杨柳:基于选择清除分析鉴定影响枣果实大小的基因论文

杨柳:基于选择清除分析鉴定影响枣果实大小的基因论文

本文主要研究内容

作者杨柳,周鹤莹,薄文浩,李颖岳,庞晓明(2019)在《基于选择清除分析鉴定影响枣果实大小的基因》一文中研究指出:【目的】通过全基因组水平上比较大果型和小果型两种类型枣品种间遗传多样性水平,检测基因组的选择清除区域,以期鉴定影响枣果实大小的潜在相关基因,为解析枣果实大小差异形成的分子机制奠定基础。【方法】本研究通过利用12个大果类型枣品种和25个小果类型枣品种群体的简化基因组测序,获得SNP标记后进行主成分和遗传多样性分析,解析枣品种的群体遗传关系;同时,基于遗传分化系数(Fst)和核苷酸多态性(π)进行选择信号检测,进一步对受选择区域所包含的基因进行基因功能及通路的生物信息学分析,并对其中与细胞周期调节以及激素相关的基因在‘桐柏大枣’和酸枣果实中的相对表达量进行了比较分析。【结果】共获得130 077个高质量的SNPs,大果群体的遗传多样性(π:0.32)低于小果群体(π:0.33),大果和小果群体分别检测到83和149个受选择基因。通过基因的功能注释和富集分析,我们确定了6个参与细胞周期或激素合成调控途径的候选基因(LOC107404981、LOC107406728、LOC107424132、LOC107426306、LOC107418232、LOC107432595)。qRT-PCR检测发现,LOC107424132、LOC107426306、LOC107418232、LOC107432595表达量在花后75天增加,候选基因LOC107404981、LOC107406728的表达量在花后45天和75天显著增加。进一步分析发现这些候选基因在枣品种和酸枣之间存在差异表达。【结论】结果表明LOC107404981、LOC107406728基因可能与枣果实大小的分子调控有关,为进一步揭示该基因的调控机制奠定了基础。

Abstract

【mu de 】tong guo quan ji yin zu shui ping shang bi jiao da guo xing he xiao guo xing liang chong lei xing zao pin chong jian wei chuan duo yang xing shui ping ,jian ce ji yin zu de shua ze qing chu ou yu ,yi ji jian ding ying xiang zao guo shi da xiao de qian zai xiang guan ji yin ,wei jie xi zao guo shi da xiao cha yi xing cheng de fen zi ji zhi dian ding ji chu 。【fang fa 】ben yan jiu tong guo li yong 12ge da guo lei xing zao pin chong he 25ge xiao guo lei xing zao pin chong qun ti de jian hua ji yin zu ce xu ,huo de SNPbiao ji hou jin hang zhu cheng fen he wei chuan duo yang xing fen xi ,jie xi zao pin chong de qun ti wei chuan guan ji ;tong shi ,ji yu wei chuan fen hua ji shu (Fst)he he gan suan duo tai xing (π)jin hang shua ze xin hao jian ce ,jin yi bu dui shou shua ze ou yu suo bao han de ji yin jin hang ji yin gong neng ji tong lu de sheng wu xin xi xue fen xi ,bing dui ji zhong yu xi bao zhou ji diao jie yi ji ji su xiang guan de ji yin zai ‘tong bai da zao ’he suan zao guo shi zhong de xiang dui biao da liang jin hang le bi jiao fen xi 。【jie guo 】gong huo de 130 077ge gao zhi liang de SNPs,da guo qun ti de wei chuan duo yang xing (π:0.32)di yu xiao guo qun ti (π:0.33),da guo he xiao guo qun ti fen bie jian ce dao 83he 149ge shou shua ze ji yin 。tong guo ji yin de gong neng zhu shi he fu ji fen xi ,wo men que ding le 6ge can yu xi bao zhou ji huo ji su ge cheng diao kong tu jing de hou shua ji yin (LOC107404981、LOC107406728、LOC107424132、LOC107426306、LOC107418232、LOC107432595)。qRT-PCRjian ce fa xian ,LOC107424132、LOC107426306、LOC107418232、LOC107432595biao da liang zai hua hou 75tian zeng jia ,hou shua ji yin LOC107404981、LOC107406728de biao da liang zai hua hou 45tian he 75tian xian zhe zeng jia 。jin yi bu fen xi fa xian zhe xie hou shua ji yin zai zao pin chong he suan zao zhi jian cun zai cha yi biao da 。【jie lun 】jie guo biao ming LOC107404981、LOC107406728ji yin ke neng yu zao guo shi da xiao de fen zi diao kong you guan ,wei jin yi bu jie shi gai ji yin de diao kong ji zhi dian ding le ji chu 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自北京林业大学学报的杨柳,周鹤莹,薄文浩,李颖岳,庞晓明,发表于刊物北京林业大学学报2019年10期论文,是一篇关于选择清除论文,果实大小论文,北京林业大学学报2019年10期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自北京林业大学学报2019年10期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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