mRNA在线虫发育不同时期的表达
  • 3.2.9 Os-vasa mRNA早期胚胎发育过程中的表达
  • 3.3 中华卵索线虫p68基因cDNA克隆及其序列分析
  • 3.3.1 中华卵索线虫p68基因保守片段的获得
  • 3.3.2 中华卵索线虫p68基因保守片段结果
  • 3.3.3 中华卵索线虫p68基因cDNA全长的获得
  • 3.3.4 中华卵索线虫p68基因cDNA全长序列
  • 3.3.5 中华卵索线虫p68基因氨基酸序列比对
  • 3.3.6 中华卵索线虫p68基因系统进化树构建
  • 3.3.7 中华卵索线虫p68基因mRNA在不同部位的表达
  • 4 讨论
  • 4.1 中华卵索线虫vasa基因的序列分析
  • 4.2 中华卵索线虫vasa基因的表达与功能
  • 4.3 中华卵索线虫p68基因的序列分析
  • 4.4 中华卵索线虫p68基因的表达与功能
  • 4.5 小结与展望
  • 参考文献
  • 攻读硕士学位期间论文发表情况
  • 致谢
  • 相关论文文献

    • [1].抗P68抗体检测在类风湿关节炎患者血清中的意义[J]. 宁夏医学杂志 2009(12)
    • [2].RNA解旋酶p68在真皮多能干细胞增殖调控中的作用[J]. 第三军医大学学报 2010(08)
    • [3].RNA解旋酶Ddx5(p68)和Ddx17(p72)的特点和功能[J]. 生理科学进展 2012(04)

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