玉米ae基因的分子标记及辅助选择研究

玉米ae基因的分子标记及辅助选择研究

论文摘要

玉米(Zea mays L.)是世界上重要的粮食、饲料与工业原料作物。玉米作为工业原料最主要的成份是淀粉,其中所含的直链淀粉在工业上用途很广。但普通玉米直链淀粉所占比重很低,限制了玉米中直链淀粉的应用。因此,开展高直链淀粉玉米育种,对发展高直链淀粉的生产和加工具有重要的意义。由于控制玉米直链淀粉含量的ae基因为单隐性基因,因此运用分子标记辅助选择的方法对后代进行快速选择,可以提高育种效率,加快育种进程。本文根据发表在GeneBank上的玉米淀粉分支酶基因(ae)序列,筛选分子标记,建立ae基因分子标记技术,并应用于高直链淀粉玉米回交后代的辅助选择,结果表明:1.根据NCBI上公布的玉米淀粉分支酶基因(ae)序列设计引物,分别以高直链淀粉玉米ae-1和普通玉米鲁原92基因组为模板,扩增了ae基因的大部分序列,经测序并通过序列比对分析表明,高直链淀粉玉米和普通玉米在所测序列部分具有较高的同源性,除在3处有3-4bp连续碱基的缺失外,其余均为SNP和单碱基的插入/缺失。2.在上述差异处分别设计引物,经过筛选,选择在基因第9和第10外显子之间一个4bp indel处设计的引物作为标记引物。在含有ae基因的玉米材料中能够扩增出一条496bp的特异性条带,称之为ae496标记。利用该标记对14种高直链淀粉玉米自交系和24种普通玉米自交系材料进行检测,高直链淀粉玉米自交系基因组中均能扩增出ae496条带,而普通玉米自交系中则全部扩增不出该条带。因此该标记可作为ae基因的显性分子标记。3.用ae496标记对高直链淀粉玉米自交系和普通玉米自交系三个组合的F1代、F2代、BC1F1代进行检测。结果表明该显性分子标记符合孟德尔遗传规律。4.通过高直链淀粉自交系与普通玉米自交系杂交组合F2代籽粒直链淀粉含量和标记的分析,发现直链淀粉含量在32.1%以上的玉米籽粒均能扩增出ae496条带,而扩增不出ae496条带的玉米籽粒的直链淀粉含量均在25.8%以下。可以看出ae显性分子标记与籽粒直链淀粉含量之间存在相关性,通过分子标ae496可辅助选择ae基因获得高直链淀粉性状。5.通过对BC1F1、BC2F1代分子标记辅助选择,分析其自交和回交后代的选择效果,结果显示通过标记辅助选择其后代可获得ae基因,其回交一代和回交二代分子标记辅助选择ae基因的效率较非标记选择分别高53.3%和73.3%,表明利用分子标记在回交后代中选择ae基因可显著提高选择效率。

论文目录

  • 中文摘要
  • Abstract
  • 目录
  • 插图与附表清单
  • 1 文献综述
  • 1.1 淀粉的分类及性质
  • 1.2 淀粉的用途
  • 1.3 玉米淀粉生物合成途径
  • 1.4 淀粉合成过程中的关键酶
  • 1.4.1 AGP合成酶
  • 1.4.2 淀粉合成酶(Starch synthase,SS)
  • 1.4.3 淀粉分支酶(Starch branching enzyme,SBE)
  • 1.4.4 淀粉去分支酶(Starch debranching enzyme,DBE)
  • 1.5 国内外高直链淀粉玉米研究现状
  • 1.6 玉米直链淀粉含量测定方法
  • 1.7 分子标记技术及其研究进展
  • 1.8 分子标记技术的应用
  • 1.8.1 分子遗传图谱的构建和基因定位
  • 1.8.2 遗传多样性与种质鉴定
  • 1.8.3 分子标记辅助选择
  • 2 引言
  • 2.1 本研究的目的与意义
  • 2.2 本研究的内容、目标
  • 2.2.1 研究内容
  • 2.2.2 研究目标
  • 2.3 本研究采用的技术路线
  • 3 材料与方法
  • 3.1 材料
  • 3.1.1 试验材料
  • 3.1.2 仪器设备和试剂
  • 3.2 方法
  • 3.2.1 玉米的田间栽培情况与取材
  • 3.2.2 玉米基因组DNA提取及其质量检测
  • 3.2.3 引物设计及ae基因结构基因部分序列的扩增
  • 3.2.4 PCR扩增片段的回收纯化
  • 3.2.5 回收产物与T-Vector的连接与转化
  • 3.2.6 重组子的鉴定
  • 3.2.7 序列比对分析
  • 3.2.8 根据差异部分设计引物
  • 3.2.9 半粒种子直链淀粉含量快速测定
  • 3.2.10 PCR结果的统计分析方法
  • 4 结果与分析
  • 4.1 玉米ae基因的克隆及序列分析
  • 4.1.1 玉米基因组提取
  • 4.1.2 PCR扩增结果
  • 4.1.3 序列的比对分析
  • 4.2 ae基因分子标记
  • 4.2.1 ae基因分子标记筛选
  • 4.2.2 38个玉米品种的ae显性分子标记验证
  • 4.2.3 玉米直链淀粉含量的测定
  • 4.2.4 ae显性分子标记的遗传分离
  • 2代ae基因显性分子标记与直链淀粉含量的关系'>4.2.5 F2代ae基因显性分子标记与直链淀粉含量的关系
  • 4.2.6 ae基因分子标记辅助选择
  • 4.2.7 ae基因分子标记在回交后代中选择效率分析
  • 5 讨论
  • 5.1 关于玉米基因组的提取
  • 5.2 关于标记辅助选择(MAS)
  • 5.3 关于ae基因分子标记体系的建立
  • 5.4 关于ae基因分子标记的验证
  • 6 结论
  • 参考文献
  • 致谢
  • 作者简介
  • 相关论文文献

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