本文主要研究内容
作者张浩冉,梁镇邦,吴仁协,牛素芳,柯宗宇,宿帅,韦欢,王权,孙贝(2019)在《利用SLAF-seq技术开发带鱼(Trichiurus japonicus)微卫星标记以及跨物种扩增检测》一文中研究指出:带鱼(Trichiurus japonicus)是广泛分布于东亚大陆架海域的暖温性近底层鱼类,长期位居我国单鱼种渔获量第一位。自上世纪70年代以来,持续过度捕捞和海洋环境变化导致中国近海带鱼资源基础和遗传多样性受到严重影响,但有关带鱼种群的微卫星DNA标记研究却较为缺乏,不利于该物种遗传资源评估和保护。为此,本研究采用基于高通量测序平台的SLAF-seq技术,从带鱼的195 308个SLAF标签中识别出25 704个二至六碱基重复微卫星位点。经过引物扩增验证,最终筛选出36个具有多态性的微卫星标记。各位点等位基因数4~35,均值14.47。观测杂合度0.214~1.000,期望杂合度0.456~0.979,均值分别为0.620和0.803。所有位点的多态信息含量值均大于0.25。经Bonferroni校正,21个位点符合哈迪-温伯格平衡,且各位点间不存在连锁不平衡。这21个多态性微卫星标记可为带鱼的种群遗传资源研究提供新的有效分子标记和技术支撑。Bottleneck分析结果表明,宁波近海带鱼群体未检测到近期的遗传瓶颈效应,这可能与目前东海区带鱼野生群体数量还比较庞大、遗传变异仍然较为丰富有关。跨物种扩增结果显示,分别有12、16、4和3个带鱼微卫星标记在带鱼属(Trichiurus)、沙带鱼(Lepturacanthus savala)、窄颅带鱼(Tentoriceps cristatus)及小带鱼(Eupleurogrammus muticus)中具有较好的通用性,这些微卫星标记为今后带鱼科相应属、种的系统进化关系研究提供新的分析手段和契机。
Abstract
dai yu (Trichiurus japonicus)shi an fan fen bu yu dong ya da liu jia hai yu de nuan wen xing jin de ceng yu lei ,chang ji wei ju wo guo chan yu chong yu huo liang di yi wei 。zi shang shi ji 70nian dai yi lai ,chi xu guo du bu lao he hai xiang huan jing bian hua dao zhi zhong guo jin hai dai yu zi yuan ji chu he wei chuan duo yang xing shou dao yan chong ying xiang ,dan you guan dai yu chong qun de wei wei xing DNAbiao ji yan jiu que jiao wei que fa ,bu li yu gai wu chong wei chuan zi yuan ping gu he bao hu 。wei ci ,ben yan jiu cai yong ji yu gao tong liang ce xu ping tai de SLAF-seqji shu ,cong dai yu de 195 308ge SLAFbiao qian zhong shi bie chu 25 704ge er zhi liu jian ji chong fu wei wei xing wei dian 。jing guo yin wu kuo zeng yan zheng ,zui zhong shai shua chu 36ge ju you duo tai xing de wei wei xing biao ji 。ge wei dian deng wei ji yin shu 4~35,jun zhi 14.47。guan ce za ge du 0.214~1.000,ji wang za ge du 0.456~0.979,jun zhi fen bie wei 0.620he 0.803。suo you wei dian de duo tai xin xi han liang zhi jun da yu 0.25。jing Bonferronijiao zheng ,21ge wei dian fu ge ha di -wen bai ge ping heng ,ju ge wei dian jian bu cun zai lian suo bu ping heng 。zhe 21ge duo tai xing wei wei xing biao ji ke wei dai yu de chong qun wei chuan zi yuan yan jiu di gong xin de you xiao fen zi biao ji he ji shu zhi cheng 。Bottleneckfen xi jie guo biao ming ,ning bo jin hai dai yu qun ti wei jian ce dao jin ji de wei chuan ping geng xiao ying ,zhe ke neng yu mu qian dong hai ou dai yu ye sheng qun ti shu liang hai bi jiao pang da 、wei chuan bian yi reng ran jiao wei feng fu you guan 。kua wu chong kuo zeng jie guo xian shi ,fen bie you 12、16、4he 3ge dai yu wei wei xing biao ji zai dai yu shu (Trichiurus)、sha dai yu (Lepturacanthus savala)、zhai lu dai yu (Tentoriceps cristatus)ji xiao dai yu (Eupleurogrammus muticus)zhong ju you jiao hao de tong yong xing ,zhe xie wei wei xing biao ji wei jin hou dai yu ke xiang ying shu 、chong de ji tong jin hua guan ji yan jiu di gong xin de fen xi shou duan he qi ji 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自基因组学与应用生物学的张浩冉,梁镇邦,吴仁协,牛素芳,柯宗宇,宿帅,韦欢,王权,孙贝,发表于刊物基因组学与应用生物学2019年02期论文,是一篇关于带鱼论文,微卫星标记论文,高通量测序论文,技术论文,跨物种扩增论文,基因组学与应用生物学2019年02期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自基因组学与应用生物学2019年02期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。
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