导读:本文包含了序列相关论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:玉米,ZmSPI1基因,序列多态性,单倍型
序列相关论文文献综述
吕莹莹,张萌,吴雪怡,张晗菡,何欢[1]（2019）在《玉米花序发育相关基因ZmSPI1的序列变异分析》一文中研究指出玉米ZmSPI1基因编码的黄素单加氧酶,是单子叶植物特有的,该基因通过参与生长素的合成过程,从而影响花序的发育。本研究在103份玉米自交系中,对该基因进行重测序,获得了全长序列1 849bp。核苷酸多态性分析发现,该基因共检测到43个变异位点,变异类型均为SNP。该基因编码区具有6个SNP位点,划分成9种编码区单倍型,均为同义突变。中性检测结果表明该基因在供试群体中没有受到明显的人工选择信号。(本文来源于《青岛农业大学学报(自然科学版)》期刊2019年04期）
刘辉,米荣升,贾海燕,张晓丽,王旭[2]（2019）在《刚地弓形虫表面抗原糖蛋白相关序列SRS47D的生物信息学分析》一文中研究指出目的预测刚地弓形虫表面抗原糖蛋白相关序列(Toxoplasma gondii surface antigen glycoprotein 1-related sequences)SRS47D的结构、修饰位点和免疫原性。方法利用在线软件ProtParam、ProtScale、SignalP分别预测SRS47D的理化参数、亲/疏水性、信号肽;利用SOPMA、ESPriit 3.0、Bcepred预测SRS47D蛋白的二级结构及表面可极性,利用COLIS、TMHMM预测其卷曲螺旋和跨膜结构域;利用KinasePhos、NetOGlyc、NetNGlyc、NetCGlyc、和NetPhos分析其修饰位点;利用SWISS-MODEL、VAST预测其叁级结构及其与SAG1叁级结构的差异,利用ABCpred和Syfpeithi预测其B、T细胞表位。结果 SRS47D蛋白含有376个氨基酸残基,分子式为C_(1745)H_(2797)N_(469)O_(587)S_(17),相对分子质量约为40×10~3,理论等电点为4.96;疏水值为71.60,总平均亲水性为-0.405。在SRS47D蛋白的二级结构中,α-螺旋、β-折迭、β-转角、无规则卷曲所占比例分别为23.14%、19.68%、2.39%和54.79%。SRS47D蛋白具有信号肽序列,无跨膜结构区,具有18个亲水区域(临界值为1.9)、8个柔性区域(临界值为2)和17个表面可及性区域(临界值为1.9)。SRS47D蛋白翻译后修饰位点中包含两个糖原合成酶激酶位点和两个O-GlcNAc糖基化位点,无N-GlcNAc和C-GlcNAc糖基化位点。与弓形虫表面抗原糖蛋白1(SAG1)蛋白叁级结构比对,SRS47D在β折叠处存在重叠。ABCpred和Syfpeith预测SRS47D蛋白有24个限制性CTL细胞表位、13个限制性Th细胞表位和10个B细胞抗原表位。结论 SRS47D蛋白含丰富的B、T细胞表位,免疫原性好,可能成为弓形虫病疫苗候选分子。(本文来源于《中国病原生物学杂志》期刊2019年10期）
张旭东,胡在凰[3]（2019）在《一种基于自相关函数的GNSS时间序列噪声提取方法》一文中研究指出对GNSS时间序列的非线性研究一直是大地测量学和地球动力学研究的方向之一,从信号本身的特性去分析和处理非平稳信号的HHT方法在提取GNSS时间序列噪声方面缺乏一种有效的分界点确定方法来进行滤波。针对该问题,本文提出了一种基于自相关函数的GNSS时间序列噪声提取方法,先通过与CMSE方法的对比分析验证了该方法的有效性,随后利用该方法提取了stjo测站的噪声数据进行分析,得出最优噪声模型为WN+FN。(本文来源于《测绘与空间地理信息》期刊2019年10期）
