中国狼蛛科（Lycosidae）常见属种16S rRNA序列及其分子系统发育研究

论文摘要

作者首次采用DNA测序方法对我国狼蛛科（Lycosidae）常见的4亚科（Hippasinae, Lycosinae, Pardosinae, Wadicosinae）6属（Hippasa, Pirata, Atctosa, Trochosa, Pardosa, Wadicosa）26种和漏斗蛛科（Agelenidae）中的缘漏斗蛛（Agelena limbata）的线粒体16S rRNA部分序列进行了测定;并以北美豹蛛属中两个种（Pardosa milvina, Pardosa takahashii）和实验中测定的缘漏斗蛛的16S rRNA部分序列做为外类群;用Mega软件的UPGMA法和Phylip软件中NJ、MP、ML法构建分子系统树。获得如下实验结果: 1.采用自行设计的引物1:（5’-AGCCGCTTTTGTGCTAAGGTA-3’）和引物2:（5’-TAGAAGATAGAAACCGACCTG-3’）进行PCR扩增和测序,电泳后得到400-450bp之间的条带。 2.获得狼蛛科26个种和漏斗蛛科1个种的16S rRNA实验样品,测序后16S rRNA基因部分序列长度为:340bp到360bp,其平均碱基组成为:T:36.1%;C:12.2%;A:39.0%;G:12.8%;与北美豹蛛属的碱基含量相类似,T、A的含量高于C、G含量。 3.对狼蛛科和漏斗蛛科27个种的16S rRNA序列进行比对后,共检出133个碱基存在变异,其中有90个简约信息位点。说明16S rRNA序列是保守序列,适用于物种的系统发育研究。 4.应用Mega软件、Phylip软件以自测的26种狼蛛、1种漏斗蛛和他测的2种北美豹蛛的16S rRNA序列为材料,共构建出四种方法的分子系统树。由于所依据的计算原理不同,因而使所构建的树的拓扑结构有所不同。最后采用Phylip软件中CONSENSE程序,估算一致性,得出最优分子系统树。 分子系统树结果表明:豹蛛属的17种（含自测的15种;他测的2种）首先连接在一个最近的近祖先接点上,然后该接点与娲蛛属内2种组成一小分支连接在一起;另一方面獾蛛属内4个种优先聚在一个近祖点上后,

论文目录

• 中文摘要
• 英文摘要
• 1 引言
• 1.1 前言
• 1.2 系统发育与分子系统学研究的理论基础及方法
• 1.2.1 系统发育的概念及目标
• 1.2.2 分子系统学研究的理论基础
• 1.2.3 分子系统学常用的分析方法
• 1.3 用于蜘蛛分子系统学研究的主要分子标记技术及基因
• 1.3.1 进化的动力——基因突变
• 1.3.2 主要的分子标记技术原理及应用
• 1.3.3 用于蜘蛛分子系统学研究的主要基因
• 1.4 狼蛛科的系统分类概况
• 2 材料与方法
• 2.1 材料来源
• 2.2 实验器材和主要试剂
• 2.3 研究方法
• 3 实验结果与分析
• 3.1 PCR扩增结果
• 3.2 序列长度和碱基组成
• 3.3 属种间相对遗传距离
• 3.4 16S rRNA基因部分序列
• 3.5 系统树
• 3.5.1 Mega软件中的UPGMA法构建的系统树
• 3.5.2 PHYLIP软件三种方法构建系统树
• 3.5.3 不同的建树方法比较
• 4 讨论与小结
• 4.1 线粒体16S rRNA基因的系统学分析软件
• 4.2 16S rRNA系统树构建的不同方法
• 4.3 狼蛛科系统发育
• 4.4 若干属分类位置的探讨
• 4.4.1 水狼蛛属（Pirata）和马蛛属（Hippasa）
• 4.4.2 獾蛛属（Trochosa）与熊蛛属（Arctosa）
• 4.4.3 豹蛛属（Pardosa）与娲蛛属（Wadicosa）
• 4.5 小结
• 参考文献
• 附录
• 致谢
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