论文摘要
目的：构建重度主动脉瓣狭窄所致左室心肌肥厚的全基因组表达谱，筛选重度主动脉瓣狭窄所致左室心肌肥厚相关靶基因，并揭示它们在该综合征发生发展过程中可能参与的致病机制。方法：采用4张人类全基因组微阵列HG U133 Plus 2．0GeneChip，构建重度主动脉瓣狭窄所致左室肥厚患者组（实验组）与正常对照组的左室心肌基因表达谱。运用GeneSpring软件筛选出两组间差异表达显著的基因或表达序列标签（ESTs），作为重度主动脉瓣狭窄左室肥厚的相关靶基因，然后采用实时定量逆转录多聚酶链反应（Real-TimePCR）对其中2个靶基因进行验证。结果：质量控制显示，微阵列实验所使用的两组左室心肌样本纯化后cRNA产物合格。4张全基因组微阵列经杂交与扫描后，使用基因芯片操作软件GCOS对其进行数据分析，获取基因表达谱的原始数据。将原始数据导入生物信息学分析软件GeneSpring，校正后，我们在两两比较的基础上进行分析。在此过程中，我们确定P值＜0.01并且差异表达倍数（FC，Fold Change）大于2，并且在四张微阵列间两两对比中，表达一致上调或下调的探针集所代表的基因或EST为我们研究的目标差异表达基因或EST。这样的探针集共有145个，代表着144个基因或EST。其中，50个基因在实验组相对于对照组中表达明显上调，30个个基因显著下调，我们确定这80个基因为重度主动脉瓣狭窄左室肥厚心肌的靶基因。应用Real-Time PCR技术检测COLlAl与JARID2这两个靶基因在实验组与正常对照组样本中的相对表达丰度。结果显示，实验组左室心肌内，JARID2明显下调至对照组的0.36倍，COLlAl基因则上调为3.39倍，这与基因微阵列实验结果非常吻合。两者的一致性说明微阵列检测结果可靠。结论：应用全基因组微阵列进行高通量并行性分析，本研究在国际上首次筛选出80个重度主动脉瓣狭窄左室肥厚心肌相关靶基因。其中，相对于正常对照，在重度主动脉瓣狭窄左室肥厚心肌患者的左室心肌内表达上调的有COL1A1、NPPB、IGFBP2等50个基因，表达下调的有JARID2、FOS、CORIN等30个基因。全基因组表达谱的研究有助于认识该综合征的发病机制，对以上相关靶基因的深入研究，有助于揭示该综合征发病学上的遗传标志及其分子机制。
论文目录
相关论文文献
标签：重度主动脉瓣狭窄论文; 左室肥厚论文; 基因微阵列论文;