论文题目: 先天性眼外肌纤维化家系连锁分析及KIF21A基因的突变检测
论文类型: 博士论文
论文专业: 眼科学
作者: 杨先
导师: 胡聪
关键词: 先天性眼外肌纤维化,连锁分析,基因,突变,家系
文献来源: 青岛大学
发表年度: 2005
论文摘要: 先天性眼外肌纤维化家系连锁分析及KIF21A基因的突变检测 目的:收集先天性眼外肌纤维化综合征(congenital fibrosis of the extraocular muscles,CFEOM)家系及散发病例,分析中国人CFEOM的临床表型和遗传特点。并对3个常染色体显性遗传家系(XT、YT和ZZH)进行基因连锁分析定位及候选基因KIF21A的突变检测,研究致病基因与临床表型的关系及KIF21A对中国CFEOM发病的价值。 方法:对患者及家系成员进行详细的临床检查及遗传学调查,照相法记录眼位及眼球运动,进行临床表型评估。选取分布在第12及16号染色体FEOM1及FEOM3区域的8个微卫星多态标记,利用聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)、变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染法确定基因型,进行单体型分析;用linkage软件对基因分型结果进行两点参数连锁分析;用直接测序及PCR-单链构象多态性(PCR-single strand conformation polymorphism,PCR—SSCP)的方法对家系成员进行KIF21A基因的已知突变热点—第21、20及8外显子的突变检测,确定突变的致病性,并比较基因型与表型之间的相关性。 结果:1.单体型分析发现:1)XT家系:在D12S331获得最大LOD值2.24(重组率θ=0,外显率=100%);在D12S1048,LOD=2.04,可以肯定此家系与D12S331及D12S1048紧密连锁。2) YT家系:在D12S59、D12S331及D16S3026获得最大LOD值0.28、0.28及0(θ=0,外显率=95%),与所选FEOM1及FEOM3位点均存在连锁的可能性。3) ZZH家系:在所选位点LOD均为正值,在D12S59、D16S689及D16S3026的LOD值最大均为0.56(θ=0,外显率=100%),此家系与FEOM1及FEOM3位点均存在连锁的可能性。2.在3个家系中共测出KIF21A基因第21外显子的2个杂合突变:1)在YT家系所有患者中均发现有2860C>T(R954W)的错义突变,即在2860碱基的位置C变成T;2)在XT家系所有患者中均发现有2861G>A(R954Q)的错义突变,即在2861碱基的位置G变成A,这2个突变均对应于蛋白质的茎部区域,分别导致第954氨基酸位置的第1、2个核苷酸的改变,使一个高度保守的精氨酸被谷氨酰胺、色氨酸替换。3)YT及XT家系:所有正常人中未发现此突变,对100个无血缘关系的正常人进行PCR—SSCP突变检测,可看到明显的差异,患者的SSCP为4条带,正常人SSCP为3条带,经抽样测序未发现正常人中有此2个位点的突变,证明这是一个致病突变。4)在ZZH家系所有成员中均未发现KIF2IA基因的上述3个外显子的碱基改变。3.这3个家系患者的临床表型与检测到的突变的关系:1)XT家系的R954Q突变表型与典型CFEOM1一致;2)YT家系发生了最常见的R954W
论文目录:
中文摘要
英文摘要
引言
第一章 先天性眼外肌纤维化家系的收集、保存及利用
1.1 先天性眼外肌纤维化家系资源的发现、收集
1.2 先天性眼外肌纤维化家系资料的保存
1.3 先天性眼外肌纤维化家系遗传方式的分析
1.4 先天性眼外肌纤维化表型特征的分析
1.5 先天性眼外肌纤维化家系的研究策略和方法
第二章 先天性眼外肌纤维化家系的基因定位研究
2.1 引言
2.2 研究对象
2.3 材料
2.4 方法
2.5 结果
2.6 讨论
第三章 先天性眼外肌纤维化家系候选基因KIF21A的突变筛查及检测
3.1 引言
3.2 研究对象
3.3 材料
3.4 方法
3.5 结果
3.6 讨论
结论
参考文献
综述
攻读学位期间的研究成果
附录
致谢
学位论文独创性声明、学位论文知识产权权属声明
发布时间: 2005-07-27
参考文献
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标签:先天性眼外肌纤维化论文; 连锁分析论文; 基因论文; 突变论文; 家系论文;