梁树立,崔建飞,孙开宝,薛蓉,丁平[4]（2019）在《7T-MRI及其新序列在FCD-Ⅱa相关癫痫术前评估中的应用》一文中研究指出目的局灶性皮质发育不良(Focal cortex dysplasia,FCD)是颞叶外癫痫最重要的病因之一。然而FCD-Ⅰ和大部分的FCD-Ⅱa在常规MRI上不能发现特殊改变。本研究旨探讨7T-MRI及其新序列在FCD-Ⅱa相关癫痫患者术前评估中的定位定性作用。方法前瞻性手术药物难治性癫痫并在术前3T-MRI中发现可(本文来源于《第八届CAAE国际癫痫论坛论文汇编》期刊2019-10-18）
杨慧欣,赵晨皓,雒静静,胡芳芳,张思文[5]（2019）在《2011-2018年我国登革热疫情时间序列分析及空间自相关分析》一文中研究指出目的了解2011-2018年我国登革热疫情时空分布特征,对2019年我国登革热的发病情况进行预测。方法基于中国疾病预防控制信息系统中2011-2018年我国登革热的病例数据,借助R 3.6.0软件,使用自回归积分滑动平均模型(autoregressive integrated moving average model, ARIMA)对登革热的发病趋势进行描述和预测。基于国家人口与健康科学数据共享服务平台提供的2011-2016年全国以及各省市登革热发病率、发病人数数据,采用GeoDa 1.12软件进行全局、局部空间自相关分析,确定登革热时空热点区域。结果预测2019年全年登革热发病数为14 302人。2012年(Moran's I=-0.088,P=0.037)、2013年(Moran's I=-0.121,P=0.040)和2014(Moran's I=-0.076,P=0.045)年全国登革热发病呈现全局空间负相关关系,2016年(Moran's I=0.078,P=0.048)登革热发病呈现全局空间正相关关系。局部自相关分析结果显示,登革热发病高聚集区域主要在我国东南沿海地区。结论 2019年我国登革热的流行无明显波动趋势,且疫情呈空间聚集性分布。(本文来源于《中华疾病控制杂志》期刊2019年10期）
陈名君,林俨,黄勃[6]（2019）在《根虫瘟霉和相关种的分类地位研究及其ITS核苷酸序列分析》一文中研究指出根虫瘟霉是最常见的一种虫霉,寄主广泛,世界广布。目前有学者认为该种是个复寄主的根虫瘟霉及其近缘类群总计19个菌株,进行3个靶位点(ITèU合种。S、LSU D本研究对世界不同地区和不同rDNA、RPB2)的分子系统发育学分析。结果显示,根虫瘟霉ITS长度较为保守性,介于1 321–1 324bp之间,而所研究的虫霉亚门的其他类群的长度范围较大,为556–1654bp。本研究确认根虫瘟霉是单系种,同时西虫瘟霉、矛孢虫瘟霉和英吉利虫瘟霉具有明确种的分类地位。鬼笔状虫瘟霉种应该被视为西虫瘟霉的异名。(本文来源于《菌物学报》期刊2019年10期）
许娟,石云平,苏祖祥,林茜,李小泉[7]（2019）在《白及PMM基因cDNA序列克隆及甘露糖合成相关基因的表达特性分析》一文中研究指出【目的】克隆白及磷酸甘露糖变位酶(PMM)基因(BsPMM)cDNA序列,并检测甘露糖合成相关基因的表达特性,为研究甘露糖合成相关基因的调控功能及白及多糖合成机制提供理论依据。【方法】采用RT-PCR克隆BsPMM基因cDNA序列,对其进行生物信息学分析,并采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测BsPMM和GDP-甘露糖焦磷酸化酶基因(BsGMP)在不同品种(桂及1号和桂及2号)、生育期(苗期、生长旺期和成熟期)和组织(叶片、茎、假鳞茎和根)中的表达特性,同时测定不同生育期假鳞茎的多糖和甘露糖含量。