王东:基于银耳转录组测序的多糖代谢途径分析论文

王东:基于银耳转录组测序的多糖代谢途径分析论文

本文主要研究内容

作者王东,牛蓓,宋君,赵树海,雷绍荣,郭灵安,张富丽,刘文娟,常丽娟,赵黎明(2019)在《基于银耳转录组测序的多糖代谢途径分析》一文中研究指出:【目的】对银耳进行转录组测序分析,分析多糖生物合成途径和挖掘关键功能基因。【方法】采用Illumina Hiseq 2500测序平台对银耳菌丝体进行测序,组装得到unigene序列,并与公共数据库进行对比分析和注释,挖掘果糖和甘露糖代谢通路相关基因。【结果】本研究共得到4.72 Gb raw data,拼接后获得17 008条unigene序列,N50为2073 bp;注释结果表明,76.47%序列能够注释到Uniprot公共数据库,注释到GO分类和KEGG通路的unigene分别为10 152和5671条。进一步分析银耳果糖和甘露糖代谢途径相关基因,挖掘得到74条unigene;其中编码L-iditol 2-dehydrogenase的unigene最多,其次是butanol dehydrogenase。【结论】基于转录组测序数据解析及预测,为研究银耳多糖和其它产物的生物合成途径及分子机制提供了数据支持,也为银耳品质的形成提供理论依据。

Abstract

【mu de 】dui yin er jin hang zhuai lu zu ce xu fen xi ,fen xi duo tang sheng wu ge cheng tu jing he wa jue guan jian gong neng ji yin 。【fang fa 】cai yong Illumina Hiseq 2500ce xu ping tai dui yin er jun si ti jin hang ce xu ,zu zhuang de dao unigenexu lie ,bing yu gong gong shu ju ku jin hang dui bi fen xi he zhu shi ,wa jue guo tang he gan lou tang dai xie tong lu xiang guan ji yin 。【jie guo 】ben yan jiu gong de dao 4.72 Gb raw data,pin jie hou huo de 17 008tiao unigenexu lie ,N50wei 2073 bp;zhu shi jie guo biao ming ,76.47%xu lie neng gou zhu shi dao Uniprotgong gong shu ju ku ,zhu shi dao GOfen lei he KEGGtong lu de unigenefen bie wei 10 152he 5671tiao 。jin yi bu fen xi yin er guo tang he gan lou tang dai xie tu jing xiang guan ji yin ,wa jue de dao 74tiao unigene;ji zhong bian ma L-iditol 2-dehydrogenasede unigenezui duo ,ji ci shi butanol dehydrogenase。【jie lun 】ji yu zhuai lu zu ce xu shu ju jie xi ji yu ce ,wei yan jiu yin er duo tang he ji ta chan wu de sheng wu ge cheng tu jing ji fen zi ji zhi di gong le shu ju zhi chi ,ye wei yin er pin zhi de xing cheng di gong li lun yi ju 。

论文参考文献

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自西南农业学报的王东,牛蓓,宋君,赵树海,雷绍荣,郭灵安,张富丽,刘文娟,常丽娟,赵黎明,发表于刊物西南农业学报2019年06期论文,是一篇关于银耳论文,转录组论文,果糖和甘露糖代谢途径论文,西南农业学报2019年06期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自西南农业学报2019年06期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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