论文题目: 中国大、中型驴种遗传多样性分析及其生长激素基因序列的测定
论文类型: 博士论文
论文专业: 动物遗传育种与繁殖
作者: 朱文进
导师: 郭传甲
关键词: 微卫星,遗传多样性,遗传结构,系统发育,生长激素,基因
文献来源: 山西农业大学
发表年度: 2005
论文摘要: 中国是世界著名的养驴大国,驴产资源丰富,生态类型多样,但其种质特性和品种间遗传关系研究报道很少,特别是在分子水平上的相关研究。本研究以中国大、中型驴种为研究对象,分析了29对微卫星在这些品种中的遗传变异及这些品种的群体遗传结构;并测定和分析了驴的生长激素基因序列。 一、利用马基因组中筛选出的29对微卫星分析中国大、中型驴种的群体间和群体内遗传变异,并探讨了29对微卫星在中国大、中型驴的遗传变异,结果表明: 1.本研究采用马的基因组中42对微卫星对中国大、中型驴8个品种的基因组进行扩增,其中29对扩出了清晰的条带,且产生了丰富的多态性,可用于驴的遗传多样性分析。 2.29对微卫星对8个中国大、中型驴种遗传多样性分析表明,每个座位检测到的等位基因数为5～14个;每个群体检测到的等位基因数为2～13个,在8个品种中检测到的等位基因数为261个,其中有9个私有等位基因;微卫星基因座NVHEQ18为中度多态(0.335),其余全为高度多态,并且有20个微卫星PIC均大于0.7,可用于遗传连锁分析;每个微卫星座位的平均有效等位基因数为1.66～5.67个;等位基因丰度为4.681～9.985个;平均多态信息含量为0.335～0.818;总体杂合度(H_t)为0.384～0.849;种群内平均杂合度(H_s)为0.359～0.843;平均观察杂合度(H_o)为0.111～0.548;LEX003平均等位基因数和基因丰度最大,TKY321最小;PIC、Ht和Hs值为UCDEQ505最大,NVHEQ18最小。在8个驴品种中,晋南驴具有最高的多态信息含量和平均杂合度,德州驴具有最高的有效等位基因数;淮阳驴具有最低的多态信息含量、平均杂合度和有效等位基因数。 3.群体遗传结构分析表明,绝大多数种群在各基因座上的基因型偏离Hardy-Weinberg平衡。连锁不平衡检验表明,除个别种群的个别微卫星基因座组合外,位于同一条染色体上的7组微卫星,在整个群体中除HMS7和ASB41处于连锁不平衡外,其余已经确定在同一染色体上的微卫星座位均处于连锁平衡状态;而在不同染色体上的基因也存在连锁不平衡。在TPM模型下,根据Wilcoxon符号-秩两尾检验表明,
论文目录:
摘要
前言
第一章 文献综述
1 有关我国驴品种资源的几个问题
1.1 我国驴的起源与分布
1.2 我国马、驴的遗传资源问题
1.3 中国地方驴种的价值及开发利用
2 微卫星标记与群体遗传多样性评估
2.1 微卫星的结构、特性
2.2 微卫星DNA的功能
2.3 微卫星进化模型
2.4 群体遗传多样性的分析方法
3 系统树的构建
3.1 系统树的概念与分类
3.2 系统树的构建方法
4 哺乳动物生长激素基因研究进展
4.1 生长激素
4.2 生长激素的基因结构特征
第二章 中国大、中型驴种遗传多样性的微卫星分析
1 材料与方法
1.1 材料
1.2 仪器与试剂
1.3 溶液的配制
1.4 试验方法
1.5 微卫星基因型的判型
1.6 遗传分析方法
1.7 分析工具软件及功能网站
2 结果与分析
2.1 DNA的提取结果
2.2 PCR扩增结果
2.3 部分微卫星聚丙烯凝胶电泳检测结果
2.4 微卫星基因座的多态性和群体遗传结构的分析
3.讨论
3.1 微卫星的影子带与其判型的准确性
3.2 关于相近畜种微卫星的应用及微卫星的PCR产物的凝胶电泳
3.3 关于微卫星的多态性
3.4 关于群体的遗传多样性
3.5 关于群体的遗传平衡检验
3.6 关于群体的遗传分化
3.7 关于相关度
3.8 关于迁移率
3.9 关于群体的遗传距离和聚类分析
4 结论
第三章 驴的生长激素基因序列测定
1 材料与方法
1.1 仪器与试剂
1.2 试验方法
1.3 分析工具软件及功能网站
2 结果与分析
2.1 基因组DNA提取
2.2 PCR扩增结果
2.3 测序结果
2.4 驴GH基因拼接结果
3 讨论
3.1 DNA的提取
3.2 影响PCR扩增的因素
3.3 测序结果与GenBank中不同物种GH基因的同源性比较
4 结论
参考文献
附件1 (表2-7～2-35)
附件2 (表2-42)
附件3 (附图1—4)
Abstract
致谢
发布时间: 2005-08-31
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