【结果】克隆获得的BsPMM基因c DNA全长1062 bp,包含一个759 bp的开放阅读框(ORF),编码252个氨基酸,该基因编码的蛋白BsPMM定位于细胞质,含一个从细胞内部到外部的跨膜螺旋区;不稳定系数为41.67,为不稳定蛋白;总平均疏水指数为-0.304,为亲水性蛋白,含植物PMM蛋白特有的4个保守结构域,属于HAD超家族成员。BsPMM蛋白与单子叶植物尤其是兰科植物铁皮石斛和蝴蝶兰PMM蛋白的亲缘关系较近,与罂粟、葡萄和芦笋等双子叶植物PMM的亲缘关系较远。BsPMM和BsGMP基因在不同品种、组织和生育期均有表达,且二者在假鳞茎中表达量显着高于其他组织(P<0.05),区别在于桂及1号在生长旺期的表达量最高,而桂及2号在苗期的表达量最高。桂及1号和桂及2号假鳞茎中甘露糖含量和多糖含量均随生育期推移呈逐渐升高的变化趋势。【结论】BsPMM和BsGMP基因表达具有时空、组织和品种特异性,可能是调控多糖合成代谢途径中的关键基因,参与白及甘露糖和多糖的合成。(本文来源于《南方农业学报》期刊2019年09期）
叶宗裕,王卫杰[8]（2019）在《基于蒙特卡罗模拟的误差序列自相关检验研究》一文中研究指出进行计量经济分析时一般都要检验模型是否存在自相关性,但目前常用的几种自相关检验方法都不同程度地存在一些问题,对此进行进一步的研究有重要意义。对于一阶自相关性检验,DW检验是最常用的方法,但其存在两个不确定区域。针对给定的解释变量,运用模拟方法,可以得到DW检验的临界值,从而克服了其存在不确定区域的缺陷。回归检验法则无可用的临界值,也可以用模拟方法计算其临界值,而且除检验功效很接近1的情形外,回归检验法的功效显着大于DW检验,可以替代DW检验。当样本量不是很大时,LM检验统计量的临界值与卡方分布的临界值差距较大,不能使用标准卡方临界值。在LM检验中,通常通过对最高阶滞后项系数进行t检验以确定自相关的阶数,但LM检验中最高阶滞后项系数的t统计量与标准t分布有较大差距,也不能用t分布临界值。(本文来源于《统计与信息论坛》期刊2019年09期）
吴林倩,谢平,吴子怡,桑燕芳,陈杰[9]（2019）在《基于相关系数的水文序列滑动周期识别方法》一文中研究指出准确进行周期识别对于合理认识水文变异规律、开展中长期水文模拟预报、水安全评价等具有重要的意义.本文通过滑动改变周期长度和初相位,构造出多组模拟周期序列,并以相关系数作为模拟周期序列与原始序列拟合精度的判别指标,选择拟合程度最好的模拟周期作为最优周期识别结果,从而提出水文序列滑动周期识别方法.理论和公式推导表明:相关系数可表征水文序列中的周期波动程度,相关系数越大,说明拟合精度越高,对应的周期变异越显着.统计试验结果显示:相比于常用的周期识别方法,文中方法的周期识别效率更高,且在各因素影响下也最具稳定性和可靠性.最后,文中方法应用于澜沧江流域21个站的年降雨量序列进行周期识别,结果显示该流域的降雨周期存在多时间尺度特征,北部和中部的降雨周期长度较短,多数在2～5 a左右,而南部的降雨周期5～10 a居多,个别站点的周期长度达到了18 a.(本文来源于《科学通报》期刊2019年24期）
