郑知临:茶树种子发育过程的转录组分析论文

郑知临:茶树种子发育过程的转录组分析论文

本文主要研究内容

作者郑知临,曹红利,王鹏杰,陈丹,叶乃兴(2019)在《茶树种子发育过程的转录组分析》一文中研究指出:该研究以‘铁观音’茶树品种的种子为试验材料,采用转录组测序技术分析种子发育的3个时期(幼果期、膨大期、成熟期)的表达差异,探究茶树种子油脂代谢的分子机制。结果表明:(1)经转录组测序、组装后共获得30 940 581个clean reads,经数据合并拼接最终得到36 951条非冗余Unigene序列,其中28 476个Unigene可得到功能注释;在转录本中能够被注释到GO分类的Unigene有11 201条(30.3%),KEGG分析发现共有17 172个基因参与了127个代谢通路。(2)经KEGG通路筛选出14条与脂肪酸代谢相关的通路,且随着茶籽的发育,大部分脂肪酸调控途径相关基因呈下调趋势,其中上调基因数最多的有α-亚麻酸代谢途径和脂肪酸降解途径(有17个基因表达量上调),下调基因数最多的是甘油磷脂代谢途径(有58个基因表达量下调);在茶籽发育幼果期α-亚麻酸代谢途径中表达量上调的基因数超过表达量下调的基因数。(3)研究发现茶籽脂肪酸合成相关的基因涉及14个脂类调控途径,共409条差异基因;随着茶树种子发育到成熟期,上调的差异表达基因数量在减少,下调的差异表达基因数量增加,其中α-亚麻酸途径中的基因PLA2G16、DAD1、pldA、FabF、FabI表达量上调显著,随后表达量下调。(4)qRT-PCR检测结果表明,7个茶树FAD和1个ACP差异表达基因的水平与转录组测序结果基本一致;随着茶籽的发育,基因CsFAD7和Δ6-CsFAD从幼果期、果实膨大期至果实成熟期都为差异下调表达,CsFAD2、CsFAD6和Δ7-CsFAD为差异上调表达,CsFAD8、Δ8-CsFAD和CsACP在幼果期至果实膨大期差异上调表达,在果实膨大期至果实成熟期差异下调表达。

Abstract

gai yan jiu yi ‘tie guan yin ’cha shu pin chong de chong zi wei shi yan cai liao ,cai yong zhuai lu zu ce xu ji shu fen xi chong zi fa yo de 3ge shi ji (you guo ji 、peng da ji 、cheng shou ji )de biao da cha yi ,tan jiu cha shu chong zi you zhi dai xie de fen zi ji zhi 。jie guo biao ming :(1)jing zhuai lu zu ce xu 、zu zhuang hou gong huo de 30 940 581ge clean reads,jing shu ju ge bing pin jie zui zhong de dao 36 951tiao fei rong yu Unigenexu lie ,ji zhong 28 476ge Unigeneke de dao gong neng zhu shi ;zai zhuai lu ben zhong neng gou bei zhu shi dao GOfen lei de Unigeneyou 11 201tiao (30.3%),KEGGfen xi fa xian gong you 17 172ge ji yin can yu le 127ge dai xie tong lu 。(2)jing KEGGtong lu shai shua chu 14tiao yu zhi fang suan dai xie xiang guan de tong lu ,ju sui zhao cha zi de fa yo ,da bu fen zhi fang suan diao kong tu jing xiang guan ji yin cheng xia diao qu shi ,ji zhong shang diao ji yin shu zui duo de you α-ya ma suan dai xie tu jing he zhi fang suan jiang jie tu jing (you 17ge ji yin biao da liang shang diao ),xia diao ji yin shu zui duo de shi gan you lin zhi dai xie tu jing (you 58ge ji yin biao da liang xia diao );zai cha zi fa yo you guo ji α-ya ma suan dai xie tu jing zhong biao da liang shang diao de ji yin shu chao guo biao da liang xia diao de ji yin shu 。(3)yan jiu fa xian cha zi zhi fang suan ge cheng xiang guan de ji yin she ji 14ge zhi lei diao kong tu jing ,gong 409tiao cha yi ji yin ;sui zhao cha shu chong zi fa yo dao cheng shou ji ,shang diao de cha yi biao da ji yin shu liang zai jian shao ,xia diao de cha yi biao da ji yin shu liang zeng jia ,ji zhong α-ya ma suan tu jing zhong de ji yin PLA2G16、DAD1、pldA、FabF、FabIbiao da liang shang diao xian zhe ,sui hou biao da liang xia diao 。(4)qRT-PCRjian ce jie guo biao ming ,7ge cha shu FADhe 1ge ACPcha yi biao da ji yin de shui ping yu zhuai lu zu ce xu jie guo ji ben yi zhi ;sui zhao cha zi de fa yo ,ji yin CsFAD7he Δ6-CsFADcong you guo ji 、guo shi peng da ji zhi guo shi cheng shou ji dou wei cha yi xia diao biao da ,CsFAD2、CsFAD6he Δ7-CsFADwei cha yi shang diao biao da ,CsFAD8、Δ8-CsFADhe CsACPzai you guo ji zhi guo shi peng da ji cha yi shang diao biao da ,zai guo shi peng da ji zhi guo shi cheng shou ji cha yi xia diao biao da 。

论文参考文献

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自西北植物学报的郑知临,曹红利,王鹏杰,陈丹,叶乃兴,发表于刊物西北植物学报2019年09期论文,是一篇关于茶树论文,种子发育论文,转录组论文,代谢通路论文,西北植物学报2019年09期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自西北植物学报2019年09期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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