刘亚辉,李佳兴,王升,王铁霖,袁杰[10]（2019）在《欧洲花楸病程相关蛋白基因Sa PR1-like的克隆及序列分析》一文中研究指出目的:探究欧洲花楸类病程相关蛋白1(Sa PR1-like)在响应生物胁迫中的功能。方法:克隆得到了Sa PR1-like基因全长序列,并对该序列进行生物信息学分析;通过实时荧光定量聚合酶链式反应(PCR)方法检测Sa PR1-like在欧洲花楸悬浮细胞响应harpin蛋白胁迫后的表达特征。结果:克隆得到的Sa PR1-like基因包含1个完整开放阅读框,编码161个氨基酸。该编码蛋白质亲水性强且稳定,具有跨膜结构和信号肽,属于分泌蛋白。氨基酸序列比对分析发现,Sa PR1-like蛋白C端具有高度保守结构域[富含半胱氨酸的分泌蛋白、抗原5和致病性相关蛋白1肽段(CAPE)],推测其在欧洲花楸响应生物胁迫中发挥作用。harpin蛋白诱导欧洲花楸悬浮细胞24 h后,Sa PR1-like基因表达量显着提高。结论:克隆得到了欧洲花楸Sa PR1-like基因,并证明其在响应生物胁迫时表达和积累,可为进一步阐释欧洲花楸响应生物胁迫机制奠定基础和提供参考。(本文来源于《中国实验方剂学杂志》期刊2019年21期）
序列相关论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的预测刚地弓形虫表面抗原糖蛋白相关序列(Toxoplasma gondii surface antigen glycoprotein 1-related sequences)SRS47D的结构、修饰位点和免疫原性。方法利用在线软件ProtParam、ProtScale、SignalP分别预测SRS47D的理化参数、亲/疏水性、信号肽;利用SOPMA、ESPriit 3.0、Bcepred预测SRS47D蛋白的二级结构及表面可极性,利用COLIS、TMHMM预测其卷曲螺旋和跨膜结构域;利用KinasePhos、NetOGlyc、NetNGlyc、NetCGlyc、和NetPhos分析其修饰位点;利用SWISS-MODEL、VAST预测其叁级结构及其与SAG1叁级结构的差异,利用ABCpred和Syfpeithi预测其B、T细胞表位。结果 SRS47D蛋白含有376个氨基酸残基,分子式为C_(1745)H_(2797)N_(469)O_(587)S_(17),相对分子质量约为40×10~3,理论等电点为4.96;疏水值为71.60,总平均亲水性为-0.405。在SRS47D蛋白的二级结构中,α-螺旋、β-折迭、β-转角、无规则卷曲所占比例分别为23.14%、19.68%、2.39%和54.79%。SRS47D蛋白具有信号肽序列,无跨膜结构区,具有18个亲水区域(临界值为1.9)、8个柔性区域(临界值为2)和17个表面可及性区域(临界值为1.9)。SRS47D蛋白翻译后修饰位点中包含两个糖原合成酶激酶位点和两个O-GlcNAc糖基化位点,无N-GlcNAc和C-GlcNAc糖基化位点。与弓形虫表面抗原糖蛋白1(SAG1)蛋白叁级结构比对,SRS47D在β折叠处存在重叠。ABCpred和Syfpeith预测SRS47D蛋白有24个限制性CTL细胞表位、13个限制性Th细胞表位和10个B细胞抗原表位。结论 SRS47D蛋白含丰富的B、T细胞表位,免疫原性好,可能成为弓形虫病疫苗候选分子。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
序列相关论文参考文献
[1].吕莹莹,张萌,吴雪怡,张晗菡,何欢.玉米花序发育相关基因ZmSPI1的序列变异分析[J].青岛农业大学学报(自然科学版).2019
[2].刘辉,米荣升,贾海燕,张晓丽,王旭.刚地弓形虫表面抗原糖蛋白相关序列SRS47D的生物信息学分析[J].中国病原生物学杂志.2